靶向EGFR和/或HER2的单价抗原结合构建体及其用途制造技术

本文提供靶向EGFR和/或HER2的单价抗原结合构建体。单价抗原结合构建体可包括至少一个包含重链可变结构域的抗原结合多肽，其中所述抗原结合多肽特异性结合EGFR和/或HER2；以及异二聚Fc结构域，所述Fc结构域包含至少两个CH3结构域，其中所述Fc结构域以或不以接头偶联于所述抗原结合多肽。也提供制备构建体的方法和使用构建体的方法。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】相关申请的交叉引用本申请要求2013年11月13日提交的美国临时申请号61/903,825的权益，所述美国临时申请据此以引用的方式整体并入本文。序列表本申请含有已通过EFS网提交，并且据此以引用的方式整体并入本文的序列表。所述ASCII拷贝于20XX年某月XX日创建，名为XXXXXPCT_sequencelisting.txt，并且大小是X,XXX,XXX字节。背景人表皮生长因子受体(也称为HER-1或Erb-B1)是一种由c-erbB原癌基因编码的170kDa跨膜受体，并且展现固有酪氨酸激酶活性(Modjtahedi等,Br.J.Cancer 73:228-235(1996)；Herbst和Shin,Cancer 94:1593-1611(2002))。SwissProt数据库条目P00533提供EGFR的序列。也存在EGFR的亚型和变体(例如选择性RNA转录物、截短形式、多态形式等)，包括但不限于用Swissprot数据库条目号P00533-1、P00533-2、P00533-3和P00533-4标识的那些。已知EGFR结合配体，包括表皮生长因子(EGF)、转化生长因子-α(TGF-α)、双调蛋白(amphiregulin)、肝素结合性EGF(hb-EGF)、β细胞素(betacellulin)和上皮调节蛋白(epiregulin)(Herbst和Shin,Cancer 94:1593-1611(2002)；Mendelsohn和Baselga,Oncogene 19:6550-6565(2000))。EGFR通过酪氨酸激酶介导的信号传导路径调控众多细胞过程，包括但不限于控制细胞增殖、分化、细胞存活、凋亡、血管生成、有丝分裂发生和转移的信号传导路径的活化(Atalay等,Ann.Oncology 14:1346-1363(2003)；Tsao和Herbst,Signal 4:4-9(2003)；Herbst和Shin,Cancer 94:1593-1611(2002)；Modjtahedi等,Br.J.Cancer 73:228-235(1996))。已报道在包括膀胱癌、脑癌、头颈部癌、胰腺癌、肺癌、乳腺癌、卵巢癌、结肠癌、前列腺癌和肾癌的众多人恶性病状中，EGFR过表达。(Atalay等,Ann.Oncology 14:1346-1363(2003)；Herbst和Shin,Cancer 94:1593-1611(2002)Modjtahedi等,Br.J.Cancer 73:228-235(1996))。在这些病状中的许多中，EGFR的过表达与患者的不良预后相关联或有关。(Herbst和Shin,Cancer 94:1593-1611(2002)Modjtahedi等,Br.J.Cancer 73:228-235(1996))。EGFR也在正常组织，特别是皮肤、肝和胃肠道的上皮组织的细胞中表达，但水平通常低于恶性细胞中(Herbst和Shin,Cancer 94:1593-1611(2002))。已报道用以靶向EGFR以及阻断EGFR信号传导路径的各种策略。小分子酪氨酸激酶抑制剂(如吉非替尼(gefitinib)、埃罗替尼(erlotinib)和CI-1033)阻断细胞内酪氨酸激酶区域中EGFR的自体磷酸化，由此抑制下游信号传导事件(Tsao和Herbst,Signal 4:4-9(2003))。另一方面，单克隆抗体靶向EGFR的细胞外部分，此导致阻断配体结合以及由此抑制下游事件，诸如细胞增殖(Tsao和Herbst,Signal 4:4-9(2003))。包含来自两个或更多个不同物种(例如小鼠和人)的抗体的各部分的的嵌合抗体已作为“缀合”抗体的替代物被开发。举例来说，美国专利号5,891,996(Mateo de Acosta del Rio等)讨论一种针对EGFR的小鼠/人嵌合抗体R3，并且美国专利号5,558,864讨论鼠类抗EGFR MAb 425的嵌合和人源化形式的产生。此外，ErbituxTM是一种嵌合小鼠/人抗EGFR单克隆抗体(基于在人临床试验中产生HAMA应答的小鼠M225单克隆抗体)，其已被报道在各种人异种移植模型中显示抗肿瘤功效。(Herbst和Shin,Cancer 94:1593-1611(2002))。ErbituxTM的功效已被归因于若干机理，包括抑制由EGFR信号传导路径调控的细胞事件，以及可能增加抗体依赖性细胞毒性(ADCC)活性(Herbst和Shin,Cancer 94:1593-1611(2002))。ErbituxTM也用于临床试验中，包括与放射疗法和化学疗法组合(Herbst and Shin,Cancer 94:1593-1611(2002))。Abgenix,Inc.(Fremont,Calif.)已开发用于癌症疗法的ABX-EGF。