用于数字基因表达谱的标签及其使用方法技术

技术编号:7273940 阅读:842 留言:0更新日期:2012-04-16 02:18
本发明专利技术基于目前illumina公司提供的Solexa?Single?End测序平台,针对数字基因表达谱文库(DGE)样品建库方法,设计了独特的标签序列(index1-12),通过接头将标签嵌DGE文库的3’接头中,成功的建立了数字基因表达谱标签文库(DGE标签文库)的建库方法,适合任何真核生物RNA样品的DGE标签文库构建,并成功用于solexa测序,不仅增大了DGE样品的测序通量,而且降低了solexa针对DGE测序的费用。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及核酸测序
,特别是数字基因表达谱
另外,本专利技术还涉及标签及其使用方法,以及利用标签技术构建数字基因表达谱文库的方法。本专利技术的方法特别适用于第二代测序技术,尤其是SOlexa测序技术。
技术介绍
数字基因表达谱(DigitalGene Expression Profiling,DGE)利用新一代高通量测序技术和高性能计算分析技术,能够全面、经济、快速地检测某一物种特定组织在特定状态下的基因表达情况。数字基因表达谱已被广泛应用于基础科学研究、医学研究和药物研发等领域。利用高通量测序能够得到数百万个基因的特异标签,而数字的序列信号可以准确、特异地反映对应基因的真实表达情况。这种技术甚至可以精确地检测低至一两个拷贝的稀有转录本,并精确定量高达十万个拷贝的转录本的表达量变化。由于序列无需事先设计,DGE数据具有极佳的实时性,DGE可以检测到许多未曾注释的基因和基因组部位,为新基因的发现提供了良好的线索。这一技术进步允许科学家更加全面、准确地把握全基因组的基因表达情况。目前illumina公司的Solexa测序平台提供的DGE文库制备方法有两种,分别为方法一本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:章文蔚张艳艳田方于竞龚梅花
申请(专利权)人:深圳华大基因科技有限公司深圳华大基因研究院
类型:发明
国别省市:

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