一种用于肝癌诊断的生物标志物制造技术

本发明专利技术公开了一种与肝细胞癌相关的生物标志物，所述生物标志物为AC239809.3，本发明专利技术通过实验首次发现了AC239809.3与肝细胞癌相关，其在肝细胞癌患者中表达上调，通过检测AC239809.3的表达水平，可以判断受试者是否患有肝细胞癌。

【技术实现步骤摘要】
一种用于肝癌诊断的生物标志物
本专利技术属于生物医药领域，涉及一种用于肝癌诊断的生物标志物，具体的涉及生物标志物AC239809.3。
技术介绍
肝细胞肝癌(hepatocellularcarcinoma,HCC)是最常见的恶性肿瘤之一，具有侵袭性强、死亡率高的特点，位列癌症相关死亡原因的第二位(Esther,Cidon.Systemictreatmentofhepatocellularcarcinoma:Past,presentandfuture[J].WorldJournalofHepatology,2017,9(18):797-807.)。目前认为乙型肝炎病毒(HBV)、丙型肝炎病毒(HCV)、酒精性及非酒精性肝硬化、黄曲霉毒素、肥胖等均与肝癌的发生相关。肝癌的发病机制尚未完全明确，研究认为与基因突变、肝癌干细胞、微环境、非编码RNA、代谢异常等有关(FaraziPA,DepinhoRA.Hepatocellularenvironment.[J].NatureReviewsCancer,2006,carcinomapathogenesis:fromgenesto6(9):674-687.)。由于我国肝癌多发生于欠发达地区，使得很多患者被诊断时多已处于进展期或晚期，错过了最佳的手术时机。肝移植被认为是治疗肝癌和潜在肝疾病最有效的方法，但由于其手术费用昂贵，而且有严格的适应症，肝源相对短缺，虽然近年来肝移植技术已非常成熟，但肝癌的总体死亡率仍未有很大的改善。靶向口服化疗药物索拉菲尼被认为是晚期肝癌患者的唯一选择，但其价格昂贵，不是所有患者都能承受，而且远期疗效有限，所以中晚期肝癌患者的预后依然很差。过去的几十年中，随着科学技术的进步，肿瘤的免疫治疗、基因治疗等取得了巨大的进展，因此，深入研究肝癌细胞的基因谱及寻找新的治疗靶点至关重要。肝癌的发病是一个涉及多种调控和分子通路的复杂过程，目前尚不十分清楚。以往对肝癌发病的分子机制研究主要集中在蛋白质编码基因上，因为一直以来蛋白质被认为是各种生物学过程的中心。相比之下，RNA被认为是蛋白质合成的中间环节(mRNA)或平台(tRNA和rRNA)。然而随着近年来高通量测序技术的发展，人们逐渐认识到过去被认为是转录组“噪音”的非编码RNA，无论在数量上还是功能上都比蛋白质编码基因要丰富和重要。长链非编码RNA(longnon-codingRNA，lncRNA)是一类转录本长度超过200nt的RNA分子，由于缺少有效的开放式阅读框，不具有编码蛋白的功能。科学家们已经认识到了非编码RNA，尤其是lncRNA对于破解各种科学难题的重要意义。目前有越来越多的研究报道其具有复杂的生物学功能，lncRNA能够在表观遗传学、转录及转录后等多个水平调控基因表达，也与疾病的发展息息相关。lncRNA在多种癌症中差异表达，多个研究证实其可参与肿瘤的发生、发展、侵袭和转移的各个阶段，是肿瘤发生和进展的关键因素。目前，在乳腺癌和大肠癌的诊断中，分子标志物检测已经成为标准，是治疗过程的重要步骤。然而，目前还没有统一的肝细胞癌分子标志物标准。寻找肝细胞癌发生发展相关的lncRNA对肿瘤的诊断和治疗具有重要的意义。
技术实现思路
为了弥补现有技术的不足，本专利技术的目的在于提供一种用于肝癌诊断的生物标志物，通过检测生物标志物的表达水平，可以判断受试者是否患有肝癌，同时所述生物标志物也可以作为分子靶标应用于肝癌的个性化治疗。为了实现上述目的，本专利技术采用如下技术方案：本专利技术提供了检测AC239809.3的试剂在制备诊断肝细胞癌的产品中的应用。进一步，所述产品包括通过测序技术、核酸杂交技术、核酸扩增技术检测样本中AC239809.3的表达水平的试剂。进一步，所述试剂选自：特异性识别AC239809.3的探针；或特异性扩增AC239809.3的引物。进一步，所述特异性扩增AC239809.3的引物序列如SEQIDNO.1～2所示。本专利技术提供了一种体外检测AC239809.3表达水平的产品，所述产品包括芯片、试剂盒、核酸膜条。