【技术实现步骤摘要】
磁珠法提取粪便微生物基因组的试剂盒及提取方法
本专利技术涉及生物
,具体涉及一种磁珠法提取粪便微生物基因组的试剂盒及提取方法。
技术介绍
人和动物肠道内存在种类复杂、数量庞大而状态相对稳定的微生物菌群,肠道中微生物的数量是机体细胞的10倍,微生物在粪便干重中占比高达60%。肠道内微生物数量及种类与机体的健康、疾病密切相关,因此研究肠道内微生物分布成为热点之一。2010年,欧盟资助“人类肠道宏基因组计划”研究人类肠道中微生物菌群,旨在研究肠道内微生物数量及种类与糖尿病,肥胖等疾病的相关性,为大众健康的日常生活调理提供建议,为患者治疗方案提供理论依据,还能预测个体的健康情况。研究发现,人类肠道微生物具有多样性,包括细菌,病毒,真核生物等,对于每个机体,肠道菌群差异性很大,即使是孪生姐妹,肠道内细菌的相似性也低于50%,病毒的相似性则更低。健康人体微生物菌群相对稳定,除新生婴儿肠道内微生物不断变化外,成年人肠道微生物在一年内基本不变,这些微生物形成一个极其复杂的微生态系统,对动物健康有着非常重要的影响。而饮食习惯,环境变化以及疾病都可能导致机体微生物菌群结构发生变 ...
【技术保护点】
1.磁珠法提取粪便微生物基因组的试剂盒,包括裂解液、杂质去除试剂、基因组吸附剂及洗脱剂,其特征在于,所述裂解液中包括如下试剂,缓冲液A:组成为25‑75mM的Tris‑HCl、20‑50mM的NaCl和100‑200mM的异硫氰酸胍的水溶液;缓冲液B:10‑20%SDS;缓冲液C:50‑100mg/mL的蛋白酶K。
【技术特征摘要】
1.磁珠法提取粪便微生物基因组的试剂盒,包括裂解液、杂质去除试剂、基因组吸附剂及洗脱剂,其特征在于,所述裂解液中包括如下试剂,缓冲液A:组成为25-75mM的Tris-HCl、20-50mM的NaCl和100-200mM的异硫氰酸胍的水溶液;缓冲液B:10-20%SDS;缓冲液C:50-100mg/mL的蛋白酶K。2.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述杂质去除试剂中包括缓冲液D:组成为100-200μM的硫酸铝铵和3-5M的醋酸钾的水溶液。3.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述基因组吸附剂中包括:缓冲液E:组成为3-6M的盐酸胍和50-100mM的Tris-HCl的水溶液;缓冲液F:50-100mg/mL的磁珠水溶液。4.根据权利要求1-3任一所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒中还包括洗涤剂,所述洗涤剂包括缓冲液G和/或缓冲液H,缓冲液G组成为200-300mM的NaCl和10-20mMTris-HCl的水溶液;缓冲液H为10-50mM的Tris-HCl。5.根据权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,所述洗脱剂为缓冲液I,缓冲液I为15-30mM的Tris-HCl,所述基因组吸附剂中包括硅羟基磁珠。6.磁珠法提取粪便微生物基因组的提取方法,其特征在于,包括以下步骤:①粪便中微生物的裂解:将粪便样本0.25-0.5g置于2mL离心管中,加入0.25-0.5g固体颗粒物、500-1000μL缓冲液A、50-100μL缓冲液B和10-20μL缓冲液C,振荡2-20min至样本混匀,得裂解混合物;所述缓冲液A组成为25-75mM的Tris-HCl、20-50mM的NaCl和100-200mM的异硫氰酸胍的水溶液;缓冲液B为10-20%SDS;缓冲液C为50-100mg/mL的蛋白酶K;②去除杂质:将裂解混合物以10000-14000rpm离心30s-3min,转移上清至新的2mL离心管,加入上清体积1/10-1/5的杂质去除试剂,混匀后置于冰上3-8min,10000-14000rpm离心2-5min,转移上清至新的2mL离心管,得一次纯化基因组溶液;③基因组吸附:向一次纯化基因组溶...
【专利技术属性】
技术研发人员:王金辉,
申请(专利权)人:天根生化科技北京有限公司,
类型:发明
国别省市:北京,11
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