用于鉴定沪玉糯3号糯玉米的SNP分子标记及其应用制造技术

用于鉴定沪玉糯3号糯玉米的SNP分子标记及其应用，包括核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示的分子标记SNP1、核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示的分子标记SNP2、核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示的分子标记SNP3、核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示的分子标记SNP4、核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示的分子标记SNP5和/或核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示的分子标记SNP6；该SNP分子标记为简单、快速、高效准确鉴定‘沪玉糯3号’的真实性奠定技术基础，同时为‘沪玉糯3号’基于分子生物学技术的深入研究提供了序列和SNP位点信息。

SNP Molecular Markers for Identification of Waxy Maize Huyunuo 3 and Their Application

SNP molecular markers for identifying Huyunuo 3 waxy maize and their applications, including SNP1, SNP2, SNP3, SNP4, SNP4 and NO.5, which are shown in SEQ ID NO.1, SEQ ID NO.2, SEQ ID NO.3 and SEQ ID NO.4 respectively. Molecular markers such as SNP5 and/or SNP6, as shown in SEQ ID NO.6, lay a technical foundation for simple, rapid, efficient and accurate identification of the authenticity of Huyunuo 3, and provide sequence and SNP site information for in-depth study of Huyunuo 3 based on molecular biology technology.

【技术实现步骤摘要】
用于鉴定沪玉糯3号糯玉米的SNP分子标记及其应用
本专利技术属于生物鉴别
，具体涉及用于鉴定沪玉糯3号糯玉米的SNP分子标记及其应用。
技术介绍
糯玉米(ZeamaysL.var.ceratinaKulesh)是玉米属的一个亚种，富含支链淀粉、以及蛋白质、赖氨酸、色氨酸等营养物质、适口性良好，具有宝贵的应用价值和广泛的用途，是广受欢迎的食品和工业原料，具有较高的经济价值。近年来，我国种业市场迅速发展的同时，也随之出现了制售假劣种子、种子混杂及套牌侵权等违法行为，造成了种子市场的混乱，严重侵害了农民的利益，影响了我国种业的健康可持续发展。因此，加强对玉米杂交种的真实性和纯度监管显得非常必要。传统的表型鉴定工作量大，周期长，受环境影响大，且受季节限制，不利于种子营销工作的开展；而同工酶和种子贮藏蛋白鉴定多态率低，重复性差，以上方法均已无法满足玉米品种真实性鉴定的需要。随着分子生物学技术的日益成熟，利用分子生物学技术从基因组水平上对糯玉米种质资源进行基因型分析，开发可用于特异性分析的分子标记，对提高糯玉米种质资源的利用效率、发掘优异基因、促进分子标记辅助选择育种技术的应用和发展具有重本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.用于鉴定沪玉糯3号糯玉米的SNP分子标记，其包括：位于沪玉糯3号糯玉米1号染色体上核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示的分子标记SNP1、位于沪玉糯3号糯玉米3号染色体上核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示的分子标记SNP2、位于沪玉糯3号糯玉米6号染色体上核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示的分子标记SNP3、位于沪玉糯3号糯玉米8号染色体上核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示的分子标记SNP4、位于沪玉糯3号糯玉米9号染色体上核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示的分子标记SNP5和/或位于沪玉糯3号糯玉米10号染色体上核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示的分子标记SNP6。

【技术特征摘要】
1.用于鉴定沪玉糯3号糯玉米的SNP分子标记，其包括：位于沪玉糯3号糯玉米1号染色体上核苷酸序列如SEQIDNO.1所示的分子标记SNP1、位于沪玉糯3号糯玉米3号染色体上核苷酸序列如SEQIDNO.2所示的分子标记SNP2、位于沪玉糯3号糯玉米6号染色体上核苷酸序列如SEQIDNO.3所示的分子标记SNP3、位于沪玉糯3号糯玉米8号染色体上核苷酸序列如SEQIDNO.4所示的分子标记SNP4、位于沪玉糯3号糯玉米9号染色体上核苷酸序列如SEQIDNO.5所示的分子标记SNP5和/或位于沪玉糯3号糯玉米10号染色体上核苷酸序列如SEQIDNO.6所示的分子标记SNP6。2.一组用于鉴定沪玉糯3号糯玉米的特异引物对，包括分别对应于如权利要求1所述分子标记SNP1-SNP6的引物对组合1-6，每个引物对组合均含有两组引物对，具体核苷酸序列如下所示：其中，引物序列中带有下划线的碱基与分子标记SNP1-SNP6中的SNP位点相对应。3.如权利要求1所述SNP分子标记在鉴定沪玉糯3号糯玉米中的应用。4.一种利用权利要求1所述SNP分子标记进行沪玉糯3号糯玉米品种真实性鉴定的方法，包括以下步骤：1)根据权利要求1所述SNP分子标记中SNP1、SNP2、SNP3、SNP4、SNP5和SNP6的侧翼序列分别设计引物对组合1、引物对组合2、引物对组合3、引物对组合4、引物对组合5和引物对组合6，其中，每个引物对组合均含有两组引物对；2)提取待鉴定糯玉米材料的基因组DNA；3)根据步骤1)所述的引物对组合1-6分别对待鉴定材料的基因组DNA进行降落聚合酶链式扩增反应，获得扩增产物；4)扩增产物多态性鉴定对步骤3)得到的扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳分析，获得扩增产物的SNP位点指纹图谱，根据SNP位点指纹图谱进行判定：若扩增产物的SNP位点指纹图谱结...

【专利技术属性】
技术研发人员：沈雪芳，卢媛，韩晴，王义发，
申请(专利权)人：上海市农业科学院，
类型：发明
国别省市：上海,31