调控因子结合位点的基因组分布型绘制制造技术

技术编号:1755416 阅读:314 留言:0更新日期:2012-04-11 18:40
提供一种用于绘制调控因子结合位点分布型的方法。在基因组中定位完整基因,用于绘制基因调控区域的图谱。确定基因的最上游转录起始位点(TSS)的基因组位置。根据所确定的TSS,定义和检索基因调控区域的基因组序列。对各个检索获得的基因调控区域的DNA序列信息进行筛选,以确定推定的调控因子结合位点。绘制推定的调控因子结合位点及其基因组发生频率的分布型。(*该技术在2024年保护过期,可自由使用*)

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】
技术介绍
专利
本专利技术大体上涉及提供所有已知基因的调控因子结合位点的分布型绘制(profiling)的方法、系统和数据结构,更加特别地涉及用于确定和表征调控因子结合位点的方法、数据结构和系统,以开发针对确定的结合位点的系统分析,用于进一步开发治疗性策略。相关技术的描述改变基因表达水平已经成为解决人类疾病的一种重要和有效的方法。每种基因的表达水平受转录机制的控制,其中一些称作为转录因子(TFs)的特定蛋白质结合到基因的调控区上。依次起始转录过程。因此,相应的TFs及其在基因调控区上的结合位点在控制基因的转录水平中起重要作用。因此,在现代生物医学研究和开发的努力中,转录因子及其相关转录机制已经成为“热”点。对于每种基因来说,转录起始位点(TSS)是其mRNA开始通过RNA聚合酶II的作用从DNA转录的位置。在该过程中,基因调控区被某些调控因子联合和结合。这些已经结合的因子与其它转录蛋白一起形成转录复合物,该复合物可起始转录过程。更加特别地,该基因调控区典型地包括转录因子结合位点,所述转录因子结合位点是短的共有基因组序列。最重要的调控区之一是通常紧挨在TSS之前或者TSS侧翼的核心启本文档来自技高网...

【技术保护点】
用于绘制调控因子结合位点分布型的方法:定位完整的和最5′全长基因,用于对基因调控区作图;检索基因的调控区的基因组序列;筛选各个检索的基因调控区的DNA序列信息,以鉴定推定的调控因子结合位点;和绘制推定的调控因子结合位点分布型。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】...

【专利技术属性】
技术研发人员:张杰魏淑英莱斯利M麦克沃伊
申请(专利权)人:科根泰克股份有限公司
类型:发明
国别省市:US[美国]

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