The invention discloses a SNP marker for fat tail sheep of western Henan and a screening method and application thereof. According to the invention of Dorper sheep specific SNP marker, SNP typing analysis using pyrosequencing, Sanger sequencing, gene chip, or time of flight mass spectrometry, identification of cultivars for Dorper sheep. Comparison of varieties identification method of the invention and the conventional determination methods, has the advantages of simple operation, no interference between loci, suitable for high-throughput operation; the invention is based on pyrosequencing technology as the foundation, with very high accuracy can be completed within 5h working; variety identification; Determination of the simple identification results can be read directly from the visible signal peak.
【技术实现步骤摘要】
一种豫西脂尾羊SNP标记及其筛选方法和应用
本专利技术属于羊品种鉴定
，尤其涉及一种豫西脂尾羊SNP标记及其筛选方法和应用。
技术介绍
豫西脂尾羊(YuxiFat-tailedsheep)是河南省一个地方优良品种，1985年被编入《河南省畜禽品种志》一书。多年来，由于环境影响小，豫西脂尾羊品质的变化不明显，其优良性状耐粗饲、抗病力强、耐炎热和长膘快的特点得以保存。它适应性强，生长发育快，性成熟早，羔羊成活率高，肉质好，屠宰率高达57％。其肉质鲜美、细嫩，营养丰富，风味独到，色正味佳，温而不热，油而不腻，用豫西脂尾羊肉熬制的羊肉汤呈乳白色，香、鲜、浓，香而不膻，爽而不黏，是豫西特色名吃。市场开发前景广阔。了解本土肉用绵羊品种的遗传多样性及其遗传关系，对于品种起源进化研究、种质资源保护以及科学开发利用均具有重要的指导意义。随着杂交育种的推广，一方面，高代杂交群体的个体表型与亲本的高度相似，无法单纯地利用豫西脂尾羊的毛色、角型、体型等表型性状特征进行准确区分；另一方面，生产制作出的动物产品已经不能再表现出所属品种的表型性状特征，因此也就无法利用表型性状对其进行鉴别...
【技术保护点】
一种豫西脂尾羊SNP标记，其特征在于，所述豫西脂尾羊的特异SNP位点如下：
【技术特征摘要】
1.一种豫西脂尾羊SNP标记，其特征在于，所述豫西脂尾羊的特异SNP位点如下：突变类型中“/”左侧表示该SNP位点参考基因组(ref)的碱基类型，“/”右侧表示该SNP位点等位(alt)碱基类型。2.如权利要求1所述的豫西肥尾羊SNP标记的筛选方法，其特征在于，所述豫西肥尾羊SNP标记的筛选方法如下：从世界范围内选出多个绵羊个体涵盖多个绵羊品种作为总样本，总样本中豫西肥尾羊个数占1～3％，并获得总样本中各绵阳个体10X的全基因组SNP数据，然后从总样本中取出40％～70％个绵羊个体包括5～15只豫西肥尾羊作为实验样本，从实验样本的Allele频率数据中筛选出仅在豫西肥尾羊中高频出现的SNP位点；将总样本中剩余的豫西肥尾羊和其他品种绵羊做验证实验。3.如权利要求2所述的豫西肥尾羊SNP标记的筛选方法，其特征在于，筛选时若位点满足在豫西肥尾羊中alt频率与其他各种绵羊在该位点...
【专利技术属性】
技术研发人员：王文，姜雨，周东珂，侯雨楠，郝志强，袁圣钧，
申请(专利权)人：中国科学院昆明动物研究所，内蒙古中科正标生物科技有限责任公司，西北农林科技大学，
类型：发明
国别省市：云南,53
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