用于产生单糖的方法技术

技术编号:11829750 阅读:68 留言:0更新日期:2015-08-05 13:40
本发明专利技术涉及用于使用微生物来产生单糖的方法。该微生物具有糖基转移酶和糖苷酶,其一起工作以合成所期望的游离形式的单糖,其中通过使用内源性提供的核苷酸活化的单糖、糖基化适宜的受体底物并通过水解反应释放所期望的单糖。再循环并仅需要催化量的用于反应所需要的受体底物。以游离形式来产生单糖并且获取自所培养的微生物的上清。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】【专利说明】 本专利技术涉及用于产生单糖、尤其是用于产生L-岩藻糖或其他稀有单糖例如N-乙 酰基神经氨酸的方法,借此在该生产方法中使用微生物。 通过在能量储存、结构功能、信号传导、信息存储等中承担关键功能,糖类在所有 形式的生命中是必要的。对于此任务,自然界合成了几种主要单糖如葡萄糖、甘露糖、果糖、 岩藻糖、核糖、唾液酸等,以及用于更加专门应用的若干次要单糖,如例如D-阿洛糖。 虽然一些单糖可以大量地并以合理的成本获自自然界(例如葡萄糖和果糖), 但大多数单糖是相当稀有的并且仅可以少量存在于自然界中,如例如L-岩藻糖(6-脱 氧-L-半乳糖)。 对于单糖的商业化生产,几乎仅有获自自然界的寡糖被用作来源。这些寡糖是酸 水解的并且从释放的单糖来纯化单种糖。由于单糖的高化学相似性(彼此之间的差异大部 分仅在于个别羟基的取向),所以以纯形式分离单种单糖是相当费力和昂贵的。 L-岩藻糖代表这样的稀有糖,其目前是经由复杂寡糖的水解而获自藻类或细菌来 源。为了从复杂的水解产物来纯化单种单糖,经常必须使用有毒化学物质,如例如乙酸铅 和过量的有机溶剂。因此,从寡糖的复杂的水解产物来分离单种单糖具有挑战性(由于释 放的单种单糖的高化学相似性)并且是环境有害的(由于过度使用有毒化学物质,如碳酸 铅)。此外,在自然界中在某些糖中富含的寡糖的可用性可以是相当受限制的并且也是高度 可变的(由于季节变化)。L-岩藻糖代表这样的稀有单糖,其传统上是通过含岩藻糖的多 糖的酸水解来获得的。岩藻糖主要源自多糖岩藻多糖,一种岩藻聚糖单硫酸酯,存在于所有 常见的棕色海草中,其包括鹿角菜科(Fucaceae)和海带科(Laminariaceae)。今天,L-岩 藻糖的大量获得主要是通过采集属于鹿角菜科的棕色海草,其可在全球范围内找到,但大 量存在于大西洋的欧洲海岸。从海岸大规模收获棕色海草起环境关注并且受限于某些环保 法规。 例如,JP 2000351790公开了用于提取岩藻多糖和用于从提取的岩藻多糖来获得 和分离含岩藻糖的寡糖的方法。 除从棕色海草水解岩藻多糖之外,最近,专利出版物表明,还可以经由包含天然存 在的L-岩藻糖的细菌多糖的水解来获得L-岩藻糖:W0 2012/034996 Al公开了属于肠杆 菌科(Enterobacteriaceae)的菌株,该菌株能够产生包含L-岩藻糖的胞外多糖。为了生 产L-岩藻糖,回收通过上述菌株产生的多糖并对其进行水解,例如通过用硫酸或盐酸加以 处理。 除从多或寡糖水解产物提取L-岩藻糖之外,还已经开发了开始于其他单糖如 L-阿拉伯糖、D-半乳糖、L-鼠李糖、D-甘露糖和D-葡萄糖的用于L-岩藻糖的若干合成途 径。通常,这些化学合成的产率往往相当差并且涉及若干步骤。除涉及若干合成步骤之外, 大量的保护基团化学反应还必须用于L-岩藻糖的化学合成。通常,相比于从自然界提取, 还没有证明单糖的大规模化学合成是经济上可行的。 因此,目前,以纯形式制备任何单糖在将其他单糖与目标单糖纯化分开方面需要 显著努力,往往涉及大量的有机溶剂和其他有毒化学物质。因此,单一的所期望的单糖如例 如L-岩藻糖的排他积累会是非常有用的。大多数微生物在它们能够利用的单糖的种类方 面是受限的。此外,在同时可以获得几种单糖作为碳源时,它们对某些单糖经常施加强的偏 好。 鉴于上述,本专利技术的一个目的是提供用于生产游离形式的单一所期望的单糖的新 方法,借此,可以快速和有效地,即大规模和成本有效地获得单糖而没有负面的环境影响。 通过,即大规模地、以游离形式、并利用微生物来实现上述和 其他目的,该方法包括以下步骤: a)提供微生物,其具有用于合成单糖的以下酶活性:i)糖基转移酶,其特异性地 能够将单糖从活化的核苷酸单糖转移到受体-底物以形成受体-单糖-底物,以及ii)糖 苷酶,其能够从受体-底物释放单糖;其中微生物不能代谢该单糖; b)在适合生长微生物的培养基中培养微生物,借此产生游离形式的单糖, c)从培养基回收游离单糖。 