【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于分子生物，具体涉及一种花生根结线虫病抗性qtl qrprkn-lg21及其ssr标记、试剂盒与方法。
技术介绍
0、技术背景
1、烟草根结线虫病是由植物寄生线虫引起的烟草根部病害，病原为根结线虫(meloidogyne spp.)，已成为我国和世界烟草生产主要病害之一。根结线虫是危害农作物的一类植物专性定栖寄生线虫，其寄主和分布范围广泛，可侵染3000多种植物，且能引起巨大的经济损失。
2、烟草根结线虫病症主要出现在烟株根部。致病线虫侵染烟草后会导致根部组织形成大量巨型细胞，巨型细胞膨大逐渐形成根瘤，进而造成根部导管、表皮和皮层组织破裂，影响烟草水分和营养吸收，发病严重时导致感病烟株矮化、生长发育不良、叶尖发黄等现象。同时，根结线虫侵入会降低植物的抗病能力，引发植物体复合性病害，如烟草黑胫病、青枯病、根黑腐病、镰孢菌根腐病等，影响烟叶正常生长。目前生产上防治根结线虫病仍以化学药剂为主，但由于大部分传统化学杀线虫药剂普遍存在高成本、高毒性、污染环境等弊端而被禁用，而生物防治效果又差强人意，使得根结线虫病的防治极为困难。水旱轮作对根结线虫有一定的防治效果，但水旱轮作在多数烟区(山地环境)无法实现。
3、目前已报道的根结线虫有90多种，在国内外烟草上普遍为害的主要有4种，包括南方根结线虫(meloidogyne incognita)、爪哇根结线虫(m.javanica)、花生根结线虫(m.arenaria)和北方根结线虫(m.hapla)。长期以来，国内研究者认为我国烟草根结线虫病是以
4、有关烟草花生根结线虫病相关的抗病基因座未见报道，而用于检测相关抗病基因座的分子标记也一片空白。
技术实现思路
1、基于本领域现有技术存在的上述空白，本专利技术提供一种花生根结线虫病抗病qtlqrprkn-lg21及其ssr分子标记。
2、本专利技术的技术方案如下：
3、一种花生根结线虫病抗性qtl qrprkn-lg21，其特征在于，位于烟草基因组lg21染色体的第109,325,613位至第110,191,973位之间的物理区段。
4、所述烟草基因组的版本为烟草品种‘云晒1号’的基因组v1.0；
5、优选地，所述花生根结线虫病抗性qtl qrprkn-lg21为烟草花生根结线虫病抗性qtl qrprkn-lg21。
6、所述的一种花生根结线虫病抗性qtl qrprkn-lg21在鉴别花生根结线虫病抗性品种或提高品种的花生根结线虫病抗性方面的应用。
7、一种检测所述的一种花生根结线虫病抗性qtl qrprkn-lg21的ssr标记，其特征在于，包括：标记ma21040和标记ma21163；
8、扩增所述标记ma21040的上下游引物分别如seq id no.7和seq id no.8；
9、扩增所述标记ma21163的上下游引物分别如seq id no.11和seq id no.12。
10、标记ma21040和标记ma21163均为花生根结线虫病抗性qtl qrprkn-lg21的侧翼标记(flanking markers)，二者分别位于花生根结线虫病抗性qtl qrprkn-lg21的左侧和右侧。本领域公知，靶标座位某一侧的侧翼标记与靶标座位的遗传距离为5cm时，该标记检测靶标座位的可靠性为95％；靶标座位某一侧的侧翼标记与靶标位点的遗传距离为4cm时，该标记检测靶标位点的可靠性为96％；靶标座位两侧的侧翼标记与靶标座位的遗传距离均≤5cm时，该两侧的标记检测靶标座位的可靠性为99.6％。因标记ma21040和标记ma21163与花生根结线虫病抗性qtl qrprkn-lg21的遗传距离均小于5cm，若检测结果能够同时检出标记ma21040和标记ma21163，则说明待测材料中花生根结线虫病抗性qtl qrprkn-lg21存在的可能性或准确率至少在95％以上。
11、所述的一种检测所述的一种花生根结线虫病抗性qtl qrprkn-lg21的ssr标记，其特征在于，还包括：标记ma21045；
12、扩增所述标记ma21045的上下游引物分别如seq id no.9和seq id no.10。
