【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及生物，特别涉及一种基于深度测序的蚊传病原体检测方法。
技术介绍
1、病原体是一种可以对人或动植物造成疾病的微生物、寄生虫等媒介，其存在广泛，属于寄生性生物，不同的病原体引发的症状各不相同，在人体免疫系统正常的情况下，大部分病原体感染并不会引起疾病。
2、目前，针对病原体的检测是对病原体进行快速判断。灭杀的重要步骤，越来越成熟的病原体检测可以促进社会发展，减少病原体对人体造成的伤害。
3、在现有技术中，需要确定哪些是蚊传病原体往往需要进行微生物培养，而由于样本中包含的病原体很多，对样本中的病原体进行培养并验证需要耗费大量的人力物力，也需要花费大量的时间，从而导致检测效率低下，因此，本申请提供了一种基于深度测序的蚊传病原体检测方法来满足需求。
技术实现思路
1、本专利技术要解决的技术问题是提供一种基于深度测序的蚊传病原体检测方法，通过设置的深度测序方法用于对蚊传病原体的序列进行测定，用以避免耗费大量的人力物力，且减少了检测时的时间，从而提高了检测的效率；通过对被检测人员进行体液采集并统一将采集后的液体收集在不同试管内进行保存，在根据地理位置的不同以及被检测人员的性别不同进行试管的分组，在分组完毕后将试管放置到存放箱中，并集中运输到指定检测无菌室内，该分类方式清晰、简单，便于人员操作，且在操作时，降低被测样本受到污染的几率，极大的保证了待测样品的精确度。
2、为解决上述技术问题，本专利技术提供如下技术方案：
3、一种基于深度测
4、步骤一：由工作人员对规定范围内的被检测人员进行体液采集，在统一将采集后的体液收集在不同试管内进行保存，在根据地理位置的不同以及被检测人员的性别不同进行试管的分组；
5、步骤二：将分组完毕后的试管放置到存放箱中，并集中运输到指定检测无菌室内；
6、步骤三：工作人员将存放箱放置在无菌室内的操作仓中进行密闭式操作，在对待检测样本进行检测时，需要确定待检测样本是否符合深度测序检测的适应症，待符合后，在将样本上机并进行深度测序处理，从而得到测序数据；
7、步骤四：将得到的测序数据进行生物信息学分析以及通过蚊传病原数据库进行比对；
8、步骤五：通过分析与比对后，得到检测数据；
9、步骤六：通过将得到的检测数据上传，得到数据报告。
10、优选的，步骤一中，对标本进行收集时需要注意的是，需要注意标本收集和保存时的注意事项，防止标本受到感染而影响标本数据，以及防止工作人员受到感染。
11、优选的，步骤三中，在对样本进行上机测序处理时，需要先对样本进行处理，在进行测序时，也需要注意避免样本受到污染以及工作人员受到感染
12、优选的，在对样本进行测序时的方法包括：
13、s1、将待测样本进行离心，保留上清液；
14、s2、采用滤膜对s1中得到的上清液进行过滤，形成滤过液；
15、s3、将s2中得到的滤过液进行超速离心，除去上清液，保留沉淀；
16、s4、向s3中得到的沉淀中加入纯水，使沉淀悬浮，之后在加入酶，混合均匀并反应，形成处理后的样本；
17、s5，需要提取s4中得到的处理后样本中的核酸，然后建库，从而测序。
18、优选的，s1中，离心时的转速为3000～14000转/分钟，离心的时间为4～100分钟。
19、优选的，s2中，滤膜的孔径为0.2～0.5微米。
20、优选的，s3中，超速离心的转速为30000～900000×g，超速离心的时间为1.5～9小时。
21、优选的，s4中，酶为dna酶和rna酶。
22、优选的，s5中，提取s4中得到的处理后样本中的核酸的方式采用柱提法，在采用柱提法前需要使用trizol法，用以对rna进行提取。
23、优选的，步骤六中，在测序完毕后，通过高通量测序数据病原体归类分析软件将蚊传病检测数据进行转变成数据报告。
24、上述方案中，可以对关于病原体的样品进行核酸提取处理，得到待测样品，并对待测样品进行pcr反应处理，得到待测样品的扩增产物，然后将该扩增产物进行标记，在将该扩增产物在预定的温度下和基因芯片进行杂交，得到杂交产物，之后将对杂交产物进行扫描处理，得到检测结果。
