一种芒果SSR分子标记的引物组及其应用和使用方法技术

本发明专利技术提供了一种芒果SSR分子标记的引物组及其应用和使用方法，属于分子检测技术领域。所述引物组包括G676引物对、G1028引物对、G1352引物对、G1382引物对、G1666引物对、G1097引物对、G1745引物对、G1151引物对和G1077引物对。利用该引物组能有效对不同的芒果品种和种质资源进行遗传多样性分析和聚类分析。该引物组具有多态性丰富、扩增稳定、重复性好等优点，是首次基于Alphonso芒果全基因组开发的SSR分子标记；利用该引物组进行群体遗传多样性分析，为进行芒果种质资源遗传多样性保护、亲缘关系研究筛选奠定了基础。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于分子检测，尤其涉及一种芒果ssr分子标记的引物组及其应用和使用方法。

技术介绍

1、芒果属于漆树科芒果属，是重要的热带亚热带水果，素有“热带果王”的美誉。随着经济全球化发展的日益迅猛，一些新优良芒果品种的培育和引进使得芒果成为重要农业支柱产业。但各个研究所保存的品种及种质资源间存在同物异名或同名异物现象严重，为减少品种或种质资源重复引种或引进来随意命名现象，因此开发一套分子标记来保护芒果种质资源遗传多样性迫在眉睫。

2、简单重复序列(ssr)是由1-6个核苷酸组成的简单重复序列，广泛分布于真核生物的整个基因组。尽管ssr分布于整个基因组的不同位置，但其两端序列多是保守的单拷贝序列，根据这两端的序列设计一对特异引物，通过pcr技术将核心ssr序列扩增出来，利用电泳分析技术就可以得到其长度的多态性。ssr标记由于共显性好、能很好的区分纯合基因和杂合基因、多态性高、重复性好、稳定性好等优点，已经被广泛应用于分子辅助育种、遗传多样性分析、种质资源鉴定等研究中。

3、为了开展分子生物学ssr标记辅助鉴定芒果种质资源，促进芒果良种本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种芒果SSR分子标记的引物组，其特征在于，所述引物组包括G676引物对、G1028引物对、G1352引物对、G1382引物对、G1666引物对、G1097引物对、G1745引物对、G1151引物对和G1077引物对；

2.根据权利要求1所述的引物组，其特征在于，所有的正向引物连接荧光标记；所述荧光标记为FAM、HEX、ROX中的一种。

3.权利要求1或2所述的引物组在芒果群体遗传多样性分析中的应用。

4.权利要求1或2所述的引物组在芒果种质亲缘关系分析中的应用。

5.根据权利要求4所述的应用，其特征在于，所述种质亲缘关系通过UPMGA...

【技术特征摘要】

1.一种芒果ssr分子标记的引物组，其特征在于，所述引物组包括g676引物对、g1028引物对、g1352引物对、g1382引物对、g1666引物对、g1097引物对、g1745引物对、g1151引物对和g1077引物对；

2.根据权利要求1所述的引物组，其特征在于，所有的正向引物连接荧光标记；所述荧光标记为fam、hex、rox中的一种。

3.权利要求1或2所述的引物组在芒果群体遗传多样性分析中的应用。

4.权利要求1或2所述的引物组在芒果种质亲缘关系分析中的应用。

5.根据权利要求4所述的应用，其特征在于，所述种质亲缘关系通过upmga进化树进行分析。

6.一种分析芒果群体遗传多样性的方法，其特征在于，包括以下步骤：

【专利技术属性】
技术研发人员：武红霞，闫锦源，郑斌，马小卫，许文天，王松标，何小龙，
申请(专利权)人：中国热带农业科学院南亚热带作物研究所，
类型：发明
国别省市：