海草喜盐草微卫星标记的筛选方法技术

本发明专利技术公开一种海草喜盐草微卫星标记的筛选方法，首先使用改良的CTAB方法提取喜盐草叶片组织的基因组DNA；再应用生物素链霉亲和素捕获法得到含有微卫星的DNA片段，且对DNA片段进行测序，筛选出碱基重复(2-6个)单元多于5个的DNA序列；然后在微卫星重复序列两端的侧翼序列设计特异性的引物，并对不同地理分布群中的喜盐草个体基因组DNA进行PCR扩增以检测、优化引物；最后对PCR产物片段大小进行分析，确定每个个体的基因型，获得喜盐草的遗传多态性图谱，确定重复性、稳定性和多态性高的微卫星标记。本发明专利技术可以用于喜盐草的种质资源鉴定、遗传多样性分析、遗传图谱构建等研究，进一步用于喜盐草海草床的管理、保护和恢复工作。

【技术实现步骤摘要】

【技术保护点】
１．一种海草喜盐草微卫星标记的筛选方法，包括步骤：１）使用改良的ＣＴＡＢ方法提取喜盐草叶片组织的基因组ＤＮＡ；２）应用生物素链霉亲和素捕获法得到含有微卫星的ＤＮＡ片段，并对ＤＮＡ片段进行测序，筛选２－６个碱基重复单元、重复数超过５个的ＤＮＡ序列；３）对上述步骤筛选出的重复序列两端的侧翼序列设计特异性的引物，并对不同地理分布群中的喜盐草个体基因组ＤＮＡ进行ＰＣＲ扩增以检测、优化引物；４）对ＰＣＲ产物片段大小进行分析，确定每个个体的基因型，获得喜盐草的遗传多态性图谱；和５）确定重复性、稳定性和多态性高的微卫星标记。

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员：徐娜娜，刘敏，陈小勇，
申请(专利权)人：华东师范大学，
类型：发明
国别省市：31