【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】
本专利技术涉及对患者的癌症进行分类的方法，包括确定癌症的增殖状态和对癌症进行分类。合适地，癌症是乳腺癌，并且该方法允许将乳腺癌分类为luminal a或luminal b亚型。此类方法还允许对癌症患者的临床结果进行预后或预测；为癌症患者选择治疗方案；并且涉及针对已经使用本专利技术的方法对其癌症进行分类的患者的治疗，合适地癌症是乳腺癌。本专利技术还提供了用于本专利技术方法的试剂盒。
技术介绍
1、乳腺癌(bc)是女性中最常见的癌症，2018年估计有210万新病例和627,000例死亡(bray等人,ca cancer j clin 68(6):394-424,2018)。使用基因表达谱，perou和sorlie证明了乳腺肿瘤可以根据其“内在”分子亚型进行分类(ozmen,v.,journal of breasthealth(13):50-53,2017)。
2、根据st.gallen指南(cardoso,f.等人,annals of oncology(30):1194-1220,2019)的定义，该疾病可分为五种主要的分子亚型...
【技术保护点】
1.一种用于对患者的癌症进行分类的方法，包括确定至少一种选自以下的生物标志物的表达水平：KIF23、AURKA、MCM2、CCNA2、PCNA和MCM4，并基于检测到的生物标志物的表达水平对所述癌症进行分类。
2.根据权利要求1所述的方法，其中所述至少一种生物标志物的表达水平确定了所述癌症的增殖状态。
3.根据权利要求1或2中任一项所述的方法，其中测量至少两种选自以下的生物标志物：MKI67、KIF23、AURKA、MCM2、CCNA2、PCNA和MCM4，任选地其中至少两种生物标志物之一是MKI67。
4.根据前述权利要求中任一项...
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】
1.一种用于对患者的癌症进行分类的方法，包括确定至少一种选自以下的生物标志物的表达水平：kif23、aurka、mcm2、ccna2、pcna和mcm4，并基于检测到的生物标志物的表达水平对所述癌症进行分类。
2.根据权利要求1所述的方法，其中所述至少一种生物标志物的表达水平确定了所述癌症的增殖状态。
3.根据权利要求1或2中任一项所述的方法，其中测量至少两种选自以下的生物标志物：mki67、kif23、aurka、mcm2、ccna2、pcna和mcm4，任选地其中至少两种生物标志物之一是mki67。
4.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述癌症是乳腺癌。
5.根据权利要求4所述的方法，其中所述患者的乳腺癌被分类为luminal a或luminalb亚型。
6.根据权利要求5所述的方法，其中所述患者的癌症是激素受体阳性且her2阴性。
7.根据权利要求5或6所述的方法，其中将所述检测到的表达水平与luminal a和luminal b乳腺癌亚型的参考值特征进行比较或关联。
8.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中确定至少3、4、5、6或所有7种生物标志物的表达水平。
9.根据权利要求4至8中任一项所述的方法，其中对所述或每种生物标志物的表达水平进行加权以确定癌症增殖状态和/或将癌症分类为luminal a或luminal b亚型。
10.一种用于预后或预测诊断患癌症的患者的临床结果的方法，包括确定至少一种选自以下的生物标志物的表达水平：kif23、aurka、mcm2、ccna2、pcna和mcm4，并从这些表达值中预后或预测所述癌症患者的临床结果。
11.根据权利要求10所述的方法，其中测量至少两种选自以下的生物标志物：mki67、kif23、aurka、mcm2、ccna2、pcna和mcm4，任选地其中至少两种生物标志物之一是mik67。
12.根据权利要求10或11所述的方法，其中预后是生存期，如2年、3年、5年、7年、10年或更长的生存期。
13.根据权利要求10至12中任一项所述的方法，其中所述癌症是乳腺癌。
14.根据权利要求1至13中任一项所述的方法，其中基于检测到的生物标志物蛋白质的量来确定生物标志物表达水平。
15.根据权利要求14所述的方法，其中使用选自以下的技术来检测生物标志物蛋白质的量：免疫组织化学(ihc)、基于珠/板的酶联免疫吸附测定(elisa)、酶联寡核苷酸测定(elona)、高效液相色谱(hplc)和质谱，包括串联质谱。
16.根据权利要求1至13中任一项所述的方法，其中基于检测到的rna转录本水平的量来确定生物标志物表达水平。
17.根据权利要求16所述的方法，其中使用选自以下的技术来确定rna转录本水平：逆转录聚合酶链式反应(rt-pcr)，包括定量逆转录聚合酶链式反应(rt-qpcr)，和杂交技术。
18.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中定量确定每种被测量的生物标志物的表达水平。
19.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中，例如通过使用一种或多种参考基因，对每种生物标志物的表达水平进行标准化。
20.根据权利要求19所述的方法，其中使用rt-pcr测量rna转录本表达水平，并且将所述表达水平标准化，任选地获得δct。
21.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述评估是在先前从所述患者分离的癌症样品上进行的，任选地所述癌症样品作为固体或液体活检样品或在手术期间分离。
22.根据权利要求21所述的方法，其中所述癌症样品是新鲜的、冷冻的或石蜡包埋并固定的。
23.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中所评估的生物标志物包括：
24.根据权利要求1至22中任一项所述的方法，其中所评估的生物标志物包括选自以下组(i)-(xx)的组中的每种生物标志物：
25.根据前述权利要求中任一项所述对患者的乳腺癌进行分类的方法，其中还确定了至少一种以下生物标志物的表达水平：esr1、pgr、erbb2和角蛋白5。
26.根据权利要求25所述的方法，其中所测量的生物标志物的表达水平允许将所述患者的乳腺癌分类为或用于将所述患者的乳腺癌分类为：luminal a样、luminal b样(her2阴性)、luminal b样(her2阳性)、her2阳性(非luminal)或三阴性。
27.一种为乳腺癌患者提供治疗建议或指导治疗决策的方法，包括确定一组生物标志物的表达水平，将这些应用于能够鉴定患者是否可能患有luminal a或luminal b癌症的算法，并基于此提出治疗建议，其中该组生物标志物包括(i)以下的至少一种：kif23、aurka、mcm2、ccna2、pcna或mcm4；或(ii)mki67和以下的至少一种：kif23、aurka、mcm2、...
【专利技术属性】
技术研发人员：乔安娜·戈尔尼亚克，萨拉·罗林森，
申请(专利权)人：APIS检测技术有限公司，
类型：发明
国别省市：
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