适用于单分子测序的设备及对核酸分子进行测序的方法技术

本发明专利技术提供一种适用于单分子测序的设备及对核酸分子测序的方法。所述设备包括至少一个纳米井、多个核酸固定部分及多种类型的核酸片段。所述纳米井具有观察区。所述核酸固定部分设置在所述观察区中或邻近所述观察区。所述核酸片段分别被固定到所述核酸固定部分。至少一个聚合酶设置在所述观察区中。提供一种使用上述设备对核酸分子进行测序的方法。本发明专利技术适用于单分子测序的设备提供具有高通量且样本制备时间缩短的优点。

【技术实现步骤摘要】
适用于单分子测序的设备及对核酸分子进行测序的方法[相关申请的交叉参考]本申请主张在2017年6月13日提出申请的序列号为62/518,620的美国临时申请的优先权。上述专利申请全文并入本申请供参考并构成本说明书的一部分。
本专利技术涉及一种适用于测序的设备及方法，尤其涉及一种适用于单分子测序的设备及对核酸分子进行测序的方法。
技术介绍
用于单分子合成测序(sequencing-by-synthesis，SBS)的传统策略将一个聚合酶或一个模板固定在一个观察空间内的反应区内或反应区附近。目前单分子测序方法中的一种方法包括以下步骤。使要测序的核酸模板(例如DNA或RNA)形成闭环(环型模板)。然后，通过固定在可检测区内的聚合酶来捕获核酸模板，其中所述聚合酶具有链置换活性及高持续合成能力的性质。然后，经由单分子合成测序工艺将模板的序列读取若干次。在此种方法中，最终测序结果是通过有用冗余读取(redundantreads)的统计共识(statisticalconsensus)来确定。然而，所述方法需要聚合酶具有链置换活性及高持续合成能力，且一旦聚合酶丧失活性或释放核酸模板，则会终止测序。所述本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种适用于单分子测序的设备，其特征在于，包括：至少一个纳米井，其中所述至少一个纳米井具有观察区；多个核酸固定部分，设置在所述观察区中或邻近所述观察区；多种类型的核酸片段，分别被固定到所述多个核酸固定部分；以及至少一个聚合酶，设置在所述观察区中。

【技术特征摘要】
2017.06.13 US 62/518,620;2018.06.12 US 16/005,6991.一种适用于单分子测序的设备，其特征在于，包括：至少一个纳米井，其中所述至少一个纳米井具有观察区；多个核酸固定部分，设置在所述观察区中或邻近所述观察区；多种类型的核酸片段，分别被固定到所述多个核酸固定部分；以及至少一个聚合酶，设置在所述观察区中。2.根据权利要求1所述的设备，其特征在于，所述观察区的直径介于10nm到500nm范围内，且所述观察区的高度小于200nm。3.根据权利要求1所述的设备，其特征在于，所述多种类型的核酸片段是直线型核酸片段。4.根据权利要求1所述的设备，其特征在于，所述多种类型的核酸片段在长度上包括50个核苷酸到200个核苷酸。5.根据权利要求4所述的设备，其特征在于，所述至少一个聚合酶为一个聚合酶。6.根据权利要求1所述的设备，其特征在于，所述多种类型的核酸片段在长度上包括多于200个核苷酸。7.根据权利要求6所述的设备，其特征在于，所述至少一个聚合酶包括多个聚合酶，所述设备还包括位于所述观察区中的多个聚合酶固定部分，且所述多个聚合酶被固定到所述多个聚合酶固定部分。8.一种对核酸分子进行测序的方法，其特征在于，包括：(a)提供至少一个纳米井，其中所述至少一个纳米井具有观察区；(b)将多种类型的核酸片段通过多个核酸固定部分固定到所述观察区；(c)向所述至少一个纳米井中提供一个引物及多个经标记核苷酸，其中所述引物与所述多种类型的核酸片段中的一者在所述观察区中形成引物-核酸片段复合体；以及(d)通过使用聚合酶并将所述多个经标记核苷酸纳入到所述引物-核酸片段复合体中来起始所述引物-核酸片段复合体的新生链合成反应,以形成新生链；以及(e)通过检测经纳入后所述多个经标记核苷酸的序列来确定所述多种类型的核酸片段的序列。9.根据权利要求8所述的方法，其特征在于，还包括以下步骤：(f)将所述新生链离解；以及(g)重复步骤(c)到步骤(f)。10.根据权利要求8所述的方法，其特征在于，所述观察区的直径介于10nm到500nm之间，且所述观察区的高度...

【专利技术属性】
技术研发人员：邱创汎，潘诏智，蔡经纬，陈柏桦，邱建豪，
申请(专利权)人：体学生物科技股份有限公司，
类型：发明
国别省市：中国台湾,71