本公开提供了用于制备用于测序的核酸样品的组合物、方法和系统，其包括将衔接子附接至模板插入序列，将模板核酸分子附接至支持物，富集。本文进一步提供了通过在扩增期间保留模板核酸分子的两条链来进行错误校正的方法。

本文公开了将以下各项组合的系统和方法：(i)使用第一光学变换来产生被引导到被成像物体的图案化照明，使得由所述物体反射、透射、散射或发射的光包括关于所述物体的原本不会获得的高分辨率空间信息；以及(ii)使用第二光学变换，所述第二光学变换在...

本文提供了用于处理和/或检测样品的方法。方法可包括在第一区域和第二区域之间提供屏障，其中第一区域包含样品，其中屏障将第一区域保持在与第二区域的第二气氛不同的第一气氛下，其中屏障的一部分包括相干运动的流体；和使用至少部分地包含在第一区域中...

本文提供了用于诸如在工业规模上的高通量测序的方法、系统和设备。测序系统和/或设备可以包括一个或多个站，所述一个或多个站可以与一个或多个其他站并行和/或独立地操作。与一个或多个其他站并行和/或独立地操作。与一个或多个其他站并行和/或独立地...

本公开提供了用于富集和分析例如生物样品的模板核酸分子的组合物、方法和系统。本文进一步提供了使用多个独特珠子种类的方法，每个珠子种类都包含独特的相同引物分子组。个珠子种类都包含独特的相同引物分子组。个珠子种类都包含独特的相同引物分子组。

本公开提供了包含与支持物偶联并且包含一个或多个可切割或可切除部分的核酸分子的组合物。还提供了富集并测序核酸分子的方法。组合物。还提供了富集并测序核酸分子的方法。组合物。还提供了富集并测序核酸分子的方法。

本发明涉及一种通过将双链多核苷酸连接到多个不同的靶多核苷酸双链体上来生成不同多核苷酸分子文库的方法，所述双链多核苷酸包含：(a)包含退火部分和突出部分的第一链；以及(b)基本上由退火部分组成的第二链，其中所述第二链与所述第一链的所述退火...

本公开内容提供了使用分子条形码对序列进行准确碱基判定的方法。用于对核酸分子进行测序的方法可以包括：(a)使用条形码分子对来自样品的核酸分子进行条形码化，以生成包含条形码序列的条形码化核酸分子；(b)对条形码化核酸分子进行测序以生成测序信...

本文描述了用于确定来自mRNA分子的目的区域的序列的方法。测序的多核苷酸可以包含条形码区域、均聚物区域(例如，poly

本公开提供了用于核酸序列鉴定的方法。所述方法可以包括使多个核酸分子与包含一定浓度的核苷酸的反应混合物接触，这导致核酸分子的部分标记。所述方法可包括在前一测序循环中的可逆终止子的去封闭完成之前开始下一可逆终止的测序循环。终止的测序循环。终...

本文描述了用于测量疾病(如癌症)水平的方法、设备和系统，例如测量来自个体的与患病组织(如癌症组织)相关的样品中的核酸分子(如无细胞DNA)的分数。还描述了用于测量个体中疾病的存在、复发、进展或消退的方法、设备和系统。某些方法包括使用与个...

本文描述了针对多核苷酸生成偶联测序读段对的方法，以及分析偶联测序读段对的方法。可以分析偶联测序读段对来检测多核苷酸变体，包括在偶联测序读段对内不直接测序的基因座处。其他分析方法包括使用偶联测序读段对来构建或验证共有序列。可以如下针对多核...

本文描述了用于检测测试样品中的短遗传变体的方法。在一些示例性方法中，使用一个或匹配得分来判定短遗传变体，所述匹配得分使用从测试核酸分子获得的一个或多个测序数据集来确定，其中通过使用根据流动循环顺序在分开的核苷酸流中提供的非终止核苷酸对测...

提供了用于分析物检测和分析的系统和方法。系统可包括开放衬底。开放衬底可被配置为旋转或以其他方式移动。开放衬底可包括单独可寻址位置的阵列，其中分析物固定在其上。可以在空间上对底物进行索引以识别来自一种或多种来源的核酸分子和/或其序列，以及...

本公开提供用于准确且有效地评估属的基因组的方法、系统和介质。系统和介质。系统和介质。

本公开提供使用诸如聚合酶链式反应(PCR)的技术来提高核酸测序的效率和准确度的方法和过程。即使珠和/或核酸模板在乳液中的分布大于泊松分布，本文所述的方法也可用于实现克隆扩增。PCR方法可以包括产生包含至少两个珠和/或至少两个核酸分子的分...

本公开提供用于标记底物例如核苷酸、蛋白质、抗体、脂质和细胞的标记试剂。本文提供的标记试剂可包括荧光标记和半刚性接头。本文还提供了用于使用包含此类标记试剂的材料进行核酸测序的方法。酸测序的方法。酸测序的方法。

本文提供了用于处理和/或检测样品的方法。方法可包括在第一区域和第二区域之间提供屏障，其中第一区域包含样品，其中屏障将第一区域保持在与第二区域的第二气氛不同的第一气氛下，其中屏障的一部分包括相干运动的流体；和使用至少部分地包含在第一区域中...

本文提供了用于分析物检测和分析的系统和方法。系统可以包括被配置为旋转的开放衬底。开放衬底可以包括固定的分析物的阵列。在衬底旋转期间，可以经由离心力引导包括多个探针的溶液遍及阵列，以使多个探针中的至少一个与分析物中的至少一个偶联以形成结合...

本公开内容提供了用于序列的准确和有效的邻近序列感知碱基判定的方法和系统。在一方面，本文公开了用于对核酸分子进行测序的方法，其包括：(a)对核酸分子进行测序以生成多个序列信号；和(b)至少部分基于以下来确定所述核酸分子的碱基判定：(i)多...