当前位置: 首页 > 专利查询>厦门大学专利>正文

华法林个体化用药相关基因多态性检测试剂盒及其制备方法与应用技术

技术编号:20382448 阅读:21 留言:0更新日期:2019-02-19 23:51
华法林个体化用药相关基因多态性检测试剂盒及其制备方法与应用,涉及基因多态性的检测。检测试剂盒设有盒体、隔板、盒盖、WP PCR混合液瓶、WP酶混合液瓶、WP标准对照瓶、WP阴性对照瓶、扩增试剂和对照试剂。制备扩增试剂;制备对照试剂,所述对照试剂包括MP标准对照和MP阴性对照;将扩增试剂和对照试剂设在盒体内,即得华法林个体化用药相关基因多态性检测试剂盒。华法林个体化用药相关基因多态性检测试剂盒在检测华法林个体化用药相关基因多态性位点的基因型中应用。简便快速、单反应可检测多个位点、耗时短。

Warfarin Individualized Drug Use Related Gene Polymorphism Detection Kit and Its Preparation and Application

Warfarin Individualized Drug Use Related Gene Polymorphism Detection Kit and its preparation method and application involve the detection of gene polymorphism. The detection kit consists of a box, a separator, a lid, a WP-PCR mixed liquid bottle, a WP enzyme mixed liquid bottle, a WP standard control bottle, a WP negative control bottle, an amplification reagent and a control reagent. Preparation of amplification reagent; preparation of control reagent, the control reagent includes MP standard control and MP negative control; the amplification reagent and control reagent are set in the box, that is, warfarin individual drug-related gene polymorphism detection kit. The application of warfarin individualized drug use related gene polymorphism detection kit in the detection of warfarin individualized drug use related gene polymorphism loci genotype. Simple, fast, single reaction can detect multiple loci, which takes less time.

