冠心病lncRNA表达谱识别鉴定生物标志物及相关应用制造技术

技术编号:19384562 阅读:36 留言:0更新日期:2018-11-10 00:29
本发明专利技术提供了冠心病lncRNA表达谱识别鉴定生物标志物及相关应用;具体而言,本发明专利技术提供了检测来自待测个体的样品中以下lncRNA水平的试剂材料和/或仪器设备在制备用于诊断冠心病患病风险的检测系统中的应用:ENST00000444488.1和/或uc010yfd.1。ENST00000444488.1的表达水平升高、uc010yfd.1的表达水平下降,待测个体冠心病患病风险升高。

Identification and identification of biomarkers in coronary heart disease by lncRNA expression profiling and related applications

The invention provides biomarkers for identification and identification of lncRNA expression profiles of coronary heart disease and related applications; in particular, the invention provides reagent materials and/or instruments for detecting the following lncRNA levels in samples from individuals to be tested and their applications in preparing detection systems for diagnosing the risk of coronary heart disease: ENST00000444488.1 And / or uc010yfd.1. The expression level of ENST000004488.1 increased, uc010yfd.1 decreased, and the risk of coronary heart disease increased.

【技术实现步骤摘要】
冠心病lncRNA表达谱识别鉴定生物标志物及相关应用
本专利技术是关于冠心病lncRNA表达谱识别鉴定生物标志物及相关应用,具体而言,本专利技术是关于检测来自待测个体的样品中ENST00000444488.1等7个差异表达的lncRNA的水平的试剂材料和/或仪器设备在制备用于评估冠心病患病风险的检测系统中的应用,还涉及一种评估冠心病发病风险的检测系统。
技术介绍
冠心病(coronaryarterydisease,CAD)是全球范围内第一致死性疾病,包括其中以严重复杂著称的急性心肌梗塞(acutemyocardialinfarction,AMI),是导致全球人口发病和死亡的主要原因。《中国心血管病报告2017》报告显示,2013年中国CAD患病率合计为10.2‰,2015年中国城市和农村居民冠心病死亡率继续2012年以来的上升趋势。虽然近些年世界范围内,冠心病的预防、药品与干预政策方面都取得了很大进步,但心血管病的个体、医疗健康和社会经济负担仍在逐渐加重,情况不容乐观。因此,冠心病的诊断工作尤为重要,在分子生物学水平上,筛选生物标志物将有助于更好地诊断冠心病,也能够对冠心病的的发病机理及研究新的靶向治疗手段提供有积极帮助。动脉粥样硬化是冠心病的主要发病机理,同时也是一种慢性炎症疾病。心血管病危险因素,包括高血压、血脂异常、吸烟、过量饮酒等慢性危险因素长期刺激血管内皮,增加氧化压力、诱发炎症反应,导致内皮功能紊乱,促进动脉粥样硬化的发生;随后泡沫细胞形成,平滑肌细胞增殖并向内皮下迁移,促进纤维斑块形成;炎症反应加剧,导致斑块破裂、血栓形成,引发急性冠状动脉综合征(acutecoronarysyndrome,ACS)。因而,动脉粥样硬化过程实际上是不同类型细胞参与的相互作用的复杂过程,受到不同的编码基因和非编码基因调控(Wierda,RJ,Geutskens,SB,Jukema,JW,etal.,Epigeneticsinatherosclerosisandinflammation,JCellMolMed,2010;14:1225-1240)。长链非编码RNA(longnon-codingRNA,lncRNA)是一类转录本长度大于200nt且不编码蛋白的RNA分子,保守度较低且具有物种特异性。多项研究证明lncRNAs参与如细胞转导、染色体修饰、转录及翻译调控、以及多种疾病发生的生物进程,其在动脉粥样硬化的内皮功能紊乱、平滑肌细胞表型转化、反向胆固醇转运、泡沫细胞形成以及血管炎症等方面都具有重要调控作用(Zhou,T,Ding,JW,Wang,XA,etal.,LongnoncodingRNAsandatherosclerosis,Atherosclerosis,2016;248:51-61)。心肌梗死关联转录本(myocardialinfarctionassociatedtranscript,MIAT)是最早的识别AMI危险因素的lncRNA,其单个单核苷酸多态性位点(SingleNucleotidePolymorphism,SNP)能够改变MIAT的表达,导致对AMI的易感性(Ishii,N,Ozaki,K,Sato,H,etal.,Identificationofanovelnon-codingRNA,MIAT,thatconfersriskofmyocardialinfarction,Journalofhumangenetics,2006;51:1087-1099)。