来曲唑疗效相关基因基因多态性检测试剂盒及检测方法技术

本发明专利技术提供了一种药物来曲唑疗效相关基因（CYP19A1）基因多态性检测试剂盒及检测方法，该试剂盒包括PCR缓冲液，特异性ARMS检测引物，质控引物。本发明专利技术还提供了一种CYP19A1基因多态性检测方法。本发明专利技术方法可以快速准确地检测CYP19A1基因多态性，具有灵敏度高，特异性强，方法简单，结果准确等特点。

Detection kit and detection method of gene gene polymorphism of letrozole

The invention provides a drug letrozole treatment related gene (CYP19A1) gene polymorphism detection kit and a detection method. The kit comprises PCR buffer, specific ARMS detection primer, and quality control primer. The invention also provides a method for detection of CYP19A1 gene polymorphism. The method can quickly and accurately detect CYP19A1 gene polymorphism with high sensitivity, high specificity, simple method and accurate results.

【技术实现步骤摘要】
来曲唑疗效相关基因基因多态性检测试剂盒及检测方法
：本专利技术涉及生物技术及医学领域，特别是涉及药物来曲唑疗效相关基因CYP19基因多态性检测试剂盒及检测方法。
技术介绍
：来曲唑为人工合成的苄三唑类衍生物，相对分子质量为285.31，化学名称为1-[双(4-氰基苯基)甲基]-1，2，4-三氮唑。基因芳香化酶P450(aromatasecytochromeP450)是催化雄激素转化为雌激素的限速酶，与乳腺癌的发病与内分泌治疗有着密切相关性；CYP19为芳香化酶编码基因，有着众多的变异位点。绝经后的乳腺癌患者内分泌治疗现多选用第三代芳香化酶抑制剂(aromataseinhibitors)—来曲唑(letrozole)，所以CYP19基因多态性与来曲唑相关性研究对于指导个体化用药有着极其重要的意义。Colomer等进行了1项评估CYP19基因多态性对来曲唑的临床疗效影响的研究，患者为激素受体阳性晚期乳腺癌患者，结果显示，与野生型基因患者相比，携带CYP19基因3'端非编码区域的突变位点(CYP19A1，161T>G)的患者对来曲唑治疗的响应率显著提高，改善疾病进展时间(TTP)显著改善。关于基因突变检测方法有很多，各国学者对此都进行了大量研究。己经报道的方法包括直接测序法、DHPLC、PCR-SSCP/RFLP、ScorpionsARMS、TaqManPCR、ME-PCR等。这些方法各有优缺点，其中在临床和科研中较为常用的方法为直接测序法以及ARMS(Amplificationrefractorymutationsystem,扩增阻滞突变系统)法。直接测序法检测能力有限，其检测灵敏度约20％左右，而且步骤复杂，整个检测过程涉及PCR-电泳-测序-测序结果的解读等一系列的步骤，费吋费力，但是该方法的优点是能够发现一些新的未知突变。ARMS方法是将分子信标(探针)与特异性的ARMS引物相结合创造出来的，ARMS引物3’端设计在突变位点，最后一个碱基与突变碱基配对，釆用无3’→5’外切酶活性的TaqDNA聚合酶，特异性的识别引物的3’末端，只有引物3’末端完全配对时，才能正常扩增，当引物3’末端发生错配时，不能有效的扩增。当引物与突变模板结合并延伸出相应的产物后，探针两端的荧光基团和淬灭基团分离而产生荧光。目前，市场上相关试剂盒包括QIAGEN公司和厦门艾德公司，价格昂贵。因此，本研究釆用ARMS技术与SYBR染料相结合的方法，研发出一种拥有完全自主知识产权并且能够快速、敏感而且简便的检测CYP19基因多态性的试剂盒。通过自己研发设计ARMS引物以及将Scorpions探针换为SYBR染料以使检测成本大大降低，这样更适合中国患者CYP19基因多态性的检测。综上所述，该检测试剂盒及检测方法是一种灵敏度高，特异性强，方法简单，结果准确的CYP19基因多态性检测方法。
技术实现思路
