边鸡分子标记的筛选方法及其应用技术

本发明专利技术提供了一种边鸡分子标记的筛选方法及其应用，涉及遗传学领域。该边鸡分子标记的筛选方法，包括通过高通量测序检测SNP标记，计算遗传统计量分析比较边鸡群体与其他鸡种群体的遗传差异，筛选出边鸡的分子标记，缓解了目前边鸡保种效果的评价过程中缺少高效的分子生物学方法导致的边鸡遗传分化研究成本高、精确度低的技术问题，达到了高效快速筛选出用于评价边鸡保种效果的分子标记技术效果。本发明专利技术还提供了边鸡分子标记的筛选方法和筛选出的分子标记的应用，缓解了边鸡研究中缺少高效的分子生物学标记和筛选方法的技术问题。

Screening Method and Application of Molecular Markers in Bian Chicken

The invention provides a method for screening molecular markers of side chicken and its application, which relates to the field of genetics. The screening methods of molecular markers for Bianji include high-throughput sequencing for SNP markers, calculation of genetic statistics to analyze and compare genetic differences between Bianji and other chicken breeds, screening molecular markers for Bianji, alleviating the high cost and low accuracy of genetic differentiation research of Bianji caused by the lack of efficient molecular biological methods in the evaluation of conservation effect of Bianji at present. Technical problems have achieved the high efficiency and rapid screening of molecular markers for evaluating the conservation effect of side chickens. The invention also provides a screening method for molecular markers of Bianji and the application of molecular markers screened, alleviating the technical problems of lack of efficient molecular biological markers and screening methods in Bianji research.

【技术实现步骤摘要】
边鸡分子标记的筛选方法及其应用
本专利技术涉及遗传学领域，尤其是涉及一种边鸡分子标记的筛选方法及其应用。
技术介绍
我国家禽品种是几千年来自然生态环境和不同的民族文化所赋予的宝贵资源，在上千年的饲养驯化过程中，逐渐形成许多优良特性。边鸡是我国一个特殊的地方品种，具有体型大、蛋重大、肉质好、适应性强、耐粗抗寒的优良特性。原产于内蒙古自治区与山西省北部相毗连的长城内外一带，因当地人民视长城为“边墙”，所以称边鸡。近年来，随着引进品种的冲击及山区人们的外迁，边鸡品种已濒临灭绝。国家级地方鸡种基因库于2006年引入进行异地保护。为更好的了解和保护这一宝贵的品种资源，有必要利用现代先进的分子生物学方法重新认识这一品种，利用品种特异性的分子标记来评价这一品种的保护状况，而不受常规的形态学标记手段及环境因素的影响，也便于对边鸡这一宝贵的品种资源进行开发利用。单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphism，SNP)指基因组DNA序列中由单个核苷酸的突变引起的多态性。染色体DNA同一位置的每个碱基类型叫做一个等位位点。SNP是基因组中最常见的多态形式，具有很高的遗传稳定性。传本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种边鸡分子标记的筛选方法，其特征在于，所述方法包括通过高通量测序检测SNP标记，计算遗传统计量分析比较边鸡群体与其他鸡种群体的遗传差异，筛选出边鸡的分子标记。

【技术特征摘要】
1.一种边鸡分子标记的筛选方法，其特征在于，所述方法包括通过高通量测序检测SNP标记，计算遗传统计量分析比较边鸡群体与其他鸡种群体的遗传差异，筛选出边鸡的分子标记。2.根据权利要求1所述的筛选方法，其特征在于，所述的高通量测序为RAD-seq。3.根据权利要求2所述的筛选方法，其特征在于，采用ddRAD建库方式构建pair-end文库；优选地，所述的文库长度范围在300～500bp。4.根据权利要求3所述的筛选方法，其特征在于，SNP质控条件包括Q20>95％、SNPdepth>60％、所有样品检出率SNPCallrate>70％、单个样品检出率SNPCallrate>90％和MAF>0.05。5.根据权利要求1所述的筛选方法，其特征在于，...

【专利技术属性】
技术研发人员：张会永，朱静，韩威，李国辉，朱云芬，殷建玫，苏一军，盛中伟，沈海玉，
申请(专利权)人：江苏省家禽科学研究所，
类型：发明
国别省市：江苏,32