【技术实现步骤摘要】
华法林个体化用药相关基因多态性检测试剂盒及其制备方法与应用
本专利技术涉及基因多态性的检测,尤其是涉及华法林个体化用药相关基因多态性检测试剂盒及其制备方法与应用。
技术介绍
华法林是一种香豆素类口服抗凝药,通过抑制维生素K及其2,3-环氧物(即维生素K环氧化物)的相互转化而发挥抗凝作用。华法林是目前临床上应用最广泛的口服抗凝药,在临床使用近60年,主要用于预防和治疗静脉血栓、心肌梗塞、缺血性休克、肺栓塞等多种血栓性疾病和心脏人工瓣膜置换术、人工血管移植术等。由于华法林治疗窗较窄(剂量不足有血栓风险,过量服用可出现致命性出血)、个体间剂量差异大(达到适宜抗凝效果的个体间剂量差异可达10~20倍)、受药物或食物影响较大,使得它位居严重不良反应药物的前10名。研究表明,华法林的剂量需求受两方面因素影响:一是非遗传因素,主要包括年龄、性别、身高、体重、疾病状态、合并用药等;二是遗传因素,主要包括与华法林药代动力学和药效学相关的蛋白或酶的基因多态性,影响蛋白的表达或酶的活性,从而增加或降低华法林的疗效,是不同个体间的用量产生差异。近年来国内外多项研究显示,遗传因素是造成个体间华法林维持剂量差异的主要原因之一[1,2],这些遗传因素包括CYP2C9、VKORC1、CYP4F2等约30个基因上的基因多态性位点。华法林在体内代谢的关键酶为肝脏细胞色素氧化酶P450超家族的第二亚家族的CYP2C9蛋白,该酶将华法林代谢为无活性成分。人CYP2C9基因具有遗传多态性,其中中国人群常见的多态性包括CYP2C9*3(rs1057910)[3,4]、CYP2C9C-65(rs9332127)[5]等基因多态性位点,这些位点突变后,基因编码酶的活性较野生型降低,导致患者对华法林的代谢及清除能力降低,临床表现出对华法林敏感,需要减少给药剂量以减少不良反应的发生。华法林主要通过作用于维生素K还原酶复合物(VKORC),抑制维生素K在肝脏细胞内合成凝血因子,从而发挥抗凝作用。研究表明,编码VKORC蛋白的VKORC1基因多态性也会导致VKORC酶活性改变,从而影响华法林的抗凝效果。其中,VKORC1基因-1639位点的A/G基因多态性位点(rs9923231)可导致基因启动子活性差异,与野生型AA基因型相比,GG和AG基因型启动子活性高,凝血因子生成较多,患者临床表现为华法林抵抗[6]。CYP4F2是CYP超家族成员之一,主要存在于肝脏和肾脏,为维生素K的单氧酶,近年来研究发现,CYP4F2基因c.1297C>T(rs2108622)多态性能够影响约1%~2%的华法林个体差异代谢[7],TT患者需要提高华法林剂量,方能达到相同的抗凝效果。综上所述,CYP2C9*3、CYP2C9C-65、VKORC1-1639G>A和CYP4F2c.1297C>T基因多态性是影响中国人群华法林个体剂量差异的主要因素。在用药前进行这些基因多态性检测,结合患者身高、体重等临床信息,有助于为患者作出合理的华法林剂量,缩短调整时间,降低严重不良反应的发生率。目前检测上述华法林个体化剂量相关多态性的方法交多,包括限制性内切酶片段多态性分析(RFLP)[8]、基因芯片[9]、等位基因特异性PCR[10]、焦磷酸测序[11]、Sanger测序[12]等等,但这些方法存在然而这些技术均存在缺点,例如耗时、操作繁琐、需要昂贵的仪器、检测成本高或对技术人员要求高、需要PCR后处理、易造成PCR产物污染等,大多数方法并不适合用于临床,尤其不适合在包括我国在内的广大发展中国家和地区的临床推广和使用。熔解曲线(DissociationCurve)是指随温度升高反映DNA的双螺旋结构解链的曲线。总的DNA双螺旋结构解链一半的温度称为熔解温度,即熔点(Tm),熔点是双链DNA固有的属性,不同序列的双链DNA,Tm值不同,这与双链DNA的长度、碱基组成相关。在实时PCR(Real-timePCR)技术推出来之后,熔解曲线技术常用来分析基于荧光染料的实时PCR扩增的特异性,根据PCR产物的Tm值的大小判定产物是目标产物还是非特异扩增产物。随着生物技术的发展,仪器设备分辨率的改进,目前基于荧光染料的熔解曲线技术已经发展成的高分辨熔解曲线(HighResolutionMeltingCurve)技术,该技术可以识别单个碱基的突变,中国专利CN102605076B将该技术用于CYP2C9*3和VKORC1-1639G>A的快速基因分型[13],但由于该技术本身的局限性,一个PCR反应只能同时检测一个位点,且对DNA样本质量要求和技术人员的操作要求非常高,不适合在临床实验室推广应用。参考文献:1.KesslerP.[Pharmacogeneticsofwarfarin][J].VnitrLek,2006,52Suppl1:31-34.2.GuQ,KongY,SchneedeJ,etal.VKORC1-1639G>A,CYP2C9,EPHX1691A>Ggenotype,bodyweight,andageareimportantpredictorsforwarfarinmaintenancedosesinpatientswithmechanicalheartvalveprosthesesinsouthwestChina[J].EurJClinPharmacol,2010,66(12):1217-1227.3.LiJ,WangS,BaroneJ,etal.Warfarinpharmacogenomics[J].PT,2009,34(8):422-427.4.ZhongSL,LiuY,YuXY,etal.TheinfluenceofgeneticpolymorphismsandinteractingdrugsoninitialresponsetowarfarininChinesepatientswithheartvalvereplacement[J].EurJClinPharmacol,2011,67(6):581-590.5.ChernHD,UengTH,FuYP,etal.CYP2C9polymorphismandwarfarinsensitivityinTaiwanChinese[J].ClinChimActa,2006,367(1-2):108-113.6.YangL,GeW,YuF,etal.ImpactofVKORC1genepolymorphismoninterindividualandinterethnicwarfarindosagerequirement--asystematicreviewandmetaanalysis[J].ThrombRes,2010,125(4):e159-166.7.StecDE,RomanRJ,FlaschA,etal.FunctionalpolymorphisminhumanCYP4F2decreases20-HETEproduction[J].PhysiolGenomics,2007,30(1):74-81.8.中国专利技术专利,公布号:CN106350599A.9.中国专利技术专利,授权号:CN1050185本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.华法林个体化用药相关基因多态性检测试剂盒,其特征在于设有盒体、隔板、盒盖、WP PCR混合液瓶、WP酶混合液瓶、WP标准对照瓶、WP阴性对照瓶、扩增试剂和对照试剂;所述隔板设在盒体内,盒盖设在盒体上,WP PCR混合液瓶、WP酶混合液瓶、WP标准对照瓶和WP阴性对照瓶分别插入隔板上的瓶孔内;所述扩增试剂设有WP PCR混合液和WP酶混合液,所述WP PCR混合液装在WP PCR混合液瓶内,WP酶混合液装在WP酶混合液瓶内;所述对照试剂包括WP标准对照和WP阴性对照,所述WP标准对照装在WP标准对照瓶内,WP阴性对照装在WP阴性对照瓶内。

