育种性状解析方法、装置、设备、介质及计算机程序产品制造方法及图纸

技术编号:44947244 阅读:35 留言:0更新日期:2025-04-12 01:21
本发明专利技术涉及育种性状解析领域,本发明专利技术提供一种育种性状解析方法、装置、设备、介质及计算机程序产品,所述方法包括:基于育种样本的基因型数据和表型性状数据,构建目标数据集;通过所述目标数据集训练得到性状预测模型;通过所述性状预测模型解析基因变异位点对表型性状的效应,得到效应矩阵;所述基因变异位点是基于所述基因型数据确定的;对所述效应矩阵进行聚合处理,得到目标性状对应的关键变异位点;所述目标性状是根据需求从所述表型性状数据中选择得到的。本发明专利技术通过性状预测模型挖掘基因位点对性状的效应,充分利用基因型数据和表型数据,提高了育种性状解析的准确性。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及育种性状解析,尤其涉及一种育种性状解析方法、装置、设备、介质及计算机程序产品


技术介绍

1、现有对育种性状的解析方法依赖于基因数据与性状间的关联分析,需要大量样本才能检测到显著关联,且解析结果以加性效应(是指多个基因位点对某一表型的独立贡献总和,每个等位基因以线性方式叠加影响表型)为主,缺少对于显性效应(是指同一基因位点间的显隐关系导致表型偏离加性模型的现象)和上位效应(是指不同基因位点间的相互作用,导致某基因表型表达依赖于其他基因的状态)的挖掘,而导致的作物育种性状解析不够准确。


技术实现思路

1、本专利技术提供一种育种性状解析方法、装置、设备、介质及计算机程序产品,用以解决现有育种性状解析方案中存在的解析不够准确的缺陷,实现育种性状的准确解析。

2、本专利技术提供一种育种性状解析方法,包括如下步骤:

3、基于育种样本的基因型数据和表型性状数据,构建目标数据集;

4、通过所述目标数据集训练得到性状预测模型;

5、通过所述性状预测模型解析基因变异本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种育种性状解析方法,其特征在于,包括:

2.根据权利要求1所述的育种性状解析方法,其特征在于,所述基于育种样本的基因型数据和表型性状数据,构建目标数据集包括:

3.根据权利要求2所述的育种性状解析方法,其特征在于,所述性状预测模型包括编码模块、抽样模块、解码模块和预测模块;所述通过所述目标数据集训练得到性状预测模型包括:

4.根据权利要求2所述的育种性状解析方法,其特征在于,所述对育种样本的基因型数据进行转换处理,得到基因型矩阵包括:

5.根据权利要求1所述的育种性状解析方法,其特征在于,所述通过所述性状预测模型解析基因变异位点对表型...

【技术特征摘要】

1.一种育种性状解析方法,其特征在于,包括:

2.根据权利要求1所述的育种性状解析方法,其特征在于,所述基于育种样本的基因型数据和表型性状数据,构建目标数据集包括:

3.根据权利要求2所述的育种性状解析方法,其特征在于,所述性状预测模型包括编码模块、抽样模块、解码模块和预测模块;所述通过所述目标数据集训练得到性状预测模型包括:

4.根据权利要求2所述的育种性状解析方法,其特征在于,所述对育种样本的基因型数据进行转换处理,得到基因型矩阵包括:

5.根据权利要求1所述的育种性状解析方法,其特征在于,所述通过所述性状预测模型解析基因变异位点对表型性状的效应,得到效应矩阵包括:

6.根据权利要求1所...

【专利技术属性】
技术研发人员:赵向宇王开义刘忠强张东峰王心晖张秋思韩焱云
申请(专利权)人:北京市农林科学院信息技术研究中心
类型:发明
国别省市:

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