一种水稻光敏不育基因pms3检测和分型方法技术

本发明专利技术公开了一种水稻光敏不育基因pms3检测和分型方法，包括以下步骤：步骤一、提取水稻种子或叶片中基因组DNA；步骤二、检测用通用引物、野生型(58-P)和突变型(58S-P)NFQ特异性探针的设计与合成，将引物稀释到36微摩尔，探针稀释到8微摩尔备用；步骤三、建立PCR体系、扩增与分析；步骤四、通过步骤三的分析结果，对水稻光敏不育基因pms3进行分型，计算水稻光敏不育基因pms3中突变型(58S-P)的纯度；本发明专利技术的方法能快速鉴别水稻pms3不育系，具有检测灵敏度高、特异型好、检测时间短，可在1-2小时内完成对pms3基因野生型和突变型的检测和分型。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于基因检测领域，具体涉及一种水稻光敏不育基因pms3检测和分型方 法。
技术介绍
我国是世界上最早种植水稻的国家之一，目前在我国有过半人口以水稻作为膳食 中主粮。水稻杂交育种方式大大增加了水稻的产量和质量，是目前我国水稻增产的主要方 式，在国家粮食战略中占有重要地位。目前水稻杂交选育主要有三系法和两系法，与三系法 相比，两系法简化繁殖，制种程序，降低种子生产成本，使水稻产量在现有杂交水稻基础上 实现更高产目标。但两系法中不育系在制种过程中孕穗期遇低温会自交结实，另外不育起 点温度漂变等导致育种失败现象常有发生，对两系法育种十分不利。因此开发新的水稻不 育基因标记方法，加速不育系基因的鉴别，缩短育种周期和提高制种质量，对推动两系法杂 交水稻的育种具有重要意义。近年来华中农业大学张启发院士团队定位并克隆了水稻光敏不育基因 被定位于第12染色体上，比较测序发现农垦58S与农垦58仅在pms3(GenBank:jq317785.1) 存在一个SNP差异，在790位点处C到G的突变。通过遗传转化实验表明pms3通过RNA发挥作 用，编码一个长链非编码RNAamd表达下本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种水稻光敏不育基因pms3检测和分型方法，其特征在于：所述检测和分型方法包括以下步骤：步骤一、提取水稻种子或叶片中基因组DNA；步骤二、检测用通用引物、野生型(58‑P)和突变型(58S‑P)NFQ特异性探针：上游引物PGMS‑F:GGTGAAGCAAAGAAGTGCATTG下游引物PGMS‑R:CTGAACTGCGTGTTGATAAAAATTTT野生型58‑P探针:FAM‑TTGTGTACCATCCATCAAG‑NFQ突变型58S‑P探针:FAM‑TTGTCTACCATCCATCAAG‑NFQ将引物稀释到36微摩尔，探针稀释到8微摩尔备用；步骤三、建立PCR体系；所述建立PCR体系，荧光P...

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员：宗凯，姚剑，周莉质，陈雪娇，李云飞，孙娟娟，余晓峰，郑海松，吕侠影，王满满，
申请(专利权)人：安徽出入境检验检疫局检验检疫技术中心，
类型：发明
国别省市：安徽;34