：本专利技术实施例的目的在于提供一种灵敏度高，特异性强，方法简单，结果准确的CYP19A1基因多态性检测试剂盒及检测方法。本专利技术实施例是这样实现的，一种CYP19A1基因多态性检测试剂盒，该试剂盒包括PCR缓冲液，特异性突变检测引物，质控引物。本专利技术还提供一种CYP19A1基因多态性检测方法，包括以下步骤步骤：(1)提供如权利要求1中所述的引物；(2)待测样品的处理和模板的提取；(3)配制荧光定量PCR反应体系；(4)利用ARMS引物区分野生型和突变型基因序列，通过SYBRGreen染料和扩增产物的杂交，检测反应体系的SYBR荧光强度来判定检测结果。SYBR为检测信号，以SYBR信号达到设定的阈值所需的的循环次数Ct值作为判断标准，Ct值小于32为阳性，Ct值大于35为阴性，Ct值介于32到35之间为弱阳性。本专利技术CYP19A1基因多态性检测试剂盒采用SYBR染料法，建立了针对人类CYP19A1基因多态性(如表1所示)的多重实时PCR检测方法。本专利技术经过大量试验，研究和分析成功筛选出能够用于快速、灵敏、有效的检测CYP19A1基因多态性的引物组合，并利用这些引物开发出具有这样的优点的用于检测CYP19A1基因多态性的方法和试剂盒。本专利技术的检测试剂盒及检测方法具有灵敏度高，特异性强，方法简单，结果准确等特点，因此本专利技术具有实质性的技术效果，便与推广。表1：CYP19A1基因多态性形式所述的特异性引物见下表2。表2：CYP19A1基因多态性的检测引物本专利技术涉及的检测人类CYP19A1基因多态性的荧光定量PCR方法不包括对待测样本的处理和模板提取的步骤，但对于来自甲醛固定石蜡包埋的样品和来自血浆的样品所获得的片段DNA依然具有与新鲜组织样本DNA相同的扩增和检测能力。本专利技术的检测试剂盒可在50ng野生型基因组DNA背景下准确检出1％的突变DNA，且针对性设计不同突变位点的特异性引物，使用荧光定量PCR进行检测，检测过程均为闭管反应，大大降低污染。附图说明：图1为本专利技术基因多态性检测试剂盒检测CYP19A1(T161G)样品的扩增曲线图。具体实施方式：以下通过特定的具体实例说明本专利技术的实施方式，本领域技术人员可由本说明书所揭露的内容轻易地了解本专利技术的其他优点与功效。本专利技术还可以通过另外不同的具体实施方式加以实施或应用，本说明书中的各项细节也可以基于不同观点与应用，在没有背离本专利技术的精神下进行各种修饰或改变。在进一步描述本专利技术具体实施方式之前，应理解，本专利技术的保护范围不局限于下述特定的具体实施方案；还应当理解，本专利技术实施例中使用的术语是为了描述特定的具体实施方案，而不是为了限制本专利技术的保护范围；在本专利技术说明书和权利要求书中，除非文中另外明确指出，单数形式“一个”、“一”和“这个”包括复数形式。当实施例给出数值范围时，应理解，除非本专利技术另有说明，每个数值范围的两个端点以及两个端点之间任何一个数值均可选用。除非另外定义，本专利技术中使用的所有技术和科学术语与本
技术人员通常理解的意义相同。除实施例中使用的具体方法、设备、材料外，根据本
的技术人员对现有技术的掌握及本专利技术的记载，还可以使用与本专利技术实施例中所述的方法、设备、材料相似或等同的现有技术的任何方法、设备和材料来实现本专利技术。实施例11.样本处理和核酸提取利用商品化的DNA提取试剂盒处理样本，具体操作参见试剂盒说明书，所提DNA需用紫外分光光度计测定浓度和纯度，其DNAOD260/OD280的值应在1.8～2.0，浓度应在5～50ng/μL之间，样本DNA质量不合格者不得用于检测，建议低于5ng/μL者重新取切片进行核酸提取，高于50ng/μL者予以适当稀释至规定的浓度范围，提取完的DNA建议立即进行检测，否则请于-20℃以下保存，保存时间不要超过6个月。试剂盒质控品使用前室温融化，涡旋振荡10秒，2000rpm离心15秒待用。2.试剂配置2.1配置说明：检测反应设置阴性质控品和阳性质控品。2.2配置过程提前30分钟将试剂取出，室温融化，涡旋振荡10秒，2000rpm离心15秒待用。确定反应数N，N＝待检样本数(n)+质控品数(2)+1。计算加到反应混合物中的各个试剂的量，计算如下表3：表3：PCR反应体系配置表。试剂PCR反应液P引物探针混合液纯化水反应液A(μL)12.5本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种CYP19A1基因多态性检测试剂盒，该试剂盒用于检测基因多态性的引物，设计的引物如下：

【技术特征摘要】
1.一种CYP19A1基因多态性检测试剂盒，该试剂盒用于检测基因多态性的引物，设计的引物如下：。2.如权利1要求所述的CYP19A1基因多态性检测试剂盒，其特征在于，所述PCR缓冲液包括3’→5’外切酶活性高保真Taq酶，1.0-5.0mM的MgCl2，1.0-5.0mM的dNTPs，即dATP，dUTP，dGTP，dCTP各1.0-5.0mM，SYBRGreenI。3.一种CYP19A1基因多态性检测方法，包括以下步骤：(1)提供如权利要求1中所述的引物；(2)待测样品的处理和模板的提取；(3)配制荧光定量PCR反应体系；(4)利用ARMS引物区分野生型和突变型基因序列，通过SYBRGreen染料和扩增产物的杂交，检测反应体系的SYBR荧光强度来...

【专利技术属性】
技术研发人员：田晓丽，
申请(专利权)人：宁波美丽人生医药生物科技发展有限公司，
类型：发明
国别省市：浙江,33