13、标记ma21045位于花生根结线虫病抗性qtl qrprkn-lg21的中间位置，虽然该标记与靶标座位qrprkn-lg21连锁最紧密，但因其不属于功能标记，单独用该标记扩增待测材料无法可靠鉴别靶标位点。在没有功能标记的情况下，一般是需要两侧的侧翼标记来卡住靶标位点的位置；对于二维线性染色体需要两点来确定靶标所在的中间范围的准确性，两侧的侧翼标记与抗病材料一样，则可认为中间所携带的染色体片段与抗病材料一样，即待测携带了靶标座位qrprkn-lg21，因此需要将标记ma21045与标记ma21040、标记ma21163联用，如果待测材料出现多态性与抗病材料相同，则说明待测材料携带qtl qrprkn-lg21概率至少在99％以上。
14、优选地，所述的一种花生根结线虫病抗性qtl qrprkn-lg21的ssr标记还包括：标记ma21085、标记ma21095、标记ma21108、标记ma21053；
15、扩增的标记ma21085上下游引物分别如seq id no.1和seq id no.2；
16、扩增的标记ma21095上下游引物分别如seq id no.3和seq id no.4；
17、扩增的标记ma21108上下游引物分别如seq id no.5和seq id no.6；
18、扩增的标记ma21053上下游引物分别如seq id no.13和seq id no.14。
19、如图1所示，标记ma21085、标记ma21095、标记ma21108位于花生根结线虫病抗性qtl qrprkn-lg21的左侧，标记ma21053位于花生根结线虫病抗性qtl qrprkn-lg21的右侧；将标记ma21085、标记ma21095、标记ma21108、标记ma21053和上述的标记ma21040、标记ma21163、标记ma21045联用，若上述各标记在待测材料的电泳带型与抗病材料的带型均一致，可以认为待测材料100％地携带花生根结线虫病抗性qtl qrprkn-lg21。
20、一种检测待测材料是否携带花生根结线虫病抗性qtl qrprkn-lg21的试剂盒，其特征在于，包括：所述的ssr标记。
21、本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种花生根结线虫病抗性QTL qRprkn-LG21，其特征在于，位于烟草基因组LG21染色体的第109,325,613位至第110,191,973位之间的物理区段。
2.根据权利要求1所述的一种花生根结线虫病抗性QTL qRprkn-LG21，其特征在于，所述烟草基因组的版本为烟草品种‘云晒1号’的基因组v1.0；
3.权利要求1或2所述的一种花生根结线虫病抗性QTL qRprkn-LG21在鉴别花生根结线虫病抗性品种或提高品种的花生根结线虫病抗性方面的应用。
4.一种检测权利要求1或2所述的一种花生根结线虫病抗性QTL qRprkn-LG21的SSR标记，其特征在于，包括：标记Ma21040和标记Ma21163；
5.根据权利要求4所述的一种检测权利要求1或2所述的一种花生根结线虫病抗性QTLqRprkn-LG21的SSR标记，其特征在于，还包括：标记Ma21045；
6.一种检测待测材料是否携带花生根结线虫病抗性QTL qRprkn-LG21的试剂盒，其特征在于，包括：权利要求4或5所述的SSR标记。
<...【技术特征摘要】
1.一种花生根结线虫病抗性qtl qrprkn-lg21，其特征在于，位于烟草基因组lg21染色体的第109,325,613位至第110,191,973位之间的物理区段。
2.根据权利要求1所述的一种花生根结线虫病抗性qtl qrprkn-lg21，其特征在于，所述烟草基因组的版本为烟草品种‘云晒1号’的基因组v1.0；
3.权利要求1或2所述的一种花生根结线虫病抗性qtl qrprkn-lg21在鉴别花生根结线虫病抗性品种或提高品种的花生根结线虫病抗性方面的应用。
4.一种检测权利要求1或2所述的一种花生根结线虫病抗性qtl qrprkn-lg21的ssr标记，其特征在于，包括：标记ma21040和标记ma21163；
5.根据权利要求4所述的一种检测权利要求1或2所述的一种花生根结线虫病抗性qtlqrprkn-lg21的ssr标记，其特征在于，还包括：标记ma21...
【专利技术属性】
技术研发人员：冯智宇，焦芳婵，吴兴富，陈学军，王扬，周绍芳，方敦煌，肖炳光，童治军，许美玲，李永平，
申请(专利权)人：云南省烟草农业科学研究院，
类型：发明
国别省市：
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