ABX-EGF是一种完全人抗EGFR单克隆抗体。(Yang等,Crit.Rev.Oncol./Hematol.38:17-23(2001))。美国专利号8,097,436提供EGFR靶向抗体的其它实例。已知用抗EGFR单克隆抗体和其它EGFR抑制剂进行的疗法伴有皮肤毒性高发，所述皮肤毒性被认为由于EGFR在表皮、皮脂腺和毛囊上皮的正常组织上表达而发生。最常报道的副作用是见于多达90％的患者中，主要在皮脂溢区域中的丘疹脓疱性皮疹，其中30％足够严重以需要进行医学干预。在一些情况下，皮肤学副作用足够严重以致用抗EGFR单克隆抗体进行的疗法被中止，在降低剂量下继续，或中断。(Boone等,Oncology 72:152-159(2007))。本申请也与下列共同拥有的专利申请相关：2011年11月4日提交的PCT/CA2011/001238、2012年11月2日提交的PCT/CA2012/050780、2013年5月10日提交的PCT/CA2013/00471和2013年5月8日提交的PCT/CA2013/050358，所述专利申请各自的整个公开内容据此出于所有目的以引用的方式整体并入本文。概述本文提供一种治疗患有表皮生长因子受体(EGFR)表达性肿瘤的受试者的方法，其包括：使所述肿瘤与有效量的分离的单价EGFR结合构建体接触，所述构建体包含至少一个包含重链可变结构域，以或不以接头偶联于异二聚Fc的抗原结合多肽，其中所述抗原结合多肽结合或特异性结合EGFR，并且其中相较于结合或特异性结合EGFR的相应分离的单特异性二价抗原结合构建体，所述构建体以更大的Bmax结合EGFR。在一些方面，Fc是具有链A中的突变T350V_L351Y_F405A_Y407V(根据EU编号)和链B中的突变T350V_T366L_K392L_T394W(根据EU编号)的异二聚人IgG1Fc，其中抗原结合多肽结合位于EGFR的细胞外结构域中的表位，其中相较于用结合或特异性结合EGFR的分离的相应单特异性二价抗原结合构建体治疗的受试者，受试者经受较小的由治疗所致的皮肤毒性，并且其中肿瘤表达的第一细胞表面EGFR水平等于或小于一种或多于一种下列细胞系的第二细胞表面EGFR水平：A431、A549、BT474、CACO本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种治疗患有表皮生长因子受体(EGFR)表达性肿瘤的受试者的方法，其包括：使所述肿瘤与有效量的分离的单价EGFR结合构建体接触，所述构建体包含至少一个包含重链可变结构域，以或不以接头偶联于异二聚Fc的抗原结合多肽，其中所述抗原结合多肽结合或特异性结合EGFR，并且其中相较于结合或特异性结合EGFR的相应分离的单特异性二价抗原结合构建体，所述构建体以更大Bmax结合EGFR。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】2013.11.13 US 61/903,8251.一种治疗患有表皮生长因子受体(EGFR)表达性肿瘤的受试者的方法，其包括：使所述肿瘤与有效量的分离的单价EGFR结合构建体接触，所述构建体包含至少一个包含重链可变结构域，以或不以接头偶联于异二聚Fc的抗原结合多肽，其中所述抗原结合多肽结合或特异性结合EGFR，并且其中相较于结合或特异性结合EGFR的相应分离的单特异性二价抗原结合构建体，所述构建体以更大Bmax结合EGFR。2.根据权利要求1所述的方法，其中所述Fc是具有根据EU编号链A中的突变T350V_L351Y_F405A_Y407V和根据EU编号链B中的突变T350V_T366L_K392L_T394W的异二聚人IgG1Fc，其中所述抗原结合多肽结合位于EGFR的细胞外结构域中的表位，其中相较于用结合或特异性结合EGFR的分离的相应单特异性二价抗原结合构建体治疗的受试者，所述受试者经受较小的由治疗所致的皮肤毒性，并且其中所述肿瘤表达的第一细胞表面EGFR水平等于或小于一种或多于一种下列细胞系的第二细胞表面EGFR水平：A431、A549、BT474、CACO2、HCT116、JIMT1、MDA-MB-231、SKOV3、MCF7或SKBR3。3.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述分离的单价EGFR结合构建体是OA-CTX(v4353)或OA-EG2(v1323)。4.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述Fc是异二聚IgG1Fc，所述Fc包含至少两个CH3序列，其中所述Fc以或不以接头偶联于所述抗原结合多肽。5.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述Fc是具有根据EU编号链A中的突变T350V_L351Y_F405A_Y407V和根据EU编号链B中的突变T350V_T366L_K392L_T394W的人异二聚IgG1Fc。6.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述分离的单价EGFR结合构建体包含CDR1、CDR2和/或CDR3，并且其中所述CDR1、CDR2和/或CDR3是表B中所示的相应序列。7.