一种有效制备果树高分子量DNA的方法技术

技术编号:14643976 阅读:46 留言:0更新日期:2017-02-16 00:20
本发明专利技术涉及一种有效制备果树高分子量DNA的方法,其特征在于包括以下制备步骤:取苹果或桃或杏或樱桃或柿的鲜叶;核提取缓冲液:将10g鲜叶在液氮中研成细粉,加入200ml核提取缓冲液,置于冰浴中,用磁力搅拌器搅拌l0分钟。该匀浆经两层纱布过后,以3000转/分钟的速度,离心20分钟;本发明专利技术一种有效制备果树高分子量DNA的方法,步骤简单,容易操作,可以从绝大多数植物中制备(HMW)DNA,具有很好的推广作用。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及一种有效制备果树高分子量DNA的方法
技术介绍
高纯度、高质量的大分子量(HMW)DNA是复杂基因组限制性酶酶切分析和大片段基因组文库构建的前提。植物(HMW)DNA可以从原生质体和细胞核中制备。用原生质体法能制备很少被剪切的高质量(HMW)DNA,但是该方法涉及到一系列降解细胞壁、分离、包埋和裂解等复杂、昂贵、耗时的过程,往往一种优化的方法仅对某种特殊植物材料有效,而且从原生质体中制备的(HMW)DNA有相对高的叶绿体和线粒体DNA的污染,这不仅影响到用于所建基因文库的真实性,而且影响到随后的染色体步查及基因组分析结果的可靠性。国外有研究团队首先从包埋于琼脂糖中的植物细胞核中分离(HMW)DNA,经过改进,此法对许多植物材料都有效,且得到的(HMW)DNA浓度高,叶绿体DNA污染少。但是在制备核和随后裂解过程,造成相对严重的DNA降解。Fu简化了植物细胞核的制备步骤,而通过脉冲电泳(PFGE)来回收粗提核裂解物中的(HMW)DNA,得到了无叶绿体、线粒体DNA污染、非特异小片段含量相对低的高质量(HMW)DNA。对大多数果树,很难分离原生质体,虽然能从组培细胞中分离,但组培过程慢,费事且易造成体细胞变异。因此,大多采用从核中制备果树(HMW)DNA2。由于大多数果树叶片富含多酚多糖类物质,它们会给(HMW)DNA的制备及随后的分析带来很大麻烦,同时在去除多酚和多糖的纯化过程中,往往会影响了核DNA的完整性,因而影响到所建大片段基因文库的真实性。
技术实现思路
本专利技术提出一种有效制备果树高分子量DNA的方法。一种有效制备果树高分子量DNA的方法,包括以下制备步骤:(1)取苹果或桃或杏或樱桃或柿的鲜叶;核提取缓冲液:(2)将10g鲜叶在液氮中研成细粉,加入200ml核提取缓冲液,置于冰浴中,用磁力搅拌器搅拌l0分钟;该匀浆经两层纱布过后,以3000转/分钟的速度,离心20分钟;(3)弃上清,将沉淀物中加入少量核洗涤缓冲液,用毛刷轻轻打散,再加入约200ml核洗涤缓冲液混匀,以60转/分钟的速度,离心5分钟,弃沉淀;(4)将上清液于2000转/分钟的速度下离心20分钟;(5)将该沉淀洗涤l-3次,用lmllHB(无β-mercaptoethanol)将粗提核混匀,于45C下,与等量的l%LMP琼脂糖混合均匀;(6)将步骤(5)产物装入凝胶块模具中,在4摄氏度温度下凝固l小时,将包埋有细胞核的凝胶块推入20倍体积的核裂解缓冲液中,50摄氏度下裂解24小时,其间更换裂解液两次;(7)将步骤(6)产物在4摄氏度下保存于0.5mol/LEDTA,lmmol/LPSMF中;(8)将上述凝胶块置于大量的0.5xTBE中透析两小时,然后包埋于l%琼脂糖凝胶的加样孔中,进行脉冲电泳,电泳结束后染色l0分钟后获得的(HMW)DNA胶块。优选地,电解液为:0.5xTBE和浓度为l%(Bio-Rad)的琼纸糖凝胶混合物。优选地,所述电泳的环境为:脉冲电压:5V/cm,脉冲角度:l20;脉冲温度:11摄氏度,脉冲交变时间为5-l5秒;脉冲电泳时间为l8小时。本专利技术一种有效制备果树高分子量DNA的方法,步骤简单,容易操作,可以从绝大多数植物中制备(HMW)DNA,具有很好的推广作用。具体实施方式实施例1。一种有效制备果树高分子量DNA的方法,包括以下制备步骤:(1)取苹果或桃或杏或樱桃或柿的鲜叶;核提取缓冲液:(2)将10g鲜叶在液氮中研成细粉,加入200ml核提取缓冲液,置于冰浴中,用磁力搅拌器搅拌l0分钟;该匀浆经两层纱布过后,以3000转/分钟的速度,离心20分钟;(3)弃上清,将沉淀物中加入少量核洗涤缓冲液,用毛刷轻轻打散,再加入约200ml核洗涤缓冲液混匀,以60转/分钟的速度,离心5分钟,弃沉淀;(4)将上清液于2000转/分钟的速度下离心20分钟;(5)将该沉淀洗涤l-3次,用lmllHB(无β-mercaptoethanol)将粗提核混匀,于45C下,与等量的l%LMP琼脂糖混合均匀;(6)将步骤(5)产物装入凝胶块模具中,在4摄氏度温度下凝固l小时,将包埋有细胞核的凝胶块推入20倍体积的核裂解缓冲液中,50摄氏度下裂解24小时,其间更换裂解液两次;(7)将步骤(6)产物在4摄氏度下保存于0.5mol/LEDTA,lmmol/LPSMF中;(8)将上述凝胶块置于大量的0.5xTBE中透析两小时,然后包埋于l%琼脂糖凝胶的加样孔中,进行脉冲电泳,电泳结束后染色l0分钟后获得的(HMW)DNA胶块。