在质谱仪中对解离类型的数据依赖的选择制造技术

本发明专利技术公开了用于数据依赖的质谱MS/MS或MSn分析的方法和装 置。该方法包括确定感兴趣的离子种类的电荷状态，然后至少部分地基于 确定的电荷状态，自动选择解离类型(例如，CAD，ETD，或跟有非解离电 荷还原或碰撞活化的ETD)。然后，根据选择的解离类型，解离感兴趣的 离子种类，并且收集最终的子离子的MS/MS或MSn质谱。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】
本专利技术通常涉及质谱法，更具体地涉及利用数据依赖的方法自动收集 MS/MS和MS"质谱。
技术介绍
数据依赖的收集(在各种商业实现方式中，也称为倍息依赖收集(IDA)， 数据指导分析(DDA)，和AUTO MS/MS)在质谱学领域，尤其在分析复杂 的样本中是有意义的且广泛应用的工具。如通常所述，数据依赖的收集包 括实时地利用从试验性收集的质谱中获得的数据以指导质谱仪随后的工 作；例如，质谱仪可以基于对于潜在感兴趣的离子种类的检测，在MS和 MS/MS扫描模式之间切换。在质谱仪中利用数据依赖的收集方法可以提供 自动的实时决定的能力，以使收集的数据中的有用的信息内容最大化，由 此避免或减少对于执行分析物样本的多个色谱运行或注入的需求。由于特 定的需要的目的，这些方法可以被调整，例如通过分析从生物样本屮获得 的縮氨酸的复杂混合物，增强缩氮酸识别的数量。数据依赖的收集方法的特征在于具有一个或多个输入标准，以及一个 或多个输出作用。传统的数据依赖的方法中使用的输入标准通常基于一些 参数，例如强度，强度模式，质量窗口，质量差(屮性物丢失)，荷质(m/z)包含和排出列表，以及子离子质量。使用输入标准以选择一个或多个满足 该标准的离子种类。然后，该选择的离子种类受控于输出作用(输出作用的 示例包括执行MS/MS或MSn分析和/或高分辨率扫描)。在典型的数据依赖的试验的一个示例中， 一组离子被进行质量分析，质谱强度超过指定阈值的母离子种类被顺序选择为用于MS/MS分析的母离子，其包括隔离，母 离子的解离，和子离子的质量分析的操作。用于分析缩氨酸，蛋白质，和其它生物分子的质谱仪的不断增长地使 用使得研究人员开发新的解离技术，这包括脉冲q解离(PQD)和电亍转移 解离(ETD)，这些技术相对于传统技术来说提供了附加的和/或不同的信息 内容。但是，现有技术中描述的数据依赖的收集方法已经极大限制了和单 一的传统的解离模式一起使用。虽然现有技术的某些参考文献(参见，例如 LeBlanc等，"Unique Scanning Capabilities of a New Hybrid Linear Ion Trap Mass Spectrometer (Q Trap) Used for High Sensitivity Proteomics Applications", Pra&ow/"', vol. 3, pp.859-869(2003)已经描述了利用数据依 赖的方法自动调整解离参数，例如碰撞能量，但是尚需一种新型的数据依 赖的收集方法，其可以和最近研发的先进的解离技术一起使用以更全面的 利用用于收集增强的信息内容的机会)。
技术实现思路
如上所述，根据本专利技术实施例实现的一种自动的质谱分析方法包括收 集从样本中获得的离子的质谱，分析质谱以识别感兴趣的离子种类，通过 施加指定的标准从不同的备选解离类型的列表中选择解离类型，其中该指 定的标准至少部分基于感兴趣的离子种类的确定的电荷状态，以及用选择 的解离类型解离离子种类以产生子离子。备选解离类型的示例包括碰撞活 化解离(CAD)，脉冲q解离(PQD)，光解离，电子捕获解离(ECD)，电子转 移解离(ETD)，以及跟有补充的碰撞活化或质亍传输反应(PTR)中一个或多 个阶段的ETD。那么，可以获取子离子的MS/MS质谱。重复该过程一次 或多次，以产生更多代的子离子和获取相应的MSn质谱。在本专利技术的另一实施例中，设置一种质谱仪，其包括用于从要分析的样本中产生离子的离子源，用于收集离子质谱的质量分析仪，以及解离设 备。质量分析仪和解离设备可以集合成一个共同的结构，例如二维离子阱 质量分析仪。