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一种快速提取植物根际土中AM真菌环境DNA的方法技术

技术编号:1712235 阅读:482 留言:0更新日期:2012-04-11 18:40
一种快速提取植物根际土中AM真菌环境DNA的方法,包括根际土中AM真菌相关结构的收集、真菌基因组DNA的提取、用AM真菌特异性引物进行nested  PCR扩增、及扩增片段测序及测序结果分析步骤,其特征在于本方法中所用根际土AM真菌DNA由下列方法得到:    a.称取100g根际土壤样品,经湿筛倾析法收集AMF厚垣孢子及根外菌丝结构,并将其置于无菌的研钵中,用液氮冷却材料,待水份蒸发后,加入少量石英砂,充分研磨材料使之呈粉末状,然后迅速将粉末状的材料转入2ml的离心管中;    b.在装有材料的离心管中加入65℃水浴预热的2×CTAB提取液1ml,使材料完全分散在提取液中,在65℃水浴锅中温浴1小时,期间每20分钟摇匀1次;    c.将温浴的材料取出置于室温下,待冷却至室温后加入300μl等体积的苯酚-氯仿颠倒混匀,然后6500转/分钟离心20min;    d.取上清液10μl转移到另一0.5ml的离心管中,再加入300μl20%Chelex-100树脂混匀,置于99.9℃的PCR仪上煮沸15min;    e.待样品冷却至室温,瞬时离心30s,取上清液稀释20-100倍置于-20℃冰箱中保存备用或直接作为DNA模板进行PCR扩增。

【技术实现步骤摘要】

【技术保护点】
一种快速提取植物根际土中AM真菌环境DNA的方法,包括根际土中AM真菌相关结构的收集、真菌基因组DNA的提取、用AM真菌特异性引物进行nestedPCR扩增、及扩增片段测序及测序结果分析步骤,其特征在于本方法中所用根际土AM真菌DNA由下列方法得到:a.称取100g根际土壤样品,经湿筛倾析法收集AMF厚垣孢子及根外菌丝结构,并将其置于无菌的研钵中,用液氮冷却材料,待水份蒸发后,加入少量石英砂,充分研磨材料使之呈粉末状,然后迅速将粉末状的材料转入2ml的离心管中;b.在装有材料的离心管中加入65℃水浴预热的2×CTAB提取液1ml,使材料完全分散在提取液中,在65℃水浴锅中温浴1小时,期间每20分钟摇匀1次;c.将温浴的材料取出置于室温下,待冷却至室温后加入300μl等体积的苯酚-氯仿颠倒混匀,然后6500转/分钟离心20min;d.取上清液10μl转移到另一0.5ml的离心管中,再加入300μl20%Chelex-100树脂混匀,置于99.9℃的PCR仪上煮沸15min;e.待样品冷却至室温,瞬时离心30s,取上清液稀释20-100倍置于-20℃冰箱中保存备用或直接作为DNA模板进行PCR扩增。...

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:李涛赵之伟
申请(专利权)人:云南大学
类型:发明
国别省市:53

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