【技术特征摘要】
1.华法林个体化用药相关基因多态性检测试剂盒,其特征在于设有盒体、隔板、盒盖、WPPCR混合液瓶、WP酶混合液瓶、WP标准对照瓶、WP阴性对照瓶、扩增试剂和对照试剂;所述隔板设在盒体内,盒盖设在盒体上,WPPCR混合液瓶、WP酶混合液瓶、WP标准对照瓶和WP阴性对照瓶分别插入隔板上的瓶孔内;所述扩增试剂设有WPPCR混合液和WP酶混合液,所述WPPCR混合液装在WPPCR混合液瓶内,WP酶混合液装在WP酶混合液瓶内;所述对照试剂包括WP标准对照和WP阴性对照,所述WP标准对照装在WP标准对照瓶内,WP阴性对照装在WP阴性对照瓶内。2.如权利要求1所述华法林个体化用药相关基因多态性检测试剂盒,其特征在于所述WPPCR混合液包括1.25×PCR缓冲液、3.75mMMgCl2、0.25mMdATP、0.25mMdCTP、0.25mMdGTP、0.25mMdTTP、0.25mMdUTP、0.06μMCYP4F2基因rs2108622位点的上游扩增引物F1、0.75μMCYP4F2基因rs2108622位点的下游扩增引物R1、0.075μMVKORC1基因rs9923231位点的上游扩增引物F2、0.75μMVKORC1基因rs9923231位点的下游扩增引物R2、1.25μMCYP2C9基因rs9332127位点的上游扩增引物F3、0.125μMCYP2C9基因rs9332127位点的下游扩增引物R3、0.075μMCYP2C9基因rs1057910位点的上游扩增引物F4、0.75μMCYP2C9基因rs1057910位点的下游扩增引物R4、0.25μMCYP4F2基因rs2108622位点的荧光探针P1、0.275μMVKORC1基因rs9923231位点的荧光探针P2、0.15μMCYP2C9基因rs9332127位点的荧光探针P3和0.25μMCYP2C9基因rs1057910位点的荧光探针P4;所述WP酶混合液包括5U/μLTaqDNA聚合酶和0.1U/μLUNG酶;所述PCR缓冲液可采用SSPPCR缓冲液或其它类型的PCR缓冲液。3.如权利要求2所述华法林个体化用药相关基因多态性检测试剂盒,其特征在于所述CYP4F2基因rs2108622位点的上游扩增引物F1、CYP4F2基因rs2108622位点的下游扩增引物R1、VKORC1基因rs9923231位点的上游扩增引物F2、VKORC1基因rs9923231位点的下游扩增引物R2、CYP2C9基因rs9332127位点的上游扩增引物F3、CYP2C9基因rs9332127位点的下游扩增引物R3、CYP2C9基因rs1057910位点的上游扩增引物F4和CYP2C9基因rs1057910位点的下游扩增引物R4的长度均为15~40bp的寡核苷酸链,Tm为50~75℃。4.如权利要求2所述华法林个体化用药相关基因多态性检测试剂盒,其特征在于所述CYP4F2基因rs2108622位点的上游扩增引物F1为上游引物,其碱基序列为:5′-ATCCCCAAAGGTGCTCACAG-3′(SEQIDNO.1);所述CYP4F2基因rs2108622位点的下游扩增引物R1为下游引物,其碱基序列为:5′-CCTTGGAATGGACAAAAACAG-3′(SEQIDNO.2);所述VKORC1基因rs9923231位点的上游扩增引物F2为上游引物,其碱基序列为:5′-AGAGGGAAATATCACAGACGCCAG-3′(SEQIDNO.3);所述VKORC1基因rs9923231位点的下游扩增引物R2为下游引物,其碱基序列为:5′-GTGATCCACCCACCTC-3′(SEQIDNO.4);所述CYP2C9基因rs9332127位点的上游扩增引物F3为上游引物,其碱基序列为:5′-GCTGTTAAGGGAATTTGTAGG-3′(SEQIDNO.5);所述CYP2C9基因rs9332127位点的下游扩增引物R3为下游引物,其碱基序列为:5′-AGGATGAAAGTGGGATCACAGG-3′(SEQIDNO.6);所述CYP2C9基因rs1057910位点的上游扩增引物F4为上游引物,其碱基序列为:5′-GATTGGCAGAAACCGGAG-3′(SEQIDNO.7);所述CYP2C9基因rs1057910位点的下游扩增引物R4为下游引物,其碱基序列为:5′-CTTACCTTGGGAATGAGATAGT-3′(SEQIDNO.8)。5.如权利要求2所述华法林个体化用药相关基因多态性检测试剂盒,其特征在于所述CYP4F2基因rs2108622位点的荧光探针P1、VKORC1基因rs9923231位点的荧光探针P2、CYP2C9基因rs9332127位点的荧光探针P3和CYP2C9基因rs1057910位点的荧光探针P4均为与靶序列杂交能生成特征熔解曲线峰并给出熔点的荧光探针,所述靶序列杂交能生成特征熔解曲线峰并给出熔点的荧光探针包括但不限于自淬灭探针、相邻探针、容忍型分子信标;所述CYP4F2基因rs2108622位点的荧光探针P1、VKORC1基因rs9923231位点的荧光探针P2、CYP2C9基因rs9332127位点的荧光探针P3和CYP2C9基因rs1057910位点的荧光探针P4均为5′末端和3′末端分别标记荧光基团和淬灭基团的自淬灭探针。6.如权利要求5所述华法林个体化用药相关基因多态性检测试剂盒,其特征在于所述荧光基团为ALEX-350、FAM、VIC、TET、CALFluorGold540、JOE、HEX、CALFlourOrange560、TAMRA、CalFluorRed590、ROX、CALFluorRed610、TEXASRED、CALFlourRed635、Quasar670、CY3、CY5、CY5.5、Quasar705中的一种;所述淬...

【专利技术属性】
技术研发人员:黄秋英李庆阁
申请(专利权)人:厦门大学
类型:发明
国别省市:福建,35

网友询问留言 已有0条评论
  • 还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。

1