冠心病全基因组关联研究(genome-wideassociationstudies,GWAS)显示位于染色体9p21区域是最强的冠心病易感区域(Helgadottir,A,Thorleifsson,G,Manolescu,A,etal.,Acommonvariantonchromosome9p21affectstheriskofmyocardialinfarction,Science(NewYork,N.Y.),2007;316:1491-1493;McPherson,R,Pertsemlidis,A,Kavaslar,N,etal.,Acommonalleleonchromosome9associatedwithcoronaryheartdisease,Science(NewYork,N.Y.),2007;316:1488-1491;Samani,NJ,Erdmann,J,Hall,AS,etal.,Genomewideassociationanalysisofcoronaryarterydisease,TheNewEnglandjournalofmedicine,2007;357:443-453),这个区域包含一个功能性RNAINK4座反义非编码RNAANRIL(antisensenon-coingRNAintheINK4locus,ANRIL),对心血管病中具有直接调控的作用(Holdt,LM,Hoffmann,S,Sass,K,etal.,AluelementsinANRILnon-codingRNAatchromosome9p21modulateatherogeniccellfunctionsthroughtrans-regulationofgenenetworks,PLoSgenetics,2013;9:e1003588)。多项研究显示ANRIL包括动脉粥样硬化进程中的血管内皮细胞、平滑肌细胞、巨噬细胞、炎症细胞以及颈总动脉中表达,顺式调控靶基因,促进细胞增殖,抑制细胞凋亡,表型符合动脉粥样硬化的表现。为解释lncRNA如何参与调控CAD的发生发展,在冠心病病人中系统地识别差异表达的lncRNAs,筛选具有潜在的功能性lncRNA作为生物标志物,进一步用以解释其在动脉粥样硬化机制中的作用将十分必要。目前对冠心病的诊断,是基于典型症状、心电图和心肌钙蛋白(cTnI和cTnT)做出的,但这些诊断方法都各有其局限和不足。因此,寻找新的、敏感性及特异行更好的生物标志物,对冠心病进行诊断,具有重大意义。
技术实现思路
本专利技术的一个目的在于寻找新的、敏感性及特异行更好的诊断冠心病的生物标志物。本案专利技术人在一项研究中,通过lncRNA/mRNA芯片分析,获得冠心病全基因组水平lncRNA/mRNA表达谱,包括1210个差异表达的lncRNAs和890个差异表达的mRNAs。本专利技术选取了7个差异表达的lncRNA:ENST00000444488.1、uc010yfd.1、ASO3973、ENST00000602558.1、ENST00000561165.1、RNA147299_p0403_imsncRNA819和ENST00000415255.1,在独立冠心病病例对照大样本中重复验证了这7个差异表达的lncRNA,与表达谱芯片结果一致,其中ENST00000444488.1在CAD组PBMCs中显著升高至2.6倍(P<0.01),uc010yfd.1、ASO3973、ENST00000602558.1、ENST00000561165.1、RNA147299_p0403_imsncRNA819和ENST00000415255本文档来自技高网
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【技术保护点】
1.以下lncRNA作为诊断冠心病的生物标志物的应用:ENST00000444488.1和/或uc010yfd.1。

【技术特征摘要】
1.以下lncRNA作为诊断冠心病的生物标志物的应用:ENST00000444488.1和/或uc010yfd.1。2.检测来自待测个体的样品中lncRNA水平的试剂材料和/或仪器设备在制备用于诊断冠心病患病风险的检测系统中的应用,所述lncRNA包括:ENST00000444488.1和/或uc010yfd.1。3.根据权利要求2所述的应用,其中,lncRNA水平包括外周血单个核细胞中表达水平。4.根据权利要求2所述的应用,其中,lncRNA进一步包括ASO3973、ENST00000602558.1、ENST00000561165.1、RNA147299_p0403_imsncRNA819和ENST00000415255.1中的一种或多种。5.根据权利要求2所述的应用,其中,lncRNA包括ENST00000444488.1;优选进一步包括uc010yfd.1;更进一步优选包括ASO3973、ENST00000602558.1、ENST00000561165.1、RNA147299_p0403_imsncRNA819和ENST000...

【专利技术属性】
技术研发人员:顾东风王来元鲁向锋李宏帆陈恕凤陈纪春
申请(专利权)人:中国医学科学院阜外医院
类型:发明
国别省市:北京,11

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