【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于基因工程，具体涉及一种龙眼红色果皮表型的筛选标记。
技术介绍
1、龙眼(dimocarpus longan lour.)是无患子科(sapindaceae)龙眼属(dimocarpuslour)常绿果树，在热带亚热带很多地区均有栽培。因此，龙眼产业的持续高效发展对于促进热区经济发展和果农增产增收具有重要意义。在我国，龙眼栽培文化历史已逾2000年，拥有龙眼品种(系)超300个，其中培育了近40个栽培品种，形成了具有地方特色的不同的地域类型(韩冬梅等2015，郑少泉等2019)。虽然龙眼品种(系)众多，但目前在龙眼具有商品价值的品种中，果实果皮外观色泽以黄褐色或黄灰色为主调。相对单一的色泽，严重阻碍了龙眼栽培资源生物学特性的多样性发展以及多元化市场的竞争潜力，因此特色龙眼资源的挖掘以及优异性状的利用已成为龙眼育种工作的重中之重。
2、随着人们收入提高以及消费升级，消费者行为习惯从对价格敏感逐渐转向品质敏感。而果实色泽作为最直观的品质，即便是风味极佳的品种，也需要丰富的色泽来满足日益多元化的消费市场。课题组前期从国外引进红皮(rp)龙眼资源，打破了传统栽培种龙眼仅有不积累花色苷生态型的认识，更重要的是作为特异的宝贵亲本材料，为创制具有商品价值的龙眼优异品种提供了新的育种方案。利用多组学联合分析，已经明确了龙眼果实颜色主要来自于花色苷的积累。然而目前关于红皮龙眼花色苷积累调控机制的研究仍处于空白。鉴于花色苷对于龙眼外观品质改良的重要作用，其代谢调控的分子机制是龙眼品种改良及新品种创制工作的重点，因此研究龙眼花
3、本研究以课题组收集的特色龙眼资源rp龙眼及主栽品种‘石硖’(sx)龙眼为研究材料，解析rp龙眼花色苷的调控机制，旨在为提升龙眼果实品质提供分子理论基础，并以此理论依据开发出与红色性状相关的分子标记进行辅助育种。
技术实现思路
1、本专利技术的目的在于克服现有技术中的不足，提供一种龙眼红色果皮表型的筛选标记。
2、本专利技术的第一个方面是提供一种dlmybrp基因，其cds序列如seq id no:1或者seqid no:2所示。
3、本专利技术的第二个方面是提供本专利技术第一个方面所述dlmybrp基因编码的蛋白质。
4、本专利技术的第三个方面是提供含有本专利技术第一个方面所述dlmybrp基因的cds序列的重组载体或宿主菌或表达盒。
5、其中，所述重组载体原始载体可以采用基因重组领域中常用的载体，例如病毒、质粒等。本专利技术对此不进行限定。
6、本专利技术的第四个方面是提供如本专利技术第一个方面所述的dlmybrp基因、或者如本专利技术第二个方面所述的蛋白质、或者如本专利技术第三个方面所述的重组载体或宿主菌或表达盒在提高atchs、和/或atchi、和/或atf3h、和/或atdfr、和/或atans、和/或atufgt的表达量中的应用。
7、本专利技术的第五个方面是提供如本专利技术第一个方面所述的dlmybrp基因、或者如本专利技术第二个方面所述的蛋白质、或者如本专利技术第三个方面所述的重组载体或宿主菌或表达盒在调控植物积累花色苷中的应用，其中，所述dlmybrp基因的cds序列如。
8、dlmybrp基因能够促进植物积累花色苷，尤其是seq id no:1所示的dlmybrp基因促进植物积累花色苷效果显著。
9、本专利技术的第六个方面是提供一种snp标记，所述snp标记为snp1、snp2或snp3；snp1位于seq id no:1或seq id no:2所示核苷酸序列的第197位，碱基为t或g；snp2位于seq idno:1或seq id no:2所示核苷酸序列的第317位，碱基为g或a；snp3位于seq id no:1或seqid no:2所示核苷酸序列的第318位，碱基为a或t。
10、本专利技术的第七个方面是提供一种snp标记组合，所述snp标记组合包括snp2和snp3；snp2位于seq id no:1或seq id no:2所示核苷酸序列的第317位，碱基为g或a；snp3位于seq id no:1或seq id no:2所示核苷酸序列的第318位，碱基为a或t。
11、本专利技术的第八个方面是提供用于扩增含有如本专利技术第八个方面所述的snp标记组合的核苷酸序列的引物组，所述引物组包含：mybrparms-af：5`-gctcatgctttgatgtctggtc-3`，和mybrparms-ar：5`-ctttgcattgtcttcttctgtac-3。
12、本专利技术的第九个方面是提供用于扩增如本专利技术第一个方面所述的dlmybrp基因的引物组，所述引物组包含：inf-dlmybrp-f：cggtacccggggatccatggagggtcacgtaggagtt，和inf-dlmybrp-r：tgctcaccatgtcgacctttgcattgtcttcttctgtacttagaagattcc。
