本发明专利技术公开了lncRNA分子ENST00000438553及其在鼻咽癌辅助诊断中的应用。ENST00000438553的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。TCONS_00003617在鼻咽癌组织中的表达量明显高于癌旁组织，其可作为鼻咽癌分子标志物或靶点，应用于鼻咽癌临床早期诊断、预后判断或靶向治疗，并有利于进一步阐明鼻咽癌的发生发展机理、信号通路等，极具应用前景和理论价值。
【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于分子生物学和肿瘤学领域，具体涉及一种lncRNA分子ENST00000438553及其在鼻咽癌临床诊断、治疗、预后评估或科学研究中的应用。
技术介绍
鼻咽癌(nasopharyngeal carcinoma，NPC)是我国南方最常见的恶性肿瘤之一，在华南地区，尤其广东省发病率最高，居世界首位，故又著称“广东癌”。NPC对放射敏感，首选放疗，其预后因疾病分期不同而差异巨大。I、Ⅱ期患者单纯放疗效果明显，十年疾病相关生存率、无复发生存率、无远地转移生存率都较高。但NPC起病隐匿，早期症状缺乏特异性，约75％的患者确诊时已属III、IV期。晚期NPC的疗效仍相当令人失望，易出现复发和远处转移，5年生存率仅35％。因此，早发现、早治疗是提高鼻咽癌患者生存率的关键。鼻咽癌的发生发展是一个多因素、多基因参与的动态过程，因此，探索其动态发展的分子机制，寻找鼻咽癌相关分子标志物，以进一步明确其发病机制，并开发出可应用于临床早期诊断、治疗和预后评估的试剂或产品，对提高鼻咽癌的诊疗水平、减低复发转移率具有重要意义。人类基因组中存在大量转录的长链非编码RNA(Long Noncoding RNA,IncRNA)，是一类转录本长度超过200nt核苷酸单位的功能性RNA分子。研究发现，lncRNA参与了基因组印记及染色质修饰、转录激活、转录干扰、核内运输等多种重要的调控过程，在致癌和抑癌途径中亦显露出重要的调控作用，已成为继miRNA研究的新热点。LncRNA已显示参与了许多肿瘤的发生和发展，然而，在鼻咽癌方面的研究仅见极少量的报道。
技术实现思路
为了解决现有技术中所存在的不足，本专利技术的目的在于提供一种lncRNA分子及其在鼻咽癌辅助诊断中的应用。本专利技术的另一个目的在于提供上述lncRNA分子在鼻咽癌治疗或预后评估中应用。本专利技术的另一个目的在于提供上述lncRNA分子在制备鼻咽癌预防或治疗药物中的应用。本专利技术所采取的技术方案是：一种在鼻咽癌组织中高表达的lncRNA分子，名称为ENST00000438553，其核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。lncRNA分子ENST00000438553在鼻咽癌辅助诊断或鼻咽癌治疗/预后评估中的应用。lncRNA分子ENST00000438553在制备鼻咽癌辅助诊断或鼻咽癌治疗/预后评估试剂或试剂盒中的应用。用于检测lncRNA分子ENST00000438553的试剂在制备鼻咽癌辅助诊断或鼻咽癌治疗/预后评估试剂或试剂盒中的应用。所述用于检测权利要求1所述lncRNA分子的试剂包括用于扩增权利要求1所述lncRNA分子的特异性引物对。所述用于扩增权利要求1所述lncRNA分子的特异性引物对，序列如下所示：F：5’-CCACTTCCAGAGGGTAGCA-3’(SEQ ID NO.4)；R：5’-CCCCACTGCTGAGATGTTG-3’(SEQ ID NO.5)。lncRNA分子ENST00000438553作为鼻咽癌治疗靶点的应用。lncRNA分子ENST00000438553在制备预防或治疗鼻咽癌药物中的应用。一种用于鼻咽癌辅助诊断或预后评估的试剂盒，其中包括：(1)用于扩增lncRNA分子ENST00000438553的特异性引物对；(2)标准DNA模板；(3)PCR反应液。一种检测lncRNA的方法，包括如下步骤：(1)提取样品总RNA；(2)制备样品Cdna；(3)定量扩增lncRNA；所述lncRNA为ENST00000438553。本专利技术的有益效果是：本专利技术成功筛选出鼻咽癌组织中高表达的lncRNA分子，其可作为鼻咽癌分子标志物或靶点，应用于鼻咽癌临床早期诊断、预后判断或靶向治疗，并有利于进一步阐明鼻咽癌的发生发展机理、信号通路等，极具应用前景和理论价值。