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述分离的单价EGFR结合构建体结合位于EGFR的细胞外结构域中的表位。8.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述构建体是如权利要求35至73中任一项所述的构建体。9.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述单价EGFR结合构建体是无岩藻糖基化的。10.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中使所述单价EGFR结合构建体缀合于药物，任选其中所述药物是美登木素或DM1。11.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中用具有增加的功效和降低的不利作用的所述分离的单价EGFR结合构建体治疗所述受试者的时期大于用结合或特异性结合EGFR的所述相应分离的单特异性二价抗原结合构建体治疗的时期。12.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述肿瘤是表皮细胞源性癌、肺癌、乳腺癌、三重阴性乳腺癌、导管性乳腺导管癌、胃癌、卵巢癌、HER2+癌、胶质母细胞瘤、子宫颈癌、肾癌、子宫癌或结肠直肠癌。13.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述分离的单价EGFR结合构建体阻断EGF结合所述肿瘤上的EGFR。14.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述分离的单价EGFR结合构建体阻断所述肿瘤中组成性EGFR信号传导。15.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中使所述肿瘤与所述分离的单价EGFR结合构建体接触导致ADCC。16.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中使所述肿瘤与所述分离的单价EGFR结合构建体接触导致所述分离的单价EGFR结合构建体的内化。17.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述肿瘤表达的第一细胞表面EGFR水平等于或小于或小于一种或多于一种下列细胞系的第二细胞表面EGFR水平：A431、A549、BT474、CACO2、HCT116、JIMT1、MDA-MB-231、SKOV3、MCF7或SKBR3。18.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述肿瘤的样品表达小于或等于3+、小于或等于2+、或小于或等于1+的中值EGFR水平，如使用免疫组织化学(IHC)染色所评估。19.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述肿瘤表达中值为每个细胞3.5x106或更少、2.8x106或更少、1.2x106或更少、2.4x105或更少、2.6x105或更少、或4.2x104或更少个的EGFR。20.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中治疗导致使所述肿瘤萎缩，抑制所述肿瘤的生长，增加所述肿瘤的进展时间，延长所述受试者的无疾病存活期，降低转移，增加所述受试者的无进展存活期，或增加受试者群体的总体存活率。21.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述受试者被施用固定剂量的所述构建体，并且相较于用固定剂量的结合或特异性结合EGFR的所述相应分离的单特异性二价抗原结合构建体治疗的受试者，经受较小的由治疗所致的皮肤毒性，并且其中所述固定剂量基于摩尔数确定。22.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中相较于用固定剂量的结合或特异性结合EGFR的所述相应分离的单特异性二价抗原结合构建体治疗的受试者，在用固定剂量的所述构建体治疗之后，所述受试者的角质化细胞的生长的降低程度较小，并且其中所述固定剂量基于摩尔数确定。23.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述肿瘤对曲妥珠单抗和/或帕妥珠单抗和/或西妥昔单抗具有抗性，或为其所难治。24.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述受试者是人受试者。25.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述方法进一步包括提供另外的药剂。26.根据权利要求25所述的方法，其中所述另外的药剂结合HER2。27.根据权利要求25所述的方法，其中所述另外的药剂是帕妥珠单抗或曲妥珠单抗。28.根据权利要求25所述的方法，其中同时提供所述单价EGFR结合构建体和所述另外的药剂。29.根据权利要求25所述的方法，其中分开提供所述单价EGFR结合构建体和所述另外的药剂。30.根据权利要求25至29中任一项所述的方法，其中所述另外的药剂是第二分离的抗原结合构建体。