此外,通过微生物、优选重组宿主微生物解决该目标,以及它在生产游离形式的单 糖中的应用,该微生物包含i)糖基转移酶,其特异性地能够将单糖从活化的核苷酸单糖转 移到受体-底物以形成受体-单糖-底物,以及ii)糖苷酶,其能够从受体-底物释放单糖; 其中微生物不能代谢单糖。 以这种方式来完全实现本专利技术的目的。 先前从未描述过申请人的方法,并且使用微生物,该微生物具有两种特定酶活性, 即糖基转移酶和糖苷酶,其中糖基转移酶特异性地能够将单糖从活化的核苷酸单糖(其是 内源性存在的或外部提供的)转移到受体-底物使得形成受体-单糖-底物。在随后的步 骤中,糖苷酶从受体-底物释放单糖使得提供游离单糖。 虽然在本专利技术中可以采用具有上述酶促特点的未修饰的微生物,但根据本专利技术的 一个方面,微生物是重组微生物,其中重组微生物已被转化以包含以下至少之一 :i)编码 并不天然存在于微生物中的糖基转移酶的核酸序列,和/或ii)编码并不天然存在于所述 微生物中的糖苷酶的核酸序列。换句话说,可以转化重组微生物以包含编码并不天然存在 于微生物中的糖基转移酶的核酸序列,或编码并不天然存在于所述微生物中的糖苷酶的核 酸序列,或可以转化重组微生物以包含两者,即编码并不天然存在于微生物中的糖基转移 酶的核酸序列和编码并不天然存在于所述微生物中的糖苷酶的核酸序列。 借助于新提供的方法和新提供的微生物(重组或未重组的),首次可以以游离形 式并大量地产生所期望的单糖,而不需要化学品或繁复的工艺步骤。根据本专利技术的方法代 表微生物发酵方法,该方法适合用于工业大规模生产稀有或其他单糖,其可以容易地获取 自在其中培养微生物的培养基。 通过使用根据本专利技术的微生物,即表达糖基转移酶的微生物,可以进行内源的或 外部提供的受体-底物的有效的岩藻糖基化,并且通过同时表达糖苷酶,可以产生在培养 基中大量的游离单糖的前所未有的积累。在存在受体底物的情况下,在游离单糖的合成中, 糖基转移酶和糖苷酶一起协同工作,从而仅需要催化量的适宜受体。因此,通过糖基转移 酶,所提供的受体底物被岩藻糖基化,并且通过接受糖基转移酶反应的糖基化产物的糖苷 酶的作用再循环(recycle)所产生的糖基化产物。 如在本文中所使用的以及如在本专利技术的领域中通常理解的,表述"单糖"是指糖 类(碳水化合物,carbohydrates)的最基本单元。单糖是糖的最简单形式并且通常是无色 的、水溶性的、结晶固体。单糖的实例包括葡萄糖、果糖、半乳糖、木糖和核糖。单糖是二糖 (disaccharides)如鹿糖以及多糖如纤维素和淀粉的结构单元。如在本文中所使用的以及 如在现有技术状态中通常理解的,"寡糖〃是指包含两个或更多个单糖的糖聚合物。 术语〃编码…的核酸序列〃通常是指任何多核糖核苷酸或多脱氧核糖核苷酸,其 可以是未修饰的RNA或DNA或者修饰RNA或DNA,并且通常表示编码某些多肽或蛋白的基 因。该术语包括但不限于单链和双链DNA ;为单链和双链区或单链、双链和三链区的混合物 的DNA ;单链和双链RNA ;以及为单链和双链区的混合物的RNA ;包含DNA和RNA的杂合分 子,其可以是单链的,或更通常地是双链、或三链区,或单链和本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种使用微生物生产游离形式的单糖的方法,所述方法包括以下步骤:a)提供微生物,所述微生物具有用于合成所述单糖的以下酶活性:i)糖基转移酶,所述糖基转移酶特异性地能够将所述单糖从活化的核苷酸单糖转移到受体‑底物以形成受体‑单糖‑底物,以及ii)糖苷酶,所述糖苷酶能够从所述受体‑底物释放所述单糖;其中所述微生物不能代谢所述单糖;b)在适合生长所述微生物的培养基中培养所述微生物,借此产生游离形式的所述单糖,c)从所述培养基回收所述游离的单糖。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】...

【专利技术属性】
技术研发人员:斯特凡·延内魏因卡特娅·帕尔沙特
申请(专利权)人:詹尼温生物技术有限责任公司
类型:发明
国别省市:德国;DE

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