【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于分子标记辅助育种，具体涉及与大麦苗期干物质积累能力相关的snp分子标记开发及其应用。
技术介绍
1、
2、大麦是优质的饲料作物，既可以做青贮饲料也可以做谷物饲料，价格一般比小麦、玉米低，能够有效降低养殖成本。青贮大麦营养含量丰富，适口性好，是畜禽不可多得的饲料。大麦绿叶的蛋白质、氨基酸含量(蛋白质31.0％，赖氨酸1.20％)大大超过籽粒(蛋白质11.0％，赖氨酸0.32％)，而且还含有丰富的叶绿素、维生素、各种酶类和矿物质。用嫩麦草饲喂奶牛，可提高产奶量20％～30％，提高奶质量，延长奶牛的产奶期(增加5～6年)。且大麦具有耐寒、耐旱、耐贫瘠、草繁茂性好、适应性广等生产特点，尤其适合在冬季或生产环境欠佳的地区展开生产。
3、生物量是评价饲用粮产量的重要指标，干物质快速积累可以使植物在有限的时间和空间内具有更多的生物量，为农民产生更多的效益。全基因组关联分析(genome wideassociation study，gwas)是高效检测不同物种复杂性状的遗传变异,寻找与之相关联标记或基因的可靠方法，该方法已被广泛应用于动植物的基因挖掘和标记开发。通过gwas技术开发与大麦苗期干物质积累能力相关的snp分子标记为大麦精准育种提供有效的分子工具。
技术实现思路
1、本专利技术的目的在于提供与大麦苗期干物质积累能力相关的snp分子标记开发及其应用，开发一个与大麦苗期干物质积累能力相关的snp分子标记，该分子标记应用于筛选苗期干物质快速积累的大麦种质材
2、本专利技术提供了一种与大麦苗期干物质积累能力相关的分子标记，所述分子标记所在核苷酸序列如seq id no.3所示的片段，seq id no.3所示的片段的327bp处为c时为优势性状。
3、本专利技术还提供了上述snp分子标记检测大麦苗期干物质积累能力中的应用。
4、优选的，所述大麦苗期干物质积累能力的表征，包括大麦苗期地上部分干物质重量。
5、本专利技术还提供了一组大麦苗期干物质积累能力的snp分子标记检测引物对，所述引物对扩增上述基因。
6、优选的，包括核苷酸序列如seq id no.1所示的上游引物和seq id no.2所示的下游引物。
7、本专利技术还提供了上述snp分子标记检测引物对在分子标记辅助育种中的应用。
8、本专利技术还提供了上述snp分子标记检测引物对在筛选大麦苗期干物质积累能力强的大麦种质中的应用。
9、本专利技术还提供了一种筛选大麦苗期干物质积累能力强的大麦种质的方法，包括以下步骤：以目标大麦植株的基因组dna为模板，与上述snp分子标记检测引物对混合配制pcr扩增体系，进行pcr扩增反应，对扩增产物进行测序，筛选seq id no.3所示的片段327bp处为c的种质为苗期干物质积累能力强的种质。
10、优选的，所述pcr扩增体系以50μl计，包括：2×phanta max master mix25μl、10μmol/l上游引物和下游引物各2μl、模板5μl和余量的无菌水。
11、优选的，所述pcr扩增反应的程序包括：95℃预变性3min；95℃变性15s，58℃退火15s，72℃延伸15s，35个循环；72℃延伸5min，12℃保存。
12、有益效果：本专利技术提供了一种与大麦苗期干物质积累能力相关的基因，该基因包括seq id no.3所示的片段，且在所述片段的327bp处存在多态性c/t，且证实所述snp位点上的碱基为c类型，待测大麦品种为苗期干物质积累能力强的材料，若snp位点上的碱基为t类型，则该待测大麦品种为苗期干物质积累能力弱的材料。
13、本专利技术通过对大麦苗期干物质含量进行全基因组关联分析，鉴定到对苗期干物质能力有显著提高作用的snp位点，首次公开了一个与大麦苗期干物质含量显著相关联的snp分子标记，该分子标记检测准确高效、扩增方便稳定，可用于分子标记辅助选择，提高不同大麦品种的鉴定效率。
本文档来自技高网...【技术保护点】
1.一种与大麦苗期干物质积累能力相关的SNP分子标记，其特征在于，所述分子标记所在核苷酸序列如SEQ ID No.3所示的片段，SEQ ID No.3所示的片段的327bp处为C时为优势性状。
2.权利要求1所述基因在利用SNP分子标记检测大麦苗期干物质积累能力中的应用。
3.根据权利要求2所述应用，其特征在于，所述大麦苗期干物质积累能力的表征，包括大麦苗期地上部分干物质重量。
4.一组大麦苗期干物质积累能力的SNP分子标记检测引物对，其特征在于，所述引物对扩增权利要求1所述分子标记。
5.根据权利要求4所述SNP分子标记检测引物对，其特征在于，包括核苷酸序列如SEQID No.1所示的上游引物和SEQ ID No.2所示的下游引物。
6.权利要求1所述分子标记或权利要求4或5所述SNP分子标记检测引物对在分子标记辅助育种中的应用。
7.权利要求1所述分子标记或权利要求4或5所述SNP分子标记检测引物对在筛选大麦苗期干物质积累能力强的大麦种质中的应用。
8.一种筛选大麦苗期干物质积累能力强的大麦种
9.根据权利要求8所述方法，其特征在于，所述PCR扩增体系以50μL计，包括：2×PhantaMax Master Mix 25μL、10μmol/L上游引物和下游引物各2μL、模板5μL和余量的无菌水。
10.根据权利要求8或9所述方法，其特征在于，所述PCR扩增反应的程序包括：95℃预变性3min；95℃变性15s，58℃退火15s，72℃延伸15s，35个循环；72℃延伸5min，12℃保存。
...【技术特征摘要】
1.一种与大麦苗期干物质积累能力相关的snp分子标记，其特征在于，所述分子标记所在核苷酸序列如seq id no.3所示的片段，seq id no.3所示的片段的327bp处为c时为优势性状。
2.权利要求1所述基因在利用snp分子标记检测大麦苗期干物质积累能力中的应用。
3.根据权利要求2所述应用，其特征在于，所述大麦苗期干物质积累能力的表征，包括大麦苗期地上部分干物质重量。
4.一组大麦苗期干物质积累能力的snp分子标记检测引物对，其特征在于，所述引物对扩增权利要求1所述分子标记。
5.根据权利要求4所述snp分子标记检测引物对，其特征在于，包括核苷酸序列如seqid no.1所示的上游引物和seq id no.2所示的下游引物。
6.权利要求1所述分子标记或权利要求4或5所述snp分子标记检测引物对在分子标记辅助育种中的应用。
7.权利要求1所述分子标记或权...
【专利技术属性】
技术研发人员：叶玲珍，鲁向前，郑楠楠，赵俊恒，付玉洁，张国平，
申请(专利权)人：浙江大学中原研究院，
类型：发明
国别省市：
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