一种筛选或辅助筛选不同株高小麦的方法及其专用试剂盒技术

本发明专利技术公开了一种筛选或辅助筛选不同株高小麦的方法及其专用试剂盒。本发明专利技术所提供的筛选或辅助筛选不同株高小麦的方法，包括如下步骤：检测待测小麦基于TaSPL21‑6A基因的基因型为基因型HapI、基因型HapII还是基因型HapIII，基因型HapI的小麦的株高>基因型HapIII的小麦的株高>基因型HapII的小麦的株高。实验证明，本发明专利技术所提供的方法通过检测待测小麦基于TaSPL21‑6A基因的基因型，可以筛选小麦株高性状，在小麦分子育种具有重要的应用价值。

【技术实现步骤摘要】
一种筛选或辅助筛选不同株高小麦的方法及其专用试剂盒
本专利技术涉及生物
，尤其涉及一种筛选或辅助筛选不同株高小麦的方法及其专用试剂盒。
技术介绍
小麦是世界上主要的粮食作物之一，占全球粮食作物种植面积的17％，养活了世界40％的人口，为人类提供了20％的食物能量和蛋白质，全世界35-40％的人口以它为主要的食物来源。因此，小麦产量直接关系到世界的粮食安全。目前，在有限耕地面积的情况下，选育单产突出的小麦新品种是稳定和提高小麦产量最经济有效的途径。小麦产量受多种因素(如穗数、穗粒数和粒重)的影响，各个因素的协调是小麦高产的关键。株高是影响小麦产量的重要因素之一，其表现为：在一定范围内，随着株高的增加，小麦产量也相应增加；但超出一定范围，随着株高的增加，小麦产量反而下降，主要原因为叶面积系数已达到最佳值、易倒伏、收割困难等等。因此，挖掘控制小麦株高相关性状的优良等位变异，并且开发相应等位变异的功能标记对高产小麦品种的分子标记辅助育种具有重要的意义。单核甘酸多态性(Singlenucleotidepolymorphism，SNP)是指在基因组水平上由单个核苷酸变异所引起的DNA序列的多态性。随着技术的发展，SNP检测方法越来越多，检测费用也越来越经济，使它成为继SSR之后的新一代分子标记。目前在小麦基因组研究过程中，SNP标记已被应用于小麦遗传图谱的构建、小麦重要农艺性状相关基因的定位和基因组关联分析等方面。酶切扩增多态性序列标记(Cleavedamplifiedpolymorphismsequence，CAPS)主要是对PCR扩增的DNA片段进行限制性酶切分析。根据基因序列设计特异引物，将特异PCR扩增与限制性酶切两种方法相结合用来检测核酸序列多态性的一种分子标记技术。它的基本原理是利用己知位点的DNA序列设计一对特异的PCR引物,然后用该引物特异扩增DNA片段,之后用特定的限制性内切酶酶切消化所得到的PCR扩增产物,最后通过凝胶电泳分离检测酶切产物。
技术实现思路
本专利技术所要解决的技术问题是如何筛选或辅助筛选不同株高的小麦。为解决上述技术问题，本专利技术首先提供了筛选或辅助筛选不同株高小麦的方法。本专利技术所提供的筛选或辅助筛选不同株高小麦的方法，具体可为方法一，可包括如下步骤：检测待测小麦基于TaSPL21-6A基因的基因型为基因型HapI、基因型HapII还是基因型HapIII，基因型HapI的小麦的株高>基因型HapIII的小麦的株高>基因型HapII的小麦的株高；所述基因型HapI的小麦为基于T125CSNP位点的基因型为TT纯合型、基于T160CSNP位点的基因型为CC纯合型且基于C169GSNP位点的基因型为CC纯合型的小麦；所述基因型HapII的小麦为基于T125CSNP位点的基因型为CC纯合型、基于T160CSNP位点的基因型为TT纯合型且基于C169GSNP位点的基因型为GG纯合型的小麦；所述基因型HapIII的小麦为基于T125CSNP位点的基因型为CC纯合型、基于T160CSNP位点的基因型为TT纯合型且基于C169GSNP位点的基因型为CC纯合型的小麦；所述“T125CSNP位点”为小麦基因组中序列表中的序列9自5′末端起第125位核苷酸；所述“T160CSNP位点”为小麦基因组中序列表中的序列9自5′末端起第160位核苷酸；所述“C169GSNP位点”为小麦基因组中序列表中的序列9自5′末端起第169位核苷酸。