近亲交配雄性罗氏沼虾遗传多样性分析方法技术

本发明专利技术公开了近亲交配雄性罗氏沼虾遗传多样性分析方法，包括以下步骤：步骤1、采集不同性状的近亲交配雄性罗氏沼虾样品，并提取DNA；步骤2、选择微卫星标记组合，并设计特异性PCR引物组进行扩增；步骤3、评价PCR产物数，观察等位基因分型和大小；步骤4、记录每个雄虾的等位基因数A、等位基因复制数G、观察杂合度Ho、期望杂合度He、基于哈代‑温伯格平衡定律的精确偏差值P，并分析微卫星位点差异；根据种群等位基因频率参数计算基因流Nm；用对基因Nei系数法测定基因间距。本发明专利技术基于微卫星分析方法，提供了近亲交配雄性罗氏沼虾遗传多样性分析方法，非常适于研究不同的近亲雄虾组遗传结构，为罗氏沼虾优质父本。

【技术实现步骤摘要】
近亲交配雄性罗氏沼虾遗传多样性分析方法
本专利技术涉及基因工程
，尤其涉及近亲交配雄性罗氏沼虾遗传多样性分析方法。
技术介绍
罗氏沼虾(Macrobrachiumrosenbergii，DeMan1879)是一种大型淡水虾，因其较广水质变化承受幅度、易养殖、肉质嫩滑、商业价值高等特点逐渐成为我国、东南亚乃至世界重要的水产养殖品种。当前，日益增长的罗氏沼虾产量仍难以满足逐渐上升的消费和市场需求，所以需进一步突破限制罗氏沼虾产量提高的因素以大大提高产额。由于雄虾较雌性生长快、成熟个头大、养殖产出量高[1]，因此，主要是在苗种培育和养殖中解决导致性别和个体差异的限制因素。人们对罗氏沼虾遗传多样性就行了研究，如不同群体遗传多样性分析。不同形态型雄虾的产生有以下原因：(1)遗传差异、变态年龄等个体内在因素；(2)空间和资源受限等环境因素引起竞争；(3)种群地位等级、领地等种群内部社会因素。近些年来，微卫星现代分子标记技术因能解决等位酶技术不能发现的细微遗传差异而广泛用于生物育种和遗传研究，具有多态性高、共显性遗传、重复性高和易检测等优点。目前，罗氏沼虾自主或者人为的长期近亲交配导致了种质本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.近亲交配雄性罗氏沼虾遗传多样性分析方法，其特征在于，包括以下步骤：步骤1、采集不同性状的近亲交配雄性罗氏沼虾样品，并提取DNA；步骤2、选择微卫星标记组合，并设计特异性PCR引物组进行扩增；步骤3、评价PCR产物数，观察等位基因分型和大小；步骤4、记录每个雄虾的等位基因数A、等位基因复制数G、观察杂合度Ho、期望杂合度He、基于哈代‑温伯格平衡定律的精确偏差值P，并分析微卫星位点差异；根据种群等位基因频率参数计算基因流Nm；用对基因Nei系数法测定基因间距；其中，步骤2中的微卫星标记组合，包括以下微卫星标记或其核苷酸序列的互补序列：微卫星标记1、微卫星标记2、微卫星标记3、微卫星标记4、微...

【技术特征摘要】
1.近亲交配雄性罗氏沼虾遗传多样性分析方法，其特征在于，包括以下步骤：步骤1、采集不同性状的近亲交配雄性罗氏沼虾样品，并提取DNA；步骤2、选择微卫星标记组合，并设计特异性PCR引物组进行扩增；步骤3、评价PCR产物数，观察等位基因分型和大小；步骤4、记录每个雄虾的等位基因数A、等位基因复制数G、观察杂合度Ho、期望杂合度He、基于哈代-温伯格平衡定律的精确偏差值P，并分析微卫星位点差异；根据种群等位基因频率参数计算基因流Nm；用对基因Nei系数法测定基因间距；其中，步骤2中的微卫星标记组合，包括以下微卫星标记或其核苷酸序列的互补序列：微卫星标记1、微卫星标记2、微卫星标记3、微卫星标记4、微卫星标记5、微卫星标记6、微卫星标记7；其中，所述微卫星标记1的核苷酸序列如SEQIDNO.1所示；所述微卫星标记2的核苷酸序列如SEQIDNO.2所示；所述微卫星标记3的核苷酸序列如SEQIDNO.3所示；所述微卫星标记4的核苷酸序列如SEQIDNO.4所示；所述微卫星标记5的核苷酸序列如SEQIDNO.5所示；所述微卫星标记6的核苷酸序列如SEQIDNO.6所示；所述微卫星标记7的核苷酸序列如SEQIDNO.7所示。2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于：所述步骤2中的特异性...

【专利技术属性】
技术研发人员：马华威，吕敏，黄光华，杨慧赞，甘晖，卢小花，杨琼，王瑞，曾兰，杨彦豪，阮志德，卢天和，
申请(专利权)人：广西壮族自治区水产科学研究院，
类型：发明
国别省市：广西,45