一种非模式生物microRNA预测的方法技术

本发明专利技术设计了一种预测非模式生物microRNA的方法，该方法包括如下几步流程：步骤一、从网上下载相应非模式生物基因组序列；步骤二、剔除基因组内的重复序列；步骤三、从基因组中提取出发卡环结构；步骤四、筛选去除GC含量不合适及二级结构不稳定的发卡环；步骤五、对发卡环进行预测，提取与前体microRNA特征相似的发卡环；步骤六、去掉物种间保守性较差的环部序列，并与已知所有物种的成熟体microRNA比对，获取可能存在的microRNA；步骤七、对预测结果进行统计分析。

【技术实现步骤摘要】

【技术保护点】
１．本专利技术所述的一种非模式生物ｍｉｃｒｏＲＮＡ预测的方法，其主要特征在于：步骤一、从网上下载相应非模式生物基因组序列步骤二、剔除基因组内的重复序列步骤三、从基因组中提取出发卡环结构步骤四、筛选去除ＧＣ含量不合适及二级结构不稳定的发卡环步骤五、对发卡环进行预测，提取与前体ｍｉｃｒｏＲＮＡ特征相似的发卡环步骤六、去掉物种间保守性较差的环部序列，并与已知所有物种的成熟体ｍｉｃｒｏＲＮＡ比对，获取可能存在的ｍｉｃｒｏＲＮＡ。步骤七、对预测结果进行统计分析。

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员：曾华宗，
申请(专利权)人：上海聚类生物科技有限公司，
类型：发明
国别省市：31