附图说明图1变性琼脂糖凝胶电泳检测鼻咽癌及癌旁组织总RNA；图2微阵列荧光扫描图；图3样品荧光强度分布图；图4芯片杂交信号强度散点图；图5层次聚类分析图；图6 qRT-PCR中lncRNA：ENST00000438553对应的溶解曲线与扩散曲线图；图7 qRT-PCR检测lncRNA：ENST00000438553表达升高倍数柱状图；图8非癌组体检结果饼状图；图9非癌组患者体检异常概况柱状图；图10实验组和对照组的性别分类条形图；图11实验组和对照组的年龄分类条形图；图12外周血标本总RNA变性琼脂糖凝胶电泳图(其中41-49为RNA连续性完整的电泳结果图，16/24/25/27为RNA降解的电泳结果图)；图13 ENST00000438553的扩增和溶解曲线图(其中左图为扩增曲线图，右图为溶解曲线图)；图14 ENST00000438553在实验组和非癌组的相对表达量散点图(P<0.001)；图15 ENST00000438553的表达量与鼻咽癌患者局部肿瘤大小分组的箱线图(P＝0.928)；图16 ENST00000438553的表达量与鼻咽癌患者淋巴结转移范围分组的箱线图(P＝0.529)；图17 ENST00000438553的表达量与NPC患者TNM总分期分组的箱线图(P＝0.657)；图18 ENST00000438553表达量的ROC曲线图。具体实施方式下面结合实施例对本专利技术作进一步的说明，但并不局限于此。以下实施例中所采用的分子生物学实验技术包括PCR扩增、质粒提取、质粒转化、DNA片段连接、酶切、凝胶电泳等，如无特殊说明，通常按照常规方法操作，具体可参见《分子克隆实验指南》(第三版)(Sambrook J,Russell DW，Janssen K,Argentine J.黄培堂等译，2002，北京：科学出版社)，或按照制造厂商所建议的条件。实施例1一、鼻咽癌相关lncRNA分子的筛选1、病例收集收集19例于2014年2月-2014年8月在广东省佛山市第一人民医院鼻咽放疗科就诊住院的患者。所有患者术前未行放化疗，排除其他系统性病史，各重要器官功能在正常范围，年龄21-61岁，中位年龄45岁，样本临床资料详见表1，随机选择其中6例用于芯片研究，其余13例用于进一步验证。试验中标本采集均已取得病人知情同意，并从广东省佛山市第一人民医院伦理委员会得到认可授权。表1收集19例鼻咽癌病例的相关临床参数2、样本采集1)首先准备好用于保存组织的冻存管，且用黑色油性记号笔在冻存管上标明样本分组、编号、收集日期等信息；2)门诊活检钳取鼻咽癌及癌旁组织(具有5年以上操作经验的鼻内镜技师操作)；3)将钳取的癌和癌旁组织标本均分成2份，其中1份送病理组织学鉴定，另1份放入备好的冻存管中并拧紧，迅速投入液氮运输罐中冷却，待彻底冷冻后转移至-80℃冰箱保存；4)填写标本登记单,写明样本编号、分组、来源患者名称、病案号、样本收集日期及样本处理过程等情况；5)待病理性质确诊后取出标本开展下一步研究。3、总RNA样品制备、纯化及质检(1)TRIZOL法提取RNA样品；(2)采用RNeasy柱对总RNA样品进行纯化；(3)RNA定量和质量控制(采用Nanodrop ND 1000紫外可见分光光度计以及凝胶电泳检查确定样品总RNA浓度和质量)。Nanodrop分光光度计对鼻咽癌及癌旁组织总RNA测定本文档来自技高网...
【技术保护点】
一种在鼻咽癌组织中高表达的lncRNA分子，名称为ENST00000438553，其核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。
【技术特征摘要】
2015.06.04 CN 20151030586151.一种在鼻咽癌组织中高表达的lncRNA分子，名称为ENST00000438553，其核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。2.权利要求1所述的lncRNA分子在鼻咽癌辅助诊断或鼻咽癌治疗/预后评估中的应用。3.权利要求1所述的lncRNA分子在制备鼻咽癌辅助诊断或鼻咽癌治疗/预后评估试剂或试剂盒中的应用。4.用于检测权利要求1所述lncRNA分子的试剂在制备鼻咽癌辅助诊断或鼻咽癌治疗/预后评估试剂或试剂盒中的应用。5.根据权利要求4所述的应用，其特征在于，所述用于检测权利要求1所述lncRNA分子的试剂包括用于扩增权利要求1所述lncRNA分子的特异性引物对。6.根据权利要求5所...
【专利技术属性】
技术研发人员：王跃建，罗微，夏世同，唐隽，陈伟雄，
申请(专利权)人：佛山市第一人民医院，
类型：发明
国别省市：广东;44
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