The invention discloses a combination of genetic markers, an individual gene identity card and its application. Among them, the genetic marker combination includes multiple SNP loci, and multiple SNP loci are tagSNP located in different haplotype regions, MAF between 0.48 and 0.505, neighbouring SNP loci have no linkage relationship, neighbouring SNP loci are more than 1M, variation information is not A/T or C/G, and SNP is uniformly distributed in all chromosomes. The technical scheme of the present invention can form a set of simple and economical genetic marker combinations through effective combination of SNP loci, which can be used as individual DNA identity cards, and SNP loci are selected taking into account the uniformity of locus linkage, MAF, distance and variation in chromosome distribution, thus improving the accuracy of determining a gene sample.
【技术实现步骤摘要】
遗传标记组合、个体基因身份证及其应用
本专利技术涉及生物医学
,具体而言,涉及一种遗传标记组合、个体基因身份证及其应用。
技术介绍
司法鉴定中用于判定某基因样本是不是某个人的常用做法是选取人群中变异度相关较大的13~21个STR(shorttandemrepeat,短片段重复序列)进行检测。但STR分型技术存在很多问题,比如实验周期长,技术要求高,依赖于PCR扩增的原理增加了分型结果的误差,并且不易数字化。
技术实现思路
本专利技术旨在提供一种遗传标记组合、个体基因身份证及其应用,以解决现有技术中采用STR分型实验周期长的技术问题。为了实现上述目的,根据本专利技术的一个方面,提供了一种遗传标记组合。该遗传标记组合包括多个SNP位点,且多个SNP位点为位于不同单倍型区域的tagSNP、MAF在0.48到0.505之间、相邻的SNP位点无连锁关系、相邻的SNP位点距离大于1M、变异信息非A/T或C/G以及SNP均匀分布在所有染色体中。进一步地,包括如下表所示的SNP位点:rs970973rs10206850rs1531545rs12919rs1891110rs215 ...
【技术保护点】
1.一种遗传标记组合,其特征在于,包括多个SNP位点,且多个所述SNP位点为位于不同单倍型区域的tagSNP,MAF在0.48到0.505之间,相邻的所述SNP位点无连锁关系,相邻的所述SNP位点距离大于1M,变异信息非A/T或C/G以及SNP均匀分布在所有染色体中。
【技术特征摘要】
1.一种遗传标记组合,其特征在于,包括多个SNP位点,且多个所述SNP位点为位于不同单倍型区域的tagSNP,MAF在0.48到0.505之间,相邻的所述SNP位点无连锁关系,相邻的所述SNP位点距离大于1M,变异信息非A/T或C/G以及SNP均匀分布在所有染色体中。2.根据权利要求1所述的遗传标记组合,其特征在于,包括如下表所示的SNP位点:rs970973rs10206850rs1531545rs12919rs1891110rs2159132rs7278737rs1874045rs9646748rs2548612rs2301963rs1025412rs1292053rs464663rs7514102rs3732083rs2304054rs1293288rs4453265rs1026128rs4680rs1801274rs6756597rs315717rs1800392rs1852450rs1805034rs2106416rs2274064rs6765537rs1052486rs4870723rs703842rs7230112rs2228659rs7527925rs9851180rs9390459rs2294008rs495680rs8103778rs11575897rs3811445rs898500rs2236313rs1539172rs1060570rs2363956rs1109037rs1480320rs7793096rs10901333rs863980rs3745298rs935172r...
【专利技术属性】
技术研发人员:张静波,马劲枫,李孟键,王建伟,刘倩,唐宇,
申请(专利权)人:北京优迅医学检验实验室有限公司,
类型:发明
国别省市:北京,11
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