【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及一种文库筛选方法,特别是涉及。
技术介绍
微卫星也称简单序列重复或SSR,是植物基因组广泛分布的一类重复序列,因其具有丰富的变异,开发的分子标记具有多态性高、稳定性好、操作简单(基于PCR技术)及呈现共显性遗传等优点,目前已经广泛用于植物遗传多样性研究、品种鉴定、遗传图谱构建及标记辅助选择育种。但微卫星标记的开发过程比较复杂,需要消耗大量的人力、物力和财力,因此提高微卫星的开发效率尤为重要。近20多年发展起来的微卫星开发技术包括传统的基因组文库筛选法、基于锚定PCR技术的开发方法、单引物延伸富集法、选择杂交富集法,另外还有生物信息学法和转移扩增法,这两种方法必须要求序列信息清楚或在亲缘关系相近物种才能使用。目前上述几种方法应用最广泛的是选择杂交富集法,其余方法由于操作难度大 (单引物延伸法)、开发效率低(传统基因组文库筛选法)、特异性差(基于锚定PCR技术法)等缺点已经很少有人使用;选择杂交技术的基本步骤是首先用含微卫星的探针与片段化的植物基因组DNA杂交,再将与探针杂交的含微卫星的DNA片段洗脱下来,连接到克隆载体转化大肠杆菌构建成微卫星富集文 ...
【技术保护点】
1.一种微卫星文库筛选方法,其特征在于,该方法包括如下步骤:步骤A,锚定PCR筛选含微卫星的阳性克隆;a1,所述锚定PCR的扩增体系(10μl)为:a2,所述锚定PCR的扩增循环程序为:步骤B,阳性克隆片段大小PCR检测;b1,所述PCR检测扩增体系(10μl)为:b2,所述PCR检测的扩增循环程序为:步骤C,确定侧翼序列短的无效微卫星克隆与冗余克隆;确定侧翼序列短的无效微卫星克隆方法为:步骤A扩增筛选出阳性克隆,步骤B扩增该阳性克隆插入片段大小,步骤B扩增片段大小减去步骤A扩增片段大小即为所述微卫星一端侧翼序列长度;所述微卫星另一端侧翼序列的长度为步骤A扩增片段大小减去微 ...
【技术特征摘要】
【专利技术属性】
技术研发人员:贾小平,白俊艳,王天宇,石云素,黎裕,
申请(专利权)人:河南科技大学,
类型:发明
国别省市:41
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