一个与猪经济性状相关的SNP位点及其应用制造技术

技术编号:17770563 阅读:59 留言:0更新日期:2018-04-21 23:13
本发明专利技术涉及SNP位点,具体公开了一个与猪多个重要经济性状相关的SNP位点(Chr7:34960267)及其应用。本发明专利技术通过测定并记录杜洛克猪的多个重要经济性状,利用优化的GBS技术对3702头杜洛克猪体进行GWAS研究,得到了一个与猪多个重要经济性状(背膘厚、眼肌面积和瘦肉率)显著相关的SNP(Chr7:34960267)位点。统计该SNP位点在重测序的地方猪种(金华猪、五指山猪、陆川猪、梅山猪、荣昌猪、莱芜猪、二花脸猪、河套猪和民猪)与商品猪种(杜洛克猪、长白猪、约克夏猪和杜长大猪)中的SNP频率,发现其SNP频率分布在地方猪种和商品猪种中存在显著差异,商品猪中G为优势等位基因,地方猪中C为优势等位基因,为猪的标记辅助选择提供了科学依据。

【技术实现步骤摘要】
一个与猪经济性状相关的SNP位点及其应用
本专利技术涉及SNP位点,具体地说,涉及一个与猪多个重要经济性状相关的SNP位点及其应用。
技术介绍
我国是一个养猪大国,猪肉产量和质量的市场需求日益增加,提高猪肉产量、改善猪肉胴体质量,成为育种科学家长期以来不断探索的工作。早期的育种工作主要集中与猪的表型选择,随着基因组工作的不断推进和遗传标记的广泛开发,分子选择正逐渐成为可靠而有效的选择方法。单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphism,SNP)标记是第三代SNP位点,是指在基因组DNA序列上有单个碱基的突变而产生的一种多态性,这种突变包括单碱基的颠换、转换、插入和缺失。SNP具有量大、高频率、低突变率等优点,广泛应用于基因组分析、生物信息自动化检测、简单和复杂疾病的遗传研究、畜牧育种标记及全球种族遗传学等研究。SNP位点辅助选择育种,是在分子水平上对目标性状进行选择,可以不受环境影响,通过遗传背景选择,减少连锁累赘,从而加速育种过程及精准度。全基因组关联分析(Genome-wideassociationstudies,GWAS)是畜禽经济性状遗传改良和机理解本文档来自技高网...
一个与猪经济性状相关的SNP位点及其应用

【技术保护点】
一种与猪经济性状相关的SNP位点,其特征在于,该位点为基因组版本Ensembl Sscrofa 10.2的Chr7:34960267,该位点的等位基因为G和C,所述经济性状为背膘厚、眼肌面积和/或瘦肉率。

【技术特征摘要】
1.一种与猪经济性状相关的SNP位点,其特征在于,该位点为基因组版本EnsemblSscrofa10.2的Chr7:34960267,该位点的等位基因为G和C,所述经济性状为背膘厚、眼肌面积和/或瘦肉率。2.根据权利要求1所述的SNP位点,其特征在于,商品猪中,G为优势等位基因;地方猪中,C为优势等位基因。3.根据权利要求1或2所述的SNP位点,其特征在于,所述SNP位点位于SEQIDNO.1所示的核苷酸序列中第101位碱基。4.权利要求1~3任一项所述的SNP位点在猪的标记辅助选择育种中的应用。5.根据权利要求4所述的应用,其特征在于,包括以下步骤:(1)检测样品猪在所述SN...

【专利技术属性】
技术研发人员:胡晓湘谈成郭晓莉吴珍芳刘德武李宁
申请(专利权)人:中国农业大学
类型:发明
国别省市:北京,11

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