优选地,电解液为:0.5xTBE和浓度为l%(Bio-Rad)的琼纸糖凝胶混合物。实施例2。一种有效制备果树高分子量DNA的方法,包括以下制备步骤:(1)取苹果或桃或杏或樱桃或柿的鲜叶;核提取缓冲液:(2)将10g鲜叶在液氮中研成细粉,加入200ml核提取缓冲液,置于冰浴中,用磁力搅拌器搅拌l0分钟;该匀浆经两层纱布过后,以3000转/分钟的速度,离心20分钟;(3)弃上清,将沉淀物中加入少量核洗涤缓冲液,用毛刷轻轻打散,再加入约200ml核洗涤缓冲液混匀,以60转/分钟的速度,离心5分钟,弃沉淀;(4)将上清液于2000转/分钟的速度下离心20分钟;(5)将该沉淀洗涤l-3次,用lmllHB(无β-mercaptoethanol)将粗提核混匀,于45C下,与等量的l%LMP琼脂糖混合均匀;(6)将步骤(5)产物装入凝胶块模具中,在4摄氏度温度下凝固l小时,将包埋有细胞核的凝胶块推入20倍体积的核裂解缓冲液中,50摄氏度下裂解24小时,其间更换裂解液两次;(7)将步骤(6)产物在4摄氏度下保存于0.5mol/LEDTA,lmmol/LPSMF中;(8)将上述凝胶块置于大量的0.5xTBE中透析两小时,然后包埋于l%琼脂糖凝胶的加样孔中,进行脉冲电泳,电泳结束后染色l0分钟后获得的(HMW)DNA胶块。(9)所述电解液为:0.5xTBE和浓度为l%(Bio-Rad)的琼纸糖凝胶混合物(10)所述电泳的环境为:脉冲电压:5V/cm,脉冲角度:l20;脉冲温度:11摄氏度,脉冲交变时间为5-l5秒;脉冲电泳时间为l8小时。本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种有效制备果树高分子量DNA的方法,其特征在于包括以下制备步骤:(1)取苹果或桃或杏或樱桃或柿的鲜叶;核提取缓冲液;(2)将10g鲜叶在液氮中研成细粉,加入200ml核提取缓冲液,置于冰浴中,用磁力搅拌器搅拌l0分钟;该匀浆经两层纱布过后,以3000转/分钟的速度,离心20分钟;(3)弃上清,将沉淀物中加入少量核洗涤缓冲液,用毛刷轻轻打散,再加入约200ml核洗涤缓冲液混匀,以60转/分钟的速度,离心5分钟,弃沉淀;(4)将上清液于2000转/分钟的速度下离心20分钟;(5)将该沉淀洗涤l‑3次,用lml lHB(无β‑mercaptoet hanol )将粗提核混匀,于45 C 下,与等量的l % LMP 琼脂糖混合均匀;(6)将步骤(5)产物装入凝胶块模具中,在4摄氏度温度下凝固l小时,将包埋有细胞核的凝胶块推入20倍体积的核裂解缓冲液中,50摄氏度下裂解24小时,其间更换裂解液两次;(7)将步骤(6)产物在4摄氏度下保存于0.5mol/L EDTA,lm mol/L PSMF 中;(8)将上述凝胶块置于大量的0.5xTBE中透析两小时,然后包埋于l % 琼脂糖凝胶的加样孔中,进行脉冲电泳,电泳结束后染色l0 分钟后获得的(HMW)DNA胶块。...

【技术特征摘要】
1.一种有效制备果树高分子量DNA的方法,其特征在于包括以下制备步骤:(1)取苹果或桃或杏或樱桃或柿的鲜叶;核提取缓冲液;(2)将10g鲜叶在液氮中研成细粉,加入200ml核提取缓冲液,置于冰浴中,用磁力搅拌器搅拌l0分钟;该匀浆经两层纱布过后,以3000转/分钟的速度,离心20分钟;(3)弃上清,将沉淀物中加入少量核洗涤缓冲液,用毛刷轻轻打散,再加入约200ml核洗涤缓冲液混匀,以60转/分钟的速度,离心5分钟,弃沉淀;(4)将上清液于2000转/分钟的速度下离心20分钟;(5)将该沉淀洗涤l-3次,用lmllHB(无β-mercaptoethanol)将粗提核混匀,于45C下,与等量的l%LMP琼脂糖混合均匀;(6)将步骤(5)产物装入凝胶块模具中,在4摄氏度温度下凝固l小时,...

【专利技术属性】
技术研发人员:王耀斌
申请(专利权)人:陕西高新实业有限公司
类型:发明
国别省市:陕西;61

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