与棉花衣分性状显著相关的基因、SNP标记及其应用制造技术

本发明专利技术涉及棉花衣分性状分子生物学领域，特别涉及与棉花衣分性状显著相关的基因、SNP标记及其应用。与棉花衣分性状显著相关的基因，为基因Gh_D05G1124和/或Gh_D05G0313。本发明专利技术以276份陆地棉材料为材料，种植于多个环境中，采用CottonSNP63K基因芯片进行基因分型，共获得10660个高质量的SNPs，用于遗传结构分析和GWAS。结果共发现23个与衣分性状显著相关的SNPs，对应15个QTLs。另外，通过qRT‑PCR分析，确定了Gh_D05G1124和Gh_D05G0313为调控衣分性状的候选基因，并得到与衣分显著相关的SNP标记，为棉花衣分性状的研究和应用提供理论支持。

【技术实现步骤摘要】
与棉花衣分性状显著相关的基因、SNP标记及其应用
本专利技术涉及棉花衣分性状分子生物学领域，具体而言，涉及与棉花衣分性状显著相关的基因、SNP标记及其应用。
技术介绍
棉花是天然纺织纤维的主要来源，也是世界上重要的经济作物。陆地棉(GossypiumhirsutumL.)，是一种异源四倍体棉种，约占全球棉花产量的95％。提高棉花产量一直是棉花育种工作的重要目标。其中，皮棉产量是衡量棉花产量的重要指标，由单株铃数、衣分、单铃重等性状构成。众多研究发现，衣分与棉花产量之间存在显著的正相关，并且衣分也是棉花高产量育种的重要性状指标。然而，传统育种工作仅仅通过田间表型鉴定的方式对衣分性状进行改良，效率低下，假阳性高。因此，鉴定衣分性状紧密相关的分子标记和基因，通过分子育种手段针对性改良衣分性状，对棉花育种具有重要的理论和应用价值。有关研究表明，有利的遗传变异可以提高植物环境适应性和产量性状。然而，大多数植物的性状都为复杂数量性状，受多基因的微效效应控制。因此，对目标性状的基因鉴定相对来说是很困难的。连锁分析和全基因组关联分析是目前挖掘复杂性状遗传变异最常用的研究方法。棉花的衣分性状是典型复杂本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.与棉花衣分性状显著相关的基因，其特征在于，为基因Gh_D05G1124和/或Gh_D05G0313，其中，基因Gh_D05G1124的核酸序列如SEQ ID NO：1所示，基因Gh_D05G0313的核酸序列如SEQ ID NO：2所示；进一步地，与棉花衣分性状显著相关的基因为基因Gh_D05G1124的第10个外显子区域序列和/或基因Gh_D05G0313的第1个外显子区域序列。

【技术特征摘要】
1.与棉花衣分性状显著相关的基因，其特征在于，为基因Gh_D05G1124和/或Gh_D05G0313，其中，基因Gh_D05G1124的核酸序列如SEQIDNO：1所示，基因Gh_D05G0313的核酸序列如SEQIDNO：2所示；进一步地，与棉花衣分性状显著相关的基因为基因Gh_D05G1124的第10个外显子区域序列和/或基因Gh_D05G0313的第1个外显子区域序列。2.含有权利要求1所述的与棉花衣分性状显著相关的基因或其反义链的载体。3.含有权利要求2所述的载体的宿主。4.与棉花衣分性状显著相关的SNP标记，其特征在于，所述的SNP标记包括以下中的任一种或两种：位于基因Gh_D05G1124第10个外显子区域，以基因Gh_D05G1124的起始密码子计算，位于第6498碱基处，其核苷酸为G/A；位于基因Gh_D05G0313第1个外显子区域，以基因Gh_D05G0313的起始密码子计算，位于第176碱基处，其核苷酸为G/A。5.用于检测权利要求4所述的SNP标记的引物对、探针或芯片。6.一种试剂...

【专利技术属性】
技术研发人员：李威，杨代刚，宋成祥，裴小雨，刘艳改，贺昆仑，张飞，任中英，孙宽，马雄风，周晓箭，张文生，
申请(专利权)人：中国农业科学院棉花研究所，
类型：发明
国别省市：河南,41