一种水稻稻米香味基因的SNP功能分子标记及应用制造技术

技术编号:16321965 阅读:42 留言:0更新日期:2017-09-29 16:10
本发明专利技术公开了一种水稻稻米香味基因的SNP功能分子标记及应用,所述香味基因为

【技术实现步骤摘要】
一种水稻稻米香味基因的SNP功能分子标记及应用
本专利技术涉及分子生物学
,具体涉及一种水稻稻米香味基因的SNP功能分子标记及应用。
技术介绍
传统系谱法选育是水稻育种家们普遍采用的方法,通过育种家们的多年努力,培育和创制了大量高产、高抗和优质的水稻新品种。然而,结合表型鉴定的传统育种模式存在表型把控不准、遗传群体需求量大、人力成本高、育种周期长等缺陷,很难实现大规模商业化集成育种或材料遗传改良。伴随着分子生物学和生物信息学的发展,分子标记辅助选择育种(MolecularAssistedSelectoin,MAS)显现了巨大的技术优势,实现了遗传基础与目标性状的结合,选择含有目标基因的材料(单株)进行组配,实现了目标性状的精准改良,能有效回避传统育种方法的技术壁垒。单个核苷酸变异(SingleNucleotidePolymorphism,SNP)在物种的基因组上广泛存在,包括:单个碱基的转换或颠换、单个碱基(片段)插入或缺失等形式,针对这些多态性位点逐步兴起了新一代的SNP分子标记技术。针对控制目标性状的基因开发功能SNP标记,将性状与基因型相关联进而实现高效、精准育种。现阶段本文档来自技高网...
一种水稻稻米香味基因的SNP功能分子标记及应用

【技术保护点】
一种水稻稻米香味基因的SNP功能分子标记,其特征在于,所述香味基因为badh2,基因内部的第二号外显子区域存在7bp碱基的插入缺失,所述的SNP功能分子标记为K_08g badh2‑1,位于水稻第8号染色体第20380271位碱基处,该SNP功能分子标记多态性为G/C,其序列如SEQ ID No.1。

【技术特征摘要】
1.一种水稻稻米香味基因的SNP功能分子标记,其特征在于,所述香味基因为badh2,基因内部的第二号外显子区域存在7bp碱基的插入缺失,所述的SNP功能分子标记为K_08gbadh2-1,位于水稻第8号染色体第20380271位碱基处,该SNP功能分子标记多态性为G/C,其序列如SEQIDNo.1。2.一种用于检测权利要求1所述SNP功能分子标记的引物组,其特征在于,包括:特异性引物序列为:Specific-alleleX:TACTTGGCCCGGACGGCGCGSpecific-alleleY:TACTTGGCCCGGACGGCGCC通用引物序列为:PrimerCommon:GAGGCGCTGAAGAGGAACCG。3.一种用于检测权利要求1所述SNP功能分子标记的试剂或试剂盒,其特征在于,包含权利要求2所述引物组。4.根据权利要求3所述的试剂或试剂盒,其特征在于,用于鉴定水稻香味、水稻种质资源改良或水稻育种。5.一种水稻稻米香味基因的SNP功能分子标记的应用,其特征在于,包括如下步骤:1)基因组提取:采用简化CTAB法,从水稻叶片中提取基因组DNA,首先将水稻叶片冻干或烘干,取适量叶片放入2.0mL离心管中,加入两粒钢珠,于组织研磨仪上磨碎;再加入750μLCTAB溶液,震荡匀浆,65℃震荡温浴0.5-1h;冷却至室温,在通风橱中加入750μL氯仿︰异戊醇(24︰1)颠倒3-4次混匀;12000rmp离心10min,取上清500μL转移至新的1.5mL...

【专利技术属性】
技术研发人员:李文博曾秀红汪建华陈发波高健江波
申请(专利权)人:长江师范学院
类型:发明
国别省市:重庆,50

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