25、本专利技术与现有技术相比，至少具有如下有益效果：
26、上述方案中，通过设置的深度测序方法用于对蚊传病原体的序列进行测定，在建库前，采用对样本进行离心、过滤、超速离心和酶消化等步骤，经处理的样品不经pcr反应即可建库并深度测序，同时保证测序得到的总数据中蚊传病原体的基因比例较高，分析后的数据中蚊传病原体的测序平均深度较深，进而避免耗费大量的人力物力，且减少了检测时的时间，从而提高了检测的效率。
27、通过对被检测人员进行体液采集，并统一将采集后的液体收集在不同试管内进行保存，在根据地理位置的不同以及被检测人员的性别不同进行试管的分组，在分组完毕后将试管放置到存放箱中，并集中运输到指定检测无菌室内，在检测时，将存放箱放置在无菌室内的操作仓中进行密闭式操作，该分类方式清晰、简单，便于人员操作，且在操作时，降低被测样本受到污染的几率，极大的保证了待测样品的精确度。
28、综上所述，专利技术具有样品需求量少，测序总成本低，数据中有效数据比例高，测序平均深度大、覆盖度高，测序结果无特异性引物干扰，偏倚小的特点。
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1.一种基于深度测序的蚊传病原体检测方法，其特征在于，所述基于深度测序的蚊传病原体的检测方法包括以下步骤：
2.根据权利要求1所述的基于深度测序的蚊传病原体检测方法，其特征在于，步骤一中，对标本进行收集时需要注意的是，需要注意标本收集和保存时的注意事项，防止标本受到感染而影响标本数据，以及防止工作人员受到感染。
3.根据权利要求1所述的基于深度测序的蚊传病原体检测方法，其特征在于，步骤三中，在对样本进行上机测序处理时，需要先对样本进行处理，在进行测序时，也需要注意避免样本受到污染以及工作人员受到感染。
4.根据权利要求3所述的基于深度测序的蚊传病原体检测方法，其特征在于，在对样本进行测序时的方法包括：
5.根据权利要求4所述的基于深度测序的蚊传病原体检测方法，其特征在于，S1中，离心时的转速为3000～14000转/分钟，离心的时间为4～100分钟。
6.根据权利要求4所述的基于深度测序的蚊传病原体检测方法，其特征在于，S2中，滤膜的孔径为0.2～0.5微米，。
7.根据权利要求4所述的基于深度测序的蚊传病原
8.根据权利要求4所述的基于深度测序的蚊传病原体检测方法，其特征在于，S4中，酶为DNA酶和RNA酶。
9.根据权利要求4所述的基于深度测序的蚊传病原体检测方法，其特征在于，S5中，提取S4中得到的处理后样本中的核酸的方式采用柱提法，在采用柱提法前需要使用Trizol法，用以对RNA进行提取。
10.根据权利要求1所述的基于深度测序的蚊传病原体检测方法，其特征在于，步骤六中，在测序完毕后，通过高通量测序数据病原体归类分析软件将蚊传病检测数据进行转变成数据报告。
...【技术特征摘要】
1.一种基于深度测序的蚊传病原体检测方法，其特征在于，所述基于深度测序的蚊传病原体的检测方法包括以下步骤：
2.根据权利要求1所述的基于深度测序的蚊传病原体检测方法，其特征在于，步骤一中，对标本进行收集时需要注意的是，需要注意标本收集和保存时的注意事项，防止标本受到感染而影响标本数据，以及防止工作人员受到感染。
3.根据权利要求1所述的基于深度测序的蚊传病原体检测方法，其特征在于，步骤三中，在对样本进行上机测序处理时，需要先对样本进行处理，在进行测序时，也需要注意避免样本受到污染以及工作人员受到感染。
4.根据权利要求3所述的基于深度测序的蚊传病原体检测方法，其特征在于，在对样本进行测序时的方法包括：
5.根据权利要求4所述的基于深度测序的蚊传病原体检测方法，其特征在于，s1中，离心时的转速为3000～14000转/分钟，离心的时间为4～100分...
【专利技术属性】
技术研发人员：卢囡囡，朱燕，谢洋，周洁，赵瑾，隋秀丽，徐震，孙秀芳，马尊国，李玉洁，王蓉，
申请(专利权)人：青海国际旅行卫生保健中心西宁海关口岸门诊部，
类型：发明
国别省市：
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