一种具有核酸洗脱功能的反转录PCR反应液和核酸提取方法技术

技术编号:19875435 阅读:124 留言:0更新日期:2018-12-22 16:53
本发明专利技术公开了一种具有核酸洗脱功能的反转录PCR反应液,其组分包括两种方案:其一包括双功能聚合酶,dNTPs,引物,探针,氯化锰或醋酸锰,Bicine/KOH,醋酸钾和甘油;其二包括耐热反转录酶mlv,dNTPs,引物,探针,KCl和Tris‑HCl;pH≥8.0。本发明专利技术配制了一种具有核酸洗脱功能的反转录PCR反应液,该反应液可耐受50‑95℃高温,采用该反转录PCR反应液替代了原经典检测方法中的PCR反应液和洗脱液,即将原PCR反应液和洗脱液合成为一个试剂‑‑‑反转录PCR反应液,同时可将洗脱步骤与后续PCR体系构建步骤合并,简化了一个步骤,该步骤的缩减对于自动化尤其是核酸POCT的实现非常关键。

【技术实现步骤摘要】
一种具有核酸洗脱功能的反转录PCR反应液和核酸提取方法
本专利技术涉及PCR扩增
,尤其是涉及一种具有核酸洗脱功能的反转录PCR反应液,本专利技术还涉及使用该反转录PCR反应液进行核酸提取的方法。
技术介绍
核酸检测过程包括核酸提取和PCR扩增检测。经典的检测步骤包括:裂解吸附,洗涤,洗脱,洗脱物加入PCR体系,加入PCR试剂,混合后进行检测。由于洗脱过程往往需要在高温(50-95℃)下进行,而高温会对反转录酶的活性造成影响,降低了反转录效果。
技术实现思路
本专利技术的目的在于提供一种具有核酸洗脱功能的反转录PCR反应液,解决了高温洗脱对反转录酶活性的影响;本专利技术同时还提供采用该反转录PCR反应液进行核酸提取的方法。为实现上述目的,本专利技术可采取下述技术方案:方案1:本专利技术所述的具有核酸洗脱功能的反转录PCR反应液,包括以下组分:2-100U双功能聚合酶,50-400μMdNTPs,50-400nM引物,20-400mM探针,2-10mM氯化锰或醋酸锰,10-100mMBicine/KOH,20-200mM醋酸钾,5-10%甘油;其pH≥8.0。方案2:本专利技术所述的具有核酸洗脱功能的反转录PCR反应液,包括以下组分:2-100U耐热反转录酶mlv,50-400μMdNTPs,50-400nM引物,20-400mM探针,10-100mMKCl,20-200mMTris-HCl;其pH≥8.0。本专利技术方案1或方案2中还可以包括PCR增强剂。本专利技术所述的一种核酸检测方法,包括磁珠法核酸提取和PCR扩增,所述磁珠法核酸提取用的洗脱液和PCR扩增用的PCR反应液合成为按方案1或方案2配制的一种试剂----反转录PCR反应液;这样即可将洗脱步骤与后续PCR体系构建步骤合并为一个步骤。本专利技术的优点在于配制了一种具有核酸洗脱功能的反转录PCR反应液,该反应液可耐受50-95℃高温,采用该反转录PCR反应液替代了原经典检测方法中的PCR反应液和洗脱液,即将原PCR反应液和洗脱液合成为一个试剂---反转录PCR反应液,同时可将洗脱步骤与后续PCR体系构建步骤合并,简化了一个步骤,该步骤的缩减对于自动化尤其是核酸POCT的实现非常关键。本专利技术将反转录酶采用耐高温的Tth酶或耐热的mlv聚合酶,解决了高温洗脱对反转录酶活性的影响。利用pH8.0以上的高pH条件和60-90℃高温实现核酸的洗脱,同时高温洗脱,促进了RNA的解链,恢复低温后,促进了引物与RNA模板的结合,更有效的提高了反转录效果。具体实施方式下面通过具体实施例对本专利技术做更加详细的说明。如无特殊说明,本专利技术中采用的方法均为本领域的常规方法,所用的检验设备或试剂均为市售产品。实施例1配制一种具有核酸洗脱功能的反转录PCR反应液(方案1,采用双功能聚合酶)其组分为:2-100U双功能聚合酶,50-400μMdNTPs,50-400nM引物,20-400mM探针,2-10mM氯化锰或醋酸锰,10-100mMBicine/KOH,20-200mM醋酸钾,5-10%甘油;反应液的pH≥8.0。也可添加一定的PCR增强剂,形式可以为一个混合物,或者由固体石蜡等相变剂分隔成的多组分仓室,在反应时,相变后几种组分会自动混合成一种试剂。实际配制时,其具体组分可为:20U商品化Tth酶,100μMdNTPs,200nM引物,50mM探针,5mM氯化锰或醋酸锰,20mMBicine/KOH,20mM醋酸钾,5%甘油,pH8.0。洗脱步骤为:吸附有模板的磁珠进入PCR反应液,60-90℃孵育1-10min,磁吸去除磁珠,洗脱和PCR体系构建完成。实施例2配制一种具有核酸洗脱功能的反转录PCR反应液(方案2,采用耐热反转录酶)其组分为:2-100U耐热反转录酶mlv,50-400μMdNTPs,50-400nM引物,20-400mM探针,10-100mMKCl,20-200mMTris-HCl;反应液的pH≥8.0。