进一步，所述芯片包括特异性识别AC239809.3的寡核苷酸探针；所述试剂盒包括特异性扩增AC239809.3的引物，或特异性识别AC239809.3的寡核苷酸探针；所述核酸膜条包括特异性识别AC239809.3的寡核苷酸探针。进一步，所述特异性扩增AC239809.3的引物序列如SEQIDNO.1～2所示。本专利技术提供了体外检测AC239809.3表达水平的产品在制备诊断肝细胞癌的工具中的应用。本专利技术提供了AC239809.3在构建预测肝细胞癌的计算模型中的应用。本专利技术提供了AC239809.3在制备治疗肝细胞癌的药物组合物中的应用。进一步，所述药物组合物包括AC239809.3的抑制剂，所述抑制剂可以降低AC239809.3的表达水平。附图说明图1是利用QPCR检测AC239809.3基因在肝细胞癌组织中的表达情况图。具体的实施方式本专利技术通过采用高通量测序和生物信息学相结合的方法，筛选在肝细胞癌组织和相对应的癌旁组织中呈现差异表达的lncRNA，然后通过大样本进一步验证所述差异表达的lncRNA与肝细胞癌的关系，进而确定该lncRNA应用于肝细胞癌诊断和治疗的可能性。本专利技术通过实验首次发现了AC239809.3在肝癌组织中表达上调。AC239809.3基因位于人1号染色体上，ensemblID为ENSG00000227733本专利技术中的AC239809.3包括野生型、突变型或其片段。目前已经公开的AC239809.3存在18个转录本，AC239809.3-201(转录ID：ENST00000599640.5)、AC239809.3-214(转录ID：ENST00000496508.1)、AC239809.3-209(转录ID：ENST00000629702.3)、AC239809.3-211(转录ID：ENST00000464343.6)、AC239809.3-213(转录ID：ENST00000634551.1)、AC239809.3-215(转录ID：ENST00000611617.5)、AC239809.3-203(转录ID：ENST00000611286.4)、AC239809.3-218(转录ID：ENST00000616018.1)、AC239809.3-212(转录ID：ENST00000628063.2)、AC239809.3-217(转录ID：ENST00000620213.4)、AC239809.3-207(转录ID：ENST00000599387.5)、AC239809.3-206(转录ID：ENST00000596091.5)、AC239809.3-202(转录ID：ENST00000628902.1)、AC239809.3-216(转录ID：ENST00000622642.4)、AC239809.3-210(转录ID：ENST00000596220.1)、AC239809.3-208(转录ID：ENST00000611452.4)、AC239809.3-204(转录ID：ENST00000614606.4)、AC239809.3-205(转录ID：EN本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.检测AC239809.3的试剂在制备诊断肝细胞癌的产品中的应用。

【技术特征摘要】
1.检测AC239809.3的试剂在制备诊断肝细胞癌的产品中的应用。2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述产品包括通过测序技术、核酸杂交技术、核酸扩增技术检测样本中AC239809.3基因的表达水平的试剂。3.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述试剂选自：特异性识别AC239809.3的探针；或特异性扩增AC239809.3的引物。4.根据权利要求3所述的应用，其特征在于，所述特异性扩增AC239809.3的引物序列如SEQIDNO.1～2所示。5.一种体外检测AC239809.3表达水平的产品，其特征在于，所述产品包括芯片、试剂盒、核酸膜条。6....

【专利技术属性】
技术研发人员：徐晓云，陈圣雄，姚冬梅，
申请(专利权)人：河北医科大学第二医院，
类型：发明
国别省市：河北,13