31.根据权利要求30所述的方法，其中所述第二分离的抗原结合构建体t结合或特异性结合HER2或HER2的细胞外结构域。32.根据权利要求30所述的方法，其中所述第二分离的抗原结合构建体结合或特异性结合HER2的ECD2和/或ECD4。33.根据权利要求24至32中任一项所述的方法，其中所述治疗导致使所述肿瘤萎缩，抑制所述肿瘤的生长，增加所述肿瘤的进展时间，延长所述受试者的无疾病存活期，或增加所述受试者的存活期。34.根据权利要求30所述的方法，其中所述第二分离的抗原结合构建体与如权利要求35至73中任一项所述的分离的单价EGFR结合构建体相同，例外之处是所述第二分离的抗原结合构建体的抗原结合多肽结合或特异性结合HER2或HER2的细胞外结构域。35.一种分离的单价抗原结合构建体，其包含：至少一个包含重链可变结构域的抗原结合多肽，其中所述抗原结合多肽结合或特异性结合表皮生长因子受体(EGFR)；以及异二聚Fc，所述Fc包含至少两个CH3序列，其中所述Fc以或不以接头偶联于所述抗原结合多肽；其中相较于结合或特异性结合EGFR的分离的相应单特异性二价抗原结合构建体，所述单价抗原结合构建体以更大的Bmax选择性和/或结合或特异性结合EGFR；并且其中二聚化CH3序列具有约68℃或更高的解链温度(Tm)。36.根据权利要求35所述的分离的单价抗原结合构建体，其中所述分离的单价EGFR结合构建体是OA-CTX(v4353)或OA-EG2(v1323)。37.根据任何前述构建体权利要求所述的分离的单价抗原结合构建体，其中在大于所述构建体的观察平衡常数(Kd)直至饱和浓度的浓度下观察到在构建体与靶标比率1:1下，相对于所述单特异性二价抗原结合构建体在Bmax方面增加。38.根据任何前述构建体权利要求所述的分离的单价抗原结合构建体，其中相对于结合或特异性结合EGFR的分离的相应单特异性二价抗原结合构建体，所述分离的单价抗原结合构建体对EGFR具有较低亲和力。39.根据任何前述构建体权利要求所述的分离的单价抗原结合构建体，其中所述分离的单价抗原结合构建体结合位于EGFR的细胞外结构域1、2、3或4或EGFR的细胞外结构域中的表位。40.根据任何前述构建体权利要求所述的分离的单价抗原结合构建体，其中所述抗原结合多肽进一步包含轻链可变结构域、轻链CL1结构域和/或重链CH1结构域。41.根据任何前述构建体权利要求所述的分离的单价抗原结合构建体，其中所述重链可变结构域的氨基酸序列与表B中所列的EGFR特异性抗原结合多肽重链可变结构域的氨基酸序列至少80、85、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99或100％同一，并且其中所述轻链可变结构域的氨基酸序列与表B中所列的EGFR特异性抗原结合多肽轻链可变结构域的氨基酸序列至少80、85、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99或100％同一。42.根据任何前述构建体权利要求所述的分离的单价抗原结合构建体，其中所述轻链CL1结构域的氨基酸序列与表B中所列的EGFR特异性抗原结合多肽轻链CL1结构域的氨基酸序列至少80、85、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99或100％同一，并且其中所述重链CH1结构域的氨基酸序列与表B中所列的EGFR特异性抗原结合多肽重链CH1结构域的氨基酸序列至少80、85、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99或100％同一。43.根据任何前述构建体权利要求所述的分离的单价抗原结合构建体，其中所述抗原结合多肽是能够结合抗原的Fab片段、scFv、sdAb、抗原结合肽或蛋白质结构域。44.根据任何前述构建体权利要求所述的分离的单价抗原结合构建体，其中所述抗原结合多肽包含重链多肽和轻链多肽。45.根据权利要求44所述的分离的单价抗原结合构建体，其中所述重链多肽包含与表B中所列的EGFR特异性抗原结合多肽重链的氨基酸序列至少80、85、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99或100％同一的氨基酸序列，并且所述轻链多肽包含与表B中所列的EGFR特异性抗原结合多肽轻链的氨基酸序列至少80、85、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99或100％同一的氨基酸序列。46.根据任何前述构建体权利要求所述的分离的单价抗原结合构建体，其对EGFR具有小于或等于1.16E-8M至8.51E-10M的结合亲和力(KD)。47.根据任何前述构建体权利要求所述的分离的单价抗原结合构建体，其在结合于EGFR时相对于对照抑制A431细胞生长，和/或相对于对照增加对BT-474细胞的ADCC介导的靶标细胞溶解％，和/或导致EGFR的内化，和/或导致EGFR的下调。48.根据任何前述构建体权利要求所述的分离的单价抗原结合构建体，其中在结合细胞上的EGFR后，所述构建体被内化至所述细胞中。...

【专利技术属性】
技术研发人员：G·Y·K·吴，P·W·Y·陈，G·R·威克曼，
申请(专利权)人：酵活有限公司，
类型：发明
国别省市：加拿大;CA