也可添加一定的PCR增强剂,形式可以为一个混合物,或者由固体石蜡等相变剂分隔成的多组分仓室,在反应时,相变后几种组分会自动混合成一种试剂。实际配制时,其具体组分可为:10U耐热反转录酶mlv,50μMdNTPs,100nM引物,25mM探针,50mMKCl,20mMTris-HCl;pH8.0。洗脱步骤为:吸附有模板的磁珠进入PCR反应液,55-60℃孵育1-10min,磁吸去除磁珠,洗脱和PCR体系构建就完成了。实施例3反转录活性的验证取提取好的HCVRNA扩增,梯度稀释3个梯度,重复检测3次。反转录PCR反应液的配方为:20U商品化Tth酶,100μMdNTPs,200nM引物,50mM探针,5mM氯化锰或醋酸锰,20mMBicine/KOH,20mM醋酸钾,5%甘油,pH8.0。标准扩增程序:60℃15min反转录;95℃2min变性;95℃10s变性,60℃30s退火延伸采集荧光,40个循环;高温验证程序:90℃5min;60℃15min反转录;95℃2min变性;95℃10s变性,60℃30s退火延伸采集荧光,40个循环;检测结果如下表1:表1如表1所示,添加高温步骤后,对反转录酶活性没有影响,同时还起到了意想不到的技术效果:引入了高温杂交步骤,引物和模板结合更充分,检测敏感度更高,表现在检测Ct值提前。实施例4洗脱效果的验证标本:取临床HCV阳性血清标本4例,高、中、低、临界浓度四个浓度水平,分别采用两种方法(常规方法和本专利技术方法)检测提取和扩增检测重复检测3次。1、常规使用的标准方法:(1)吸取200ul血清标本,加入400ul裂解液,加入20ul磁珠。(2)吸打混匀10次,室温静置5min,磁吸1min,去上清。(3)加600ul洗液,吸打混匀10次,磁吸1min,去上清。(4)重复加600ul洗液,吸打混匀5次,磁吸1min,去上清。(5)加100ul洗脱液,吸打混匀10次,90℃5min。磁吸1min。(6)取50ul上清,添加到PCR反应管。反应程序为:60℃15min反转录;95℃2min变性;95℃10s变性,60℃30s退火延伸采集荧光,40个循环;(7)添加2*RT-PCR反应液50ul,进行反转录PCR反应。注:第(5)步用的洗脱液配方为10mMTris-HCl+1mMEDTA,pH8.0。第(7)步所用的2*RT-PCR反应液配方为:20U耐热反转录酶mlv,100μMdNTPs,200nM引物,50mM探针,100mMKCl,40mMTris-HCl;pH8.0。2、本专利技术方法(简化方法):(1)吸取200ul血清标本,加入400ul裂解液,加入20ul磁珠。(2)吸打混匀10次,室温静置5min,磁吸1min,去上清。(3)加600ul洗液,吸打混匀10次,磁吸1min,去上清。(4)重复加600ul洗液,吸打混匀5次,磁吸1min,去上清。(5)加1*RT-PCR反应液(代替洗脱液)100ul,90℃5min。磁吸1min;其中的1*RT-PCR反应液的配方为:10U耐热反转录酶mlv,50μMdNTPs,100nM引物,25mM探针,50mMKCl,20mMTris-HCl;pH8.0。(6)取上清进行反转录PCR反应。反应程序为:本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种具有核酸洗脱功能的反转录PCR反应液,其特征在于:包括以下组分:2‑100U双功能聚合酶,50‑400μM dNTPs,50‑400nM引物,20‑400mM探针,2‑10mM 氯化锰或醋酸锰,10‑100mM Bicine/KOH,20‑200mM醋酸钾,5‑10%甘油;其pH≥8.0。

【技术特征摘要】
1.一种具有核酸洗脱功能的反转录PCR反应液,其特征在于:包括以下组分:2-100U双功能聚合酶,50-400μMdNTPs,50-400nM引物,20-400mM探针,2-10mM氯化锰或醋酸锰,10-100mMBicine/KOH,20-200mM醋酸钾,5-10%甘油;其pH≥8.0。2.一种具有核酸洗脱功能的反转录PCR反应液,其特征在于:包括以下组分:2-100U耐热反转录酶mlv,50-400μMdNTPs,50-...

【专利技术属性】
技术研发人员:高利飞肖李亚秦明明高歌胡伟锋杜美李振红付光宇吴学炜苗拥军
申请(专利权)人:郑州安图生物工程股份有限公司
类型:发明
国别省市:河南,41

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