本专利技术所提供的筛选或辅助筛选不同株高小麦的方法，具体可为方法二，可包括如下步骤：检测待测小麦基于TaSPL21-6A基因的基因型为基因型HapI、基因型HapII还是基因型HapIII，基因型HapI的小麦的株高>基因型HapIII的小麦的株高>基因型HapII的小麦的株高；所述基因型HapI的小麦为基于T125CSNP位点的基因型为TT纯合型、基于T160CSNP位点的基因型为CC纯合型且基于C169GSNP位点的基因型为CC纯合型的小麦；所述基因型HapII的小麦为基于T125CSNP位点的基因型为CC纯合型、基于T160CSNP位点的基因型为TT纯合型且基于C169GSNP位点的基因型为GG纯合型的小麦；所述基因型HapIII的小麦为基于T125CSNP位点的基因型为CC纯合型、基于T160CSNP位点的基因型为TT纯合型且基于C169GSNP位点的基因型为CC纯合型的小麦；所述“T125CSNP位点”为小麦基因组中序列表中的序列10自5′末端起第125位核苷酸；所述“T160CSNP位点”为小麦基因组中序列表中的序列10自5′末端起第160位核苷酸；所述“C169GSNP位点”为小麦基因组中序列表中的序列10自5′末端起第169位核苷酸。本专利技术所提供的筛选或辅助筛选不同株高小麦的方法，具体可为方法三，依次可包括如下步骤：(1)以待测小麦的基因组DNA为模板，采用引物F和引物R组成的引物对进行PCR扩增，得到PCR扩增产物；(2)将所述PCR扩增产物用限制性内切酶BglI进行酶切，得到酶切产物A；将所述PCR扩增产物用限制性内切酶BseDI或SecI进行酶切，得到酶切产物B；(3)进行如下评判：如果所述酶切产物A为两条DNA片段且所述酶切产物B为一条DNA片段，则待测小麦基于TaSPL21-6A基因的基因型为基因型HapI；如果所述酶切产物A为一条DNA片段且所述酶切产物B为两条DNA片段，则待测小麦基于TaSPL21-6A基因的基因型为基因型HapII；如果所述酶切产物A为一条DNA片段且所述酶切产物B为一条DNA片段，则待测小麦基于TaSPL21-6A基因的基因型为基因型HapIII；基因型HapI的小麦的株高>基因型HapIII的小麦的株高>基因型HapII的小麦的株高；所述引物F为如下a1)或a2)：a1)序列表的序列4所示的单链DNA分子；a2)将序列4经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列4具有相同功能的DNA分子；所述引物R为如下a3)或a4)：a3)序列表的序列5所示的单链DNA分子；a4)将序列5经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列5具有相同功能的DNA分子。本专利技术所提供的筛选或辅助筛选不同株高小麦的方法，具体可为方法四，依次可包括如下步骤：(1)以待测小麦的基因组DNA为模板，采用引物F和引物R组成的引物对进行PCR扩增，得到PCR扩增产物；(2)将所述PCR扩增产物用限制性内切酶BglI进行酶切，得到酶切产物A；将所述PCR扩增产物用限制性内切酶BseDI或SecI进行酶切，得到酶切产物B；(3)进行如下评判：如果酶切产物A中具有176bp的DNA片段和166bp的DNA片段且所述酶切产物B中具有342bp的DNA片段，则待测小麦基于TaSPL21-6A基因的基因型为基因型HapI；如果所述酶切产物A具有342bp的DNA片段且酶切产物B具有165bp的DNA片段和177bp的DNA片段，则待测小麦基于TaSPL21-6A基因的基因型为基因型HapII；如果所述酶切产物A具有342bp的DNA片段且酶切产物B具有342bp的DNA片段，则待测小麦基于TaSPL21-6A基本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种筛选或辅助筛选不同株高小麦的方法，包括如下步骤：检测待测小麦基于TaSPL21‑6A基因的基因型为基因型HapI、基因型HapII还是基因型HapIII，基因型HapI的小麦的株高>基因型HapIII的小麦的株高>基因型HapII的小麦的株高；所述基因型HapI的小麦为基于T125C SNP位点的基因型为TT纯合型、基于T160C SNP位点的基因型为CC纯合型且基于C169G SNP位点的基因型为CC纯合型的小麦；所述基因型HapII的小麦为基于T125C SNP位点的基因型为CC纯合型、基于T160C SNP位点的基因型为TT纯合型且基于C169G SNP位点的基因型为GG纯合型的小麦；所述基因型HapIII的小麦为基于T125C SNP位点的基因型为CC纯合型、基于T160C SNP位点的基因型为TT纯合型且基于C169G SNP位点的基因型为CC纯合型的小麦；所述“T125C SNP位点”为小麦基因组中序列表中的序列9自5′末端起第125位核苷酸；所述“T160C SNP位点”为小麦基因组中序列表中的序列9自5′末端起第160位核苷酸；所述“C169G SNP位点”为小麦基因组中序列表中的序列9自5′末端起第169位核苷酸。...

