痴呆相关基因的捕获探针组、试剂盒、文库构建方法和用途技术

本发明专利技术提供了一种痴呆相关基因的捕获探针组、试剂盒、文库构建方法和用途，涉及基因检测的技术领域，该捕获探针组包含了95个基因的编码区域，能针对特定的编码区域进行捕获，并进行高深度测序，使测序目标基因精准，测序成本降低。使用上述捕获探针组进行文库构建能对目标基因进行有效富集，降低样本量的要求，同时也能更好地控制测序成本。

Capture probe group, kit, library construction method and application of dementia related genes

The invention provides a method and application of capturing probes, kits and libraries for dementia-related genes, and relates to the technical field of gene detection. The capturing probes comprise 95 coding regions of genes, which can capture specific coding regions and conduct high-depth sequencing to make the target genes precise. Sequencing costs are reduced. Using these capture probes to construct library can enrich target genes effectively, reduce the requirement of sample size, and control the cost of sequencing better.

【技术实现步骤摘要】
痴呆相关基因的捕获探针组、试剂盒、文库构建方法和用途
本专利技术涉及基因检测
，尤其是涉及一种痴呆相关基因的捕获探针组、试剂盒、文库构建方法和用途。
技术介绍
痴呆是指由于神经退行性变、脑血管病变、感染、外伤、肿瘤、营养代谢障碍等多种原因引起的，以认知功能缺损为主要临床表现的一组临床综合征，多见于老年人群。除表现有定向、记忆、学习、语言理解、思维等多种认知功能损害外，多数病人还表现有行为异常，并且终将导致其工作及社会生活功能下降或丧失。痴呆的患病率高，致残、致死率高，为增龄性疾病，已成为西方发达国家老年人群中仅次于癌症、心脏病和脑卒中的第四位死因，加之其病程长，医疗和照料负担重，直接和间接医疗费用均很高(2010年全球用于痴呆的总花费达6040亿美元)，已成为老龄化社会面临的重要卫生服务问题和社会经济负担问题。我国每年新发痴呆病例约为180万；根据2010年第六次全国人口普查结果，全国登记总人口为13.4亿，其中65岁及以上人口占13.26％，根据65岁以上人群痴呆患病率(4.8％)，我国现有痴呆患者至少已达850万。测序技术可以帮助我们对痴呆相关基因有更全面的了解，而现有测序本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种痴呆相关基因的捕获探针组，其特征在于，所述捕获探针组捕获的基因和所述基因的染色体坐标信息如下表所示：

【技术特征摘要】
1.一种痴呆相关基因的捕获探针组，其特征在于，所述捕获探针组捕获的基因和所述基因的染色体坐标信息如下表所示：所述捕获探针组的设计按照如下规则：(a)探针长度为90-150bp；(b)探针设计合并相邻区域；(c)探针设计区间为目标区间向两翼扩展20bp；(d)探针参考为基因组正义链；(e)探针两翼的共有序列如SEQIDNO.1和SEQIDNO.2所示；(f)探针设计中通过比对全基因组信息确保探针特异性；(g)探针GC含量以40％-60％为标准，GC含量变化幅度偏离标准含量每增加10％，探针在该区域探针数量增加50％。(h)在基因组非捕获区域有近似序列的探针，每有一个近似序列，则该区域探针数量增加100％；所述近似序列为与探针序列的同源性至少为95％的序列。2.根据权利要求1所述的捕获探针组，其特征在于，所述捕获探针组中的探针经过标记物标记，优选为经过生物素标记。3.一种用于文库构建的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包含权利要求1或2所述的捕获探针组；优选地，所述试剂盒还包括用于富集捕获的靶序列的PCR扩增引物：所述PCR扩增引物具有如SEQIDNO.3和SEQIDNO.4所示序列。4.根据权利要求3所述的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒还包括用于多样本杂交捕获的接头，所述接头包括Adapters1、Adapters2、Adapters3和Adapters4中至少两组；接头Adapters1由Adapters1-1及Adapters1-2经退火形成；所述Adapters1-1具有如SEQIDNO.5所示序列，所述Adapters1-2具有如SEQIDNO.6所示序列；接头Adapters2由Adapters2-1及Adapters2-2经退火形成，所述Adapters2-1具有如SEQIDNO.7所示序列，所述Adapters2-2具有如SEQIDNO.8所示序列；接头Adapters3由Adapters3-1及Adapters3-2经退火形成，所述Adapters3-1具有如SEQIDNO.9所示序列，所述Adapters3-2具有如SEQIDNO.10所示序列；接头Adapters4由Adapters4-1及Adapters4-2经退火形成，所述Adapters4-1具有如SEQIDNO.11所示序列，所述Adapters4-2具有如SEQIDNO.12所示序列。5.根据权利要求3所述的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒还包括用于文库杂交前封闭的HybBlock，所述HybBlock包括如SEQIDNO.13所示...

【专利技术属性】
技术研发人员：沈璐，焦彬，李鹏飞，范嘉庚，廖鑫鑫，王伟，李佳龙，
申请(专利权)人：中南大学湘雅医院，杭州祥音生物医药科技有限公司，
类型：发明
国别省市：湖南,43