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基于单端接头转座酶的单细胞基因组测序试剂盒及其应用制造技术

技术编号:41922586 阅读:24 留言:0更新日期:2024-07-05 14:21
本发明专利技术公开了一种基于单端接头转座酶的单细胞基因组测序试剂盒及其应用,属于单细胞测序技术领域。所述试剂盒包括:连接有特殊定制序列的转座酶,所述特殊定制序列为双链序列,分别为第一链序列和第二链序列,其中第一链序列依次包括连接序列1、细胞标签1序列和包埋序列,其中第二链序列为包埋序列的互补序列;第一杂交引物,依次包括连接序列2、细胞标签2序列和测序接头1序列;桥连引物,用于将连接序列1和连接序列2进行连接;第二杂交引物,依次包括所述包埋序列的互补序列、分子标签序列、至少一部分所述连接序列1的互补序列和测序接头2。本发明专利技术的试剂盒生方法能够实现上亿种分子标记来标记单个细胞,达到超高通量,并且建库时间大幅缩短,属于快速单细胞基因组测序方法。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及单细胞测序,具体地,涉及一种基于单端接头转座酶的单细胞基因组测序试剂盒及其应用


技术介绍

1、由于人类大多数的基因突变出现在非编码基因组原件上,因此研究者意识到理解基因型-表型轴需要一个全面的功能性非编码基因组元件目录。自2013年染色质转座酶可及性分析(atac)(buenrostro,j.d.et al.(2013)‘transposition of native chromatinfor fast and sensitive epigenomic profiling of open chromatin,dna-bindingproteins and nucleosome position’,nature methods,10(12),pp.1213-1218)被提出以来,这种方法已被认为是染色质开放区域的全基因组分析最容易获得和最具成本效益的策略。单细胞atac-seq(scatac-seq)技术也已被开发用于研究含有异质细胞群的组织样本中细胞类型特异性染色质的可及性。

2、atac-seq测序预先将转座酶与细胞标签序列结本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种基于单端接头转座酶的单细胞基因组测序试剂盒,其特征在于,包括:

2.根据权利要求1所述的一种基于单端接头转座酶的单细胞基因组测序试剂盒,其特征在于,所述连接有特殊定制序列的转座酶的制备过程如下:

3.根据权利要求1所述的一种基于单端接头转座酶的单细胞基因组测序试剂盒,其特征在于,还包括PCR扩增引物对,上下游引物其中一条包括所述测序接头1序列的互补序列,另外一条包括所述测序接头2序列的互补序列。

4.根据权利要求1所述的一种基于单端接头转座酶的单细胞基因组测序试剂盒,其特征在于,所述细胞标签1序列、所述细胞标签2序列和分子标签序列分别包括6~1...

【技术特征摘要】

1.一种基于单端接头转座酶的单细胞基因组测序试剂盒,其特征在于,包括:

2.根据权利要求1所述的一种基于单端接头转座酶的单细胞基因组测序试剂盒,其特征在于,所述连接有特殊定制序列的转座酶的制备过程如下:

3.根据权利要求1所述的一种基于单端接头转座酶的单细胞基因组测序试剂盒,其特征在于,还包括pcr扩增引物对,上下游引物其中一条包括所述测序接头1序列的互补序列,另外一条包括所述测序接头2序列的互补序列。

4.根据权利要求1所述的一种基于单端接头转座酶的单细胞基因组测序试剂盒,其特征在于,所述细胞标签1序列、所述细胞标签2序列和分子标签序列分别包括6~15个随机合成的碱基。

5.根据权利要求1~4任一所述的一种基于单端接头转座酶的单细胞基因组测序试剂盒,其特征在于,还包括细胞核制备液、酶切反应液、杂交缓冲液、连接缓冲液、pcr缓冲液、核酸纯...

【专利技术属性】
技术研发人员:韩晓平郭国骥王雪怡杨蕾
申请(专利权)人:浙江大学
类型:发明
国别省市:

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