猪5号染色体上与窝产仔数相关的SNP位点制造技术

本发明专利技术涉及与猪产仔数性状相关的SNP位点，具体涉及猪5号染色体上一个与窝产仔数相关的SNP位点及其引物，属生物技术领域。该SNP位点为基因组版本NCBI Build Sscrofa 10.2的Chr5:9008762；该位点的等位基因为T和C，有C/C、T/C和T/T三种基因型，扩增该位点的引物及延伸引物为：Chr5-PCRU：5’-AGG TCT CCT GGG GAG CTT-3’；Chr5-PCRL：5’-GGG CTC GAC CCT GTG ATC-3’；Chr5-SNPU：5’-GAA AAG CTT CAC AGG CCA AGA ATA T-3’。带有T/C基因型的猪产仔数高于T/T基因型，C为提高猪产仔数的有益等位基因并且T/C杂合猪产仔数最高。本发明专利技术的有益效果在于：全基因组重测序方法能够快速、批量地筛选与性状相关的SNP位点或基因，基因组版本NCBI Build Sscrofa 10.2的Chr5:9008762这个SNP位点能够作为遗传标记用于猪的遗传育种提高母猪的产仔数。

【技术实现步骤摘要】

:本专利技术涉及与猪产仔数性状相关的SNP位点，具体涉及猪5号染色体上一个与窝产仔数相关的SNP位点及其引物，属生物

技术介绍
:猪的产仔数性状是猪繁殖性状的主要组成部分，提高猪产仔数对提高养猪业的总体经济效益意义重大。我国的太湖猪以高产而闻名，窝产仔数比大多数其它中国地方猪种以及国外猪种的窝产仔数多4-5头(《中国猪品种志》张仲葛主编，上海科技出版社，1986)。太湖猪中与高产仔数相关的多态位点，能够作为遗传标记用于提高母猪的产仔数。全基因组重测序方法已广泛应用于各个物种的相关研究，它能够快速全面地筛选出与性状、功能相关的基因或突变位点，弥补了 QTL定位以及候选基因方法费时费力、单一等不足。在国内外尚未见本专利技术中SNP位点与猪窝产仔数相关的公开文献报道。
技术实现思路
:本专利技术的目的是提供猪5号染色体上一个与窝产仔数相关的SNP位点及其引物。本专利技术选择了二花脸猪(太湖猪的一种)，藏猪，巴马香猪，莱芜猪，及滇南小耳猪5个中国地方猪种以及野猪进行了全基因组重测序。6个猪种的重测序个体数分别为11个，11个，9个，10个，10个和10个。重测序数据跟参考本文档来自技高网...

【技术保护点】
猪5号染色体上一个与产仔数相关的SNP位点在白色杜洛克×二花脸猪杂交资源群F2代母猪产仔数分子标记辅助选择中的应用，其特征在于：所述SNP位点的等位基因为T和C，有C/C、T/C和T/T三种基因型，带有T/T基因型的母猪产仔数最低，C为提高猪产仔数的有益等位基因并且T/C杂合猪产仔数最高。

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员：张亚平，黄路生，谢海兵，任军，艾华水，徐丹，
申请(专利权)人：中国科学院昆明动物研究所，江西农业大学，
类型：发明
国别省市：云南;53