13、本专利技术的第十个方面是提供一种鉴别龙眼的引物组，所述引物组包含：mybrparms-af：5`-gctcatgctttgatgtctggtc-3`，mybrparms-ar：5`-ctttgcattgtcttcttctgtac-3`，ybrparms-bf：5`-tcaagaactattggaacacacat-3`，和mybrparms-br：5`-gcaacagcttttttgcgtaatc-3`。
14、本专利技术的第十一个方面是提供如本专利技术第七个方面所述snp标记、或者本专利技术第八个方面所述snp标记组合、或者如本专利技术第九个方面所述的引物组、或者本专利技术第十个方面所述的引物组、或者本专利技术第十一个方面所述引物组在鉴别龙眼中的应用。
15、本专利技术的第十二个方面是提供一种龙眼的鉴别方法，检测待测龙眼品种如本专利技术第七个方面所述的snp标记或本专利技术第八个方面所述的snp标记组合，获得基因型。若snp1位点的基因型为tt，则为纯合红皮龙眼，若为gg，则为纯合石硖龙眼，若为gt，则为杂合龙眼(本专利技术的杂合龙眼是指红皮龙眼和石硖龙眼的杂种后代)；若snp2位点的基因型为gg，则为纯合红皮龙眼，若为aa，则为纯合石硖龙眼，若为ga，则为杂合龙眼；若snp3位点的基因型为aa，则为纯合红皮龙眼，若为tt，则为纯合石硖龙眼，若为at，则为杂合龙眼。
16、本专利技术的第十三个方面是提供另一种龙眼的鉴定方法，采用本专利技术第十一个方面所述的引物组对待测龙眼品种进行pcr扩增，扩增出716bp和253bp条带的为纯合红皮龙眼，扩增出716bp和506bp条带的纯合石硖龙眼，扩增出716bp、506bp和253bp三条条带的为杂合龙眼。
17、本专利技术提供了一种dlmybrp基因，能够积累花色苷，对rp龙眼和sx龙眼的dlmybrp基因的cdna序列进行分析发现，在r3保本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种SNP标记，其特征在于，所述SNP标记为SNP1、SNP2或SNP3；SNP1位于SEQ ID NO:1或SEQ ID NO:2所示核苷酸序列的第197位，碱基为T或G；SNP2位于SEQ ID NO:1或SEQ IDNO:2所示核苷酸序列的第317位，碱基为G或A；SNP3位于SEQ ID NO:1或SEQ ID NO:2所示核苷酸序列的第318位，碱基为A或T。
2.一种SNP标记组合，其特征在于，所述SNP标记组合包括SNP2和SNP3；SNP2位于SEQ IDNO:1或SEQ ID NO:2所示核苷酸序列的第317位，碱基为G或A；SNP3位于SEQ ID NO:1或SEQID NO:2所示核苷酸序列的第318位，碱基为A或T。
3.用于扩增含有如权利要求2所述的SNP标记组合的核苷酸序列的引物组，所述引物组包含：mybrparms-af：5`-GCTCATGCTTTGATGTCTGGTC-3`，和mybrparms-ar：5`-CTTTGCATTGTCTTCTTCTGTAC-3``。
4.一种鉴别龙眼的引物组，其特征在于，所述
5.如权利要求1所述SNP标记、或者如权利要求2所述SNP标记组合、或者如权利要求3或4所述的引物组在鉴别龙眼中的应用。
6.一种龙眼的鉴别方法，其特征在于，检测待测龙眼品种如权利要求1所述的SNP标记或权利要求2所述的SNP标记组合，获得基因型；若SNP1位点的基因型为TT，则为纯合红皮龙眼，若为GG，则为纯合石硖龙眼，若为GT，则为杂合龙眼；若SNP2位点的基因型为GG，则为纯合红皮龙眼，若为AA，则为纯合石硖龙眼，若为GA，则为杂合龙眼；若SNP3位点的基因型为AA，则为纯合红皮龙眼，若为TT，则为纯合石硖龙眼，若为AT，则为杂合龙眼；或者
...【技术特征摘要】
1.一种snp标记，其特征在于，所述snp标记为snp1、snp2或snp3；snp1位于seq id no:1或seq id no:2所示核苷酸序列的第197位，碱基为t或g；snp2位于seq id no:1或seq idno:2所示核苷酸序列的第317位，碱基为g或a；snp3位于seq id no:1或seq id no:2所示核苷酸序列的第318位，碱基为a或t。
2.一种snp标记组合，其特征在于，所述snp标记组合包括snp2和snp3；snp2位于seq idno:1或seq id no:2所示核苷酸序列的第317位，碱基为g或a；snp3位于seq id no:1或seqid no:2所示核苷酸序列的第318位，碱基为a或t。
3.用于扩增含有如权利要求2所述的snp标记组合的核苷酸序列的引物组，所述引物组包含：mybrparms-af：5...
【专利技术属性】
技术研发人员：魏永赞，石胜友，黄颖华，王尉，谢江辉，
申请(专利权)人：中国热带农业科学院热带生物技术研究所，
类型：发明
国别省市：
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