【技术特征摘要】
1.一种筛选或辅助筛选不同株高小麦的方法，包括如下步骤：检测待测小麦基于TaSPL21-6A基因的基因型为基因型HapI、基因型HapII还是基因型HapIII，基因型HapI的小麦的株高>基因型HapIII的小麦的株高>基因型HapII的小麦的株高；所述基因型HapI的小麦为基于T125CSNP位点的基因型为TT纯合型、基于T160CSNP位点的基因型为CC纯合型且基于C169GSNP位点的基因型为CC纯合型的小麦；所述基因型HapII的小麦为基于T125CSNP位点的基因型为CC纯合型、基于T160CSNP位点的基因型为TT纯合型且基于C169GSNP位点的基因型为GG纯合型的小麦；所述基因型HapIII的小麦为基于T125CSNP位点的基因型为CC纯合型、基于T160CSNP位点的基因型为TT纯合型且基于C169GSNP位点的基因型为CC纯合型的小麦；所述“T125CSNP位点”为小麦基因组中序列表中的序列9自5′末端起第125位核苷酸；所述“T160CSNP位点”为小麦基因组中序列表中的序列9自5′末端起第160位核苷酸；所述“C169GSNP位点”为小麦基因组中序列表中的序列9自5′末端起第169位核苷酸。2.一种筛选或辅助筛选不同株高小麦的方法，包括如下步骤：检测待测小麦基于TaSPL21-6A基因的基因型为基因型HapI、基因型HapII还是基因型HapIII，基因型HapI的小麦的株高>基因型HapIII的小麦的株高>基因型HapII的小麦的株高；所述基因型HapI的小麦为基于T125CSNP位点的基因型为TT纯合型、基于T160CSNP位点的基因型为CC纯合型且基于C169GSNP位点的基因型为CC纯合型的小麦；所述基因型HapII的小麦为基于T125CSNP位点的基因型为CC纯合型、基于T160CSNP位点的基因型为TT纯合型且基于C169GSNP位点的基因型为GG纯合型的小麦；所述基因型HapIII的小麦为基于T125CSNP位点的基因型为CC纯合型、基于T160CSNP位点的基因型为TT纯合型且基于C169GSNP位点的基因型为CC纯合型的小麦；所述“T125CSNP位点”为小麦基因组中序列表中的序列10自5′末端起第125位核苷酸；所述“T160CSNP位点”为小麦基因组中序列表中的序列10自5′末端起第160位核苷酸；所述“C169GSNP位点”为小麦基因组中序列表中的序列10自5′末端起第169位核苷酸。3.一种筛选或辅助筛选不同株高小麦的方法，依次包括如下步骤：(1)以待测小麦的基因组DNA为模板，采用引物F和引物R组成的引物对进行PCR扩增，得到PCR扩增产物；(2)将所述PCR扩增产物用限制性内切酶BglI进行酶切，得到酶切产物A；将所述PCR扩增产物用限制性内切酶BseDI或SecI进行酶切，得到酶切产物B；(3)进行如下评判：如果所述酶切产物A为两条DNA片段且所述酶切产物B为一条DNA片段，则待测小麦基于TaSPL21-6A基因的基因型为基因型HapI；如果所述酶切产物A为一条DNA片段且所述酶切产物B为两条DNA片段，则待测小麦基于TaSPL21-6A基因的基因型为基因型HapII；如果所述酶切产物A为一条DNA片段且所述酶切产物B为一条DNA片段，则待测小麦基于TaSPL21-6A基因的基因型为基因型HapIII；基因型HapI的小麦的株高>基因型HapIII的小麦的株高>基因型HapII的小麦的株高；所述引物F为如下a1)或a2)：a1)序列表的序列4所示的单链DNA分子；a2)将序列4经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列4具有相同功能的DNA分子；所述引物R为如下a3)或a4)：a3)序列表的序列5所示的单链DNA分子；a4)将序列5经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列5具有相同功能的DNA分子。4.一种筛选或辅助筛选不同株高小麦的方法，依次包括如下步骤：(1)以待测小麦的基因组DNA为模板，采用引物F和引物R组成的引物对进行PCR扩增，得到PCR扩增产物；(2)将所述PCR扩增产物用限制性内切酶BglI进行酶切，得到酶切产物A；将所述PCR扩增产物用限制性内切酶BseDI或SecI进行酶切，得到酶切产物B；(3)进行如下评判：如果酶切产物A中具有176bp的DNA片段和166bp的DNA片段且所述酶切产物B中具有342bp的DNA片段，则待测小麦基于TaSPL21-6A基因的基因型为基因型HapI；如果所述酶切产物A具有342bp的DNA片段且酶切产物B具有165bp的DNA片段和177bp的DNA片段，则待测小麦基于TaSPL21-6A基因的基因型为基因型HapII；如果所述酶切产物A具有342bp的DNA片段且酶切产物B具有3...

【专利技术属性】
技术研发人员：景蕊莲，张斌，刘霞，徐伟娜，昌小平，
申请(专利权)人：中国农业科学院作物科学研究所，
类型：发明
国别省市：北京,11