基于梁山慈竹转录组序列开发的EST-SSR分子标记、引物组、试剂盒及应用制造技术

本发明专利技术公开了一种基于梁山慈竹转录组序列开发的EST‑SSR分子标记、引物组、试剂盒及应用，包括：21个分子标记、核苷酸序列分别如SEQ ID NO.1‑42所示的21对引物对以及一种试剂盒，所述试剂盒包括EST‑SSR引物和SSR‑PCR反应预混液。本发明专利技术所提供的21对EST‑SSR引物及分子标记能应用于不同基因型梁山慈竹群体的遗传多样性分析和不同竹种的系统分类鉴定。同时，本发明专利技术利用选育的37份梁山慈竹种质资源材料的SSR标记位点与12个表型性状进行关联分析，获得与胸径和茎秆干重显著相关的分子标记(L1和L26)，为进一步定向选育和推广梁山慈竹新品种奠定基础。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于分子生物学领域，更具体地说，本专利技术涉及一种基于梁山慈竹转录组序列开发的est-ssr分子标记、引物组、试剂盒及应用。

技术介绍

1、竹类植物是禾本科中最大的自然类群，全世界约有88属1400种，中国有34属近550种，在经济、农业、环境中都发挥着巨大的作用。由于竹子极少开花，繁殖器官难以获得，在传统分类方法中常用的外部形态特征会因环境改变而发生各种各样的变化。因此，竹子分类是竹子研究中的突出问题之一。分子标记技术为竹子系统分类的深入开展提供了新的依据。ssr标记是基于dna长度多态性的分子标记技术，广泛应用于群体遗传结构分析、构建遗传图谱、基因定位、亲缘关系等领域。表达序列标签ssr(est-ssr)是基于est开发出的第二代分子标记。est-ssr来自于基因的编码序列，更容易获得基因表达的信息表达，与基因组ssr(g-ssr)标记相比，具有物种间通用性较好、开发方法简单及成本低廉等优点。但是竹类植物中开发的ssr引物较少，检测的ssr位点不足以满足种质鉴定及群体遗传研究的需要，因而需要开发更多的竹类植物ssr引物，来扩大竹类植物种质鉴定本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种基于梁山慈竹转录组序列开发的EST-SSR分子标记，其特征在于，所述分子标记的编号依次为C2、C3、C8、L1、L2、L6、L7、L10、L26、L30、L32、L35、P4、P12、P15、P17、R2、R8、R68、R71、R83；

2.一种基于梁山慈竹转录组序列开发的EST-SSR引物组，其特征在于，包括核苷酸序列分别如SEQ ID NO.1-42所示的21对引物对。

3.一种如权利要求2所述的基于梁山慈竹转录组序列开发的EST-SSR引物组的应用，其特征在于，包括以下步骤：

4.如权利要求3所述的基于梁山慈竹转录组序列开发的EST-SS...

【技术特征摘要】

1.一种基于梁山慈竹转录组序列开发的est-ssr分子标记，其特征在于，所述分子标记的编号依次为c2、c3、c8、l1、l2、l6、l7、l10、l26、l30、l32、l35、p4、p12、p15、p17、r2、r8、r68、r71、r83；

2.一种基于梁山慈竹转录组序列开发的est-ssr引物组，其特征在于，包括核苷酸序列分别如seq id no.1-42所示的21对引物对。

3.一种如权利要求2所述的基于梁山慈竹转录组序列开发的est-ssr引物组的应用，其特征在于，包括以下步骤：

4.如权利要求3所述的基于梁山慈竹转录组序列开发的est-ssr引物组的应用，其特征在于，所述步骤一中，提取待测植株的基因组dna的具体方法为：取0.2g幼嫩叶片，除去叶脉，放置于2.0ml的ep管中，加入液氮充分研磨至粉状，再加入65℃预热的ctab溶液600μl，65℃水浴30min；然后在4℃下12000rpm离心10min，吸取500μl上清液转入新ep管，加入等体积的氯仿抽提，12000rpm离心2min；吸取上清液转入新ep管，加入等体积-20℃预冷的异丙醇，充分混匀后在-20℃条件下静置20min，进行核酸沉淀；弃去上清液，加入70％无水乙醇500μl，轻微摇晃使附于管壁的dna沉淀脱离，以便充分洗涤，然后倒掉上清液，保留dna沉淀，重复2次后将ep管倒扣于吸水纸上自然风干8～15min，加入25μl ddh...

【专利技术属性】
技术研发人员：曹颖，胡尚连，陈森，王博雅，龙治坚，赵欣，唐登国，
申请(专利权)人：西南科技大学，
类型：发明
国别省市：