一种油藏微生物基因组DNA提取方法技术

技术编号:11476239 阅读:116 留言:0更新日期:2015-05-20 06:05
本发明专利技术涉及微生物采油技术领域,特别涉及一种油藏微生物基因组DNA提取方法,具体包括以下步骤:有机溶剂萃取去除样品中原油对提取的干扰,并释放油水界面的微生物,以中空纤维膜过滤过滤水相富集微生物,以物理破壁方法结合溶菌酶、蜗牛酶、蛋白酶、十二烷基硫酸钠等裂解细胞,在高盐条件下通过苯酚、氯仿去除蛋白质等有机大分子组份,随后通过核酸抽提及沉淀,获得油藏微生物基因组DNA。本发明专利技术所述方法快捷简单,整个提取过程可在10小时之内完成;提取效率高,所获基因组纯度高。

【技术实现步骤摘要】

【技术保护点】
一种油藏微生物基因组DNA提取方法,其特征在于以下包括步骤:(1)有机溶剂萃取除去原油,释放油水界面微生物在液相样品中加入石油醚,其与液相样品的体积比为1:4~6,充分震荡混合均匀后静置1h~2h,使有机相和水相分层,取下层水相。(2)收集菌体将上述所得的水相,利用蠕动泵,控制压力为0.5MPa,在0.22μm的中空纤维素膜过滤器进行过滤,收集菌体。(3)裂解微生物细胞首先,将上述过滤器的中空纤维素膜,剪碎与石英砂相混合,放入含有800μl~1000μl提取缓冲液的离心管中,加入450μl1xTE和50μl10mg/mL溶菌酶和10μl100mg/mL蜗牛酶,吹吸混匀,37℃孵育1h,每隔15min颠倒混匀一次,其次,加入600μl裂解液,吹吸混匀,涡旋震荡10min后,再加入30μl20mg/mL蛋白酶K,吹吸混匀,55℃孵育1h,每隔15min颠倒混匀一次,最后,4℃12000rpm离心10min,转移上清至另一个干净的1.5mL离心管。(4)DNA提纯首先,按照体积比为25:24:1的比例加入酚、氯仿和异戊醇,充分混匀,‑20℃静置2min,4℃12000rpm离心5min,其次,转移上清至另一个干净的1.5mL离心管,按照体积比为24:1的比例加入氯仿和异戊醇,充分混匀,‑20℃静置2min,4℃12000rpm离心5min,接着,转移上清至另一个干净的1.5mL离心管,加入1/10体积的3M醋酸钠,加入醋酸钠后的终体积2倍体积预冷的无水乙醇,充分混匀,‑20℃沉淀2h,4℃12000rpm离心10min,弃上清,在次,加入600μl预冷的70%乙醇洗涤DNA沉淀,颠倒混匀,4℃12000rpm离心5min,弃上清,最后,重复洗涤一次,吸干离心管中的残留液体,待离心管风干后,加入30μl无菌水和0.5μl10mg/mL的RNase A,吹吸混匀,取3μl电泳检测,剩余置于‑20℃保存。...

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:郝滨李彩风曹功泽王静宋欣袁长忠徐闯徐鹏王刚曹嫣镔宋永亭
申请(专利权)人:中国石油化工股份有限公司中国石油化工股份有限公司胜利油田分公司采油工艺研究院
类型:发明
国别省市:北京;11

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