该质量分析仪和解离设备与控制器通信，该控制器被编程以 从质谱中识别感兴趣的离子种类，并且通过应用指定的标准，从备选解离 类型的列表中选择恰当的解离类型，其中该指定的标准至少部分基于感兴 趣的离子种类的确定的电荷状态。然后控制器命令解离设备利用选择的解 离类型对离子种类进行解离以产生子离子。通过扩展数据依赖方法的概念以包括解离类型的选择，本专利技术的实施 例更有效的利用了质谱仪的能力，并有助于产生更有用的数据。在一个简 单的示例中，公知的是某些解离技术(例如，ETD)的特征在于解离效率对 于离子电荷状态有很强的依赖性，这样当该解离技术施加于具有低电荷状 态的离子时，不会产生有意义的结果。在该种情况下，质谱仪会被编程以 限制其将依赖电荷状态的解离技术用于具有所需的电荷状态的离子种类，以及为不符合电荷状态标准的离子种类使用替换的解离技术，例如CAD。附图说明在附图屮图1是质谱仪系统的示例的示意图，其中口j.以实现本专利技术的数据依赖 技术。图2是根据本专利技术示意性实施例的，用于描述数据依赖方法的步骤的流程图，其中该方法利用某标准来选择解离类型，该标准以感兴趣的离子种类的确定的电荷状态为基础；图3是输入标准和解离类型之间的指定关系的一个示例的表格表示， 其中输入标准仅基于离子种类的电荷状态；以及图4是输入标准和解离类型之间的指定关系的另一示例的表格表示， 其中输入标准基于离子种类的电荷状态和质荷比(m/z)。8具体实施例方式图1是质谱仪100的小意性描述，其中可以有利地实现本专利技术的数据依赖方法。应当注意，该质谱仪100通过非限制性示例表示，可以结合具有与这里描述的不同结构和构造的质谱仪实施本专利技术。通过离子源105从要进行质量分析的样本(例如液体色谱柱的洗出液)屮产生离子。离子源105描述为电喷雾源，但是可以作为替换采用任何其它恰当类型的连续的或脉冲的源。离子通过逐步低压的中间室IIO来传输，并且随后被传送至位于真空室120中的质量分析仪115。各种离子光学仪器，例如静电透镜125，射频(RF)多极离子向导130，和离子传输管135，都可以放置在中间和真空室110和120中，以提供离子聚焦和离子中性物分离并由此有助于通过质谱仪100有效传输离子。如图1所示，质量分析仪115采用二维四极离子阱质量分析仪的形式，其类似于在Thermo Fisher Scientific Inc. (San Jose, CA)提供的LTQ质谱仪中使用的质量分析仪。注意，离子阱质量分析仪(包括这里描绘和描述的二维离子阱，以及三位离子阱)能够在共同的物理结构屮执行质量分析和解离功能；其它质谱仪系统可以利用用于质量分析和解离的分离结构。质量分析仪115(和/或质量分析仪115外部的一个或多个解离设备)构造为通过从多个可用的解离技术中选择的一个来解离离子。在该示例中，质量分析仪130可以通过传统的CAD， PQD(如Schwartz在美国专利No.6949743中所述，整个公开文本并入这里作为参考)，或者ETD(如Hunt等在美国专利公开文本No.US2005/0199804中所述，整个公开文本并入这里作为参考)可控地解离离子，上述方法要么单独使用，要么和补充的碰撞活化，或者和非解离的电荷还原反应歩骤一起使用，其中电荷还原反应典型地利用离子反应，例如PTR。如Syka在美国专利No.7026613中所述，其中该整个公开文本并入这里作为参考，通过向与质量分析仪115相邻放置的端部透镜160施加振荡电压，实现在二维阱质量分析仪的共同区域本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种通过质谱法分析样本的方法，包括：　收集从所述样本中获得的离子的质谱；　从所述质谱中识别感兴趣的离子种类；　通过确定识别的离子种类的电荷状态和应用指定的标准，从而从多个不同的备选解离类型中自动选择解离类型，所述指定的标准至少部分基于确定的电荷状态；以及　利用选择的解离类型，解离所述识别的离子种类。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】...

【专利技术属性】
技术研发人员：杰·C·施瓦兹，约翰·E·p·西卡，安德里斯·F·r·哈默尔，约书亚·J·库恩，
申请(专利权)人：塞莫费尼根股份有限公司，约书亚·J·库恩，
类型：发明
国别省市：US