【技术实现步骤摘要】
一种mRNA3’末端混合建库的反转录引物及其用途
本专利技术涉及一种mRNA3’末端混合建库的反转录引物及其用途。
技术介绍
随着新一代高通量测序技术的快速发展，转录组测序(RNA-seq)已经成为研究转录组与基因表达的重要手段。然而，常规转录组研究技术主要存在以下问题：基因表达定量不准确、建库和测序价格高。为了解决上述问题，目前已经开发了mRNA3’末端测序技术，该技术提高了基因表达定量的敏感性和准确性。目前Lexogen公司的mRNA3’末端建库试剂盒最多能混合96个样本(Lexogen，https：//www.lexogen.com/quantseq-3mrna-sequencing/#quantseqworkflow)，可以进行96个样本的自动化建库，该试剂盒省去了mRNA分离的复杂操作，前期操作简单成本低，但后期96个样本需要平行独立进行建库操作，而且该产品只有96个双端Index，上机时每条Lane最多只能混合96个样本，不适合目前Novoseq测序仪一条Lane需要混合大量样本产出800G以上数据的需求，不适合大规模群体文库构建。为了进一步提高混合建...
【技术保护点】
1.一种mRNA 3’末端混合建库的反转录引物，所述反转录引物包含VN碱基。
【技术特征摘要】
1.一种mRNA3’末端混合建库的反转录引物，所述反转录引物包含VN碱基。2.根据权利要求1所述的mRNA3’末端混合建库的反转录引物，其中所述反转录引物为96个mRNA的反转录引物。3.根据权利要求1或2所述的mRNA3’末端混合建库的反转录引物，其中所述反转录引物选自下表所示的反转录引物：。4.一种mRNA3’末端混合建库的方法，所述方法包括使用权利要求1至3中的任一项所述的反转录引物对总RNA进行反转录。5.根据权利要求4所述的方法，还可包括以下步骤：将反转录完毕的96个样本混合至一个管中，然后降解模板mRNA，得到反转录的产物。6.根据权利要求4或5所述的方法，还可包括以下步骤：对反转录的产物进行纯化，并在纯化完成后加入二链合成酶进行二链合成。7.根据权利要求4至6中的任一项所述的方法，还可包括以下步骤：进行文库片段大小选择，以回收长度150-600bp的片段。8.根据权利要求4至7中的任一项所述的方法，还可包括以下步骤...
【专利技术属性】
技术研发人员：鲁非，王静，徐俊，
申请(专利权)人：中国科学院遗传与发育生物学研究所，
类型：发明
国别省市：北京,11
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