一种HIV基因型耐药预测的方法、系统、设备及介质技术方案

本发明专利技术公开了一种HIV基因型耐药预测的方法、系统、设备及介质，所述方法包括利用B亚型数据集对应的0‑1矩阵训练第一基础预测模型，再利用非B亚型数据集对应的0‑1矩阵调整；计算B亚型数据集和非B亚型数据集中氨基酸序列的PSSM矩阵，利用B亚型数据集对应的PSSM矩阵训练第二基础预测模型，再利用非B亚型数据集对应的PSSM矩阵调整；训练HIV基因型耐药预测模型，所述模型包括融合模块，所述融合模块用于融合第一基础预测模型的中间特征和第二基础预测模型的中间特征。本发明专利技术使用了非B亚型数据对模型进行调整，还将两个基础预测模型的中间特征融合，提高了对B亚型和非B亚型基因序列耐药预测的准确性。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及生物信息数据处理，具体涉及一种hiv基因型耐药预测的方法、系统、设备及介质。

技术介绍

1、高效抗逆转录病毒治疗(highly active anti-retroviral therapy，haat)是目前防治艾滋病最有效的方法之一，它不但可以显著降低艾滋病的病死率，提高患者的生存质量，还可以降低艾滋病的传染性。但随着抗病毒药物的使用范围不断扩大，受到患者的服药依从性的不同、抗病毒用药方案等多种因素的影响，导致接受治疗的艾滋病患者的耐药性增加，而耐药毒株的传播会导致死亡率增加。因此对艾滋病患者进行hiv耐药分析，可以帮助其在抗病毒治疗前制定最优的抗病毒治疗方案，或者及时更换抗病毒治疗药物。

2、目前对hiv进行耐药分析的方法主要包括表型耐药试验分析、基因型耐药检测两种方法。但表型耐药试验需要对病毒进行体外培养，时间较长，操作繁复，价格昂贵；而基因型耐药检测是针对患者pol区基因测序得到的序列，然后进行耐药解释分析，其快速准确的特点让其越来越成为临床指导药物选择的重要手段。

3、目前主要的hiv基因型耐药解释系统为hiv本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种HIV基因型耐药预测的方法，其特征在于，包括：

2.如权利要求1所述的一种HIV基因型耐药预测的方法，其特征在于，所述融合模块的融合过程包括：

3.如权利要求1所述的一种HIV基因型耐药预测的方法，其特征在于，所述HIV基因型耐药预测模型还包括全连接层和Sigmod函数层，所述融合模块的融合结果经过全连接层计算，再用Sigmod函数层激活全连接层的输出结果，得到HIV基因型耐药预测模型的输出结果。

4.如权利要求1所述的一种HIV基因型耐药预测的方法，其特征在于，所述第一基础预测模型的中间特征为第一基础预测模型卷积层中最后一层卷积层的输出结果X...

【技术特征摘要】

1.一种hiv基因型耐药预测的方法，其特征在于，包括：

2.如权利要求1所述的一种hiv基因型耐药预测的方法，其特征在于，所述融合模块的融合过程包括：

3.如权利要求1所述的一种hiv基因型耐药预测的方法，其特征在于，所述hiv基因型耐药预测模型还包括全连接层和sigmod函数层，所述融合模块的融合结果经过全连接层计算，再用sigmod函数层激活全连接层的输出结果，得到hiv基因型耐药预测模型的输出结果。

4.如权利要求1所述的一种hiv基因型耐药预测的方法，其特征在于，所述第一基础预测模型的中间特征为第一基础预测模型卷积层中最后一层卷积层的输出结果x，所述第二基础预测模型的中间特征为第二基础预测模型卷积层中最后一层卷积层的输出结果y。

5.如权利要求1所述的一种hiv基因型耐药预测的方法，其特征在于，用于训练所述第一基础预测模型的数据、用于测试训练得到的第一基础预测模型的数据、用于调整第一基础预测模型的数据和用于测试调整后第一基础预测模型的数据分别和用于训练第二基础预测模型的数据、用于测试训练得到的第二基础预测模型的数据、用于调整第二基础预测模型的数据和用于测试调整后第...

【专利技术属性】
技术研发人员：邢辉，吴林寰，廖玲洁，曹丕，冯毅，范国梅，阮玉华，卢键，郝静静，张荐辕，
申请(专利权)人：中国疾病预防控制中心性病艾滋病预防控制中心，
类型：发明
国别省市：