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【技术实现步骤摘要】
本申请涉及液路系统的,尤其涉及一种确定流体用量及试剂交换的方法、装置、设备和存储介质。
技术介绍
1、由于管内存在泊肃叶流动,不同组分、浓度的试剂在管路中流动时存在组分扩散现象,因此需要通入适量或过量冲洗试剂以确保流体通道冲洗干净或流体通道内试剂替换干净。
2、流体试剂的替换比即试剂使用容量的研究目的在于用最小的试剂消耗量完成不同试剂的冲洗和替换,是测序仪流体系统的重要参数之一,对流体试剂的整体消耗量至关重要,直接影响着每次运行的测序成本。
3、现有技术对于试剂的使用量仅仅是根据经验,采用宁可多不能少的使用原则,导致试剂过度浪费,增加测序成本。再者,如果使用试剂过少,则会导致冲洗或替换不干净,严重影响测序结果。因此,合理规划试剂使用量是急需解决的问题。
技术实现思路
1、本申请的主要目的在于提供一种确定流体用量及试剂交换的方法、装置、设备和存储介质,可以解决现有技术中无法精准确定冲洗试剂的使用容量导致冲洗试剂过少冲洗不干净或冲洗试剂过多造成试剂浪费、增加测序成本的问题。
2、为实现上述目的,本申请第一方面提供一种确定液路系统中流体用量的方法,该方法包括:
3、往流体通道内通入无荧光标记的第一流体,并获取流体通道内指定位置处的第一荧光参数值;
4、往流体通道内通入带有荧光标记的第二流体以使第二流体替换第一流体,并获取流体通道内指定位置处的第二荧光参数值;
5、往流体通道内通入设定体积且无荧光标记的第三流体以使第三
6、基于第一荧光参数值、第二荧光参数值和第三荧光参数值确定第二流体在流体通道内的残留比;
7、改变通入流体通道内的第三流体的设定体积,重复上述步骤,直至获取到所有设定体积下的残留比;
8、基于目标残留比确定目标设定体积。
9、为实现上述目的,本申请第二方面提供一种试剂交换方法,该方法包括:
10、使用目标设定体积的第四流体冲洗残留有第五流体的流体通道,使第五流体在流体通道内的残留比不超过允许残留比阈值;
11、其中,目标设定体积是根据上述的确定液路系统中流体用量的方法确定的。
12、为实现上述目的,本申请第三方面提供一种确定液路系统中流体用量的装置,该装置包括:
13、第一试剂交换模块,用于往流体通道内通入无荧光标记的第一流体,并获取流体通道内指定位置处的第一荧光参数值;
14、第二试剂交换模块,用于往流体通道内通入带有荧光标记的第二流体以使第二流体替换第一流体,并获取流体通道内指定位置处的第二荧光参数值;
15、第三试剂交换模块,用于往流体通道内通入设定体积且无荧光标记的第三流体以使第三流体替换第二流体,并获取流体通道内指定位置处的第三荧光参数值;
16、计算模块,用于基于第一荧光参数值、第二荧光参数值和第三荧光参数值确定第二流体在流体通道内的残留比;
17、循环模块,用于改变通入流体通道内的第三流体的设定体积,重复上述步骤,直至获取到所有设定体积下的残留比;
18、流体用量确定模块,用于基于目标残留比确定目标设定体积。
19、为实现上述目的,本申请第四方面提供一种试剂交换装置,该装置包括:
20、试剂交换模块,用于使用目标设定体积的第四流体冲洗残留有第五流体的流体通道,使第五流体在流体通道内的残留比不超过允许残留比;
21、其中,目标设定体积是根据上述的确定液路系统中流体用量的装置确定的。
22、为实现上述目的,本申请第五方面提供一种计算机可读存储介质,存储有计算机程序,计算机程序被处理器执行时,使得处理器执行以下步骤:
23、往流体通道内通入无荧光标记的第一流体,并获取流体通道内指定位置处的第一荧光参数值;
24、往流体通道内通入带有荧光标记的第二流体以使第二流体替换第一流体,并获取流体通道内指定位置处的第二荧光参数值;
25、往流体通道内通入设定体积且无荧光标记的第三流体以使第三流体替换第二流体,并获取流体通道内指定位置处的第三荧光参数值;
26、基于第一荧光参数值、第二荧光参数值和第三荧光参数值确定第二流体在流体通道内的残留比;
27、改变通入流体通道内的第三流体的设定体积,重复上述步骤,直至获取到所有设定体积下的残留比;
28、基于目标残留比确定目标设定体积;
29、或,使得处理器执行以下步骤:
30、使用目标设定体积的第四流体冲洗残留有第五流体的流体通道,使第五流体在流体通道内的残留比不超过允许残留比阈值;
31、其中,目标设定体积是根据上述的确定液路系统中流体用量的方法确定的。
32、为实现上述目的,本申请第六方面提供一种计算机设备,包括存储器和处理器,存储器存储有计算机程序,计算机程序被处理器执行时,使得处理器执行以下步骤:
33、往流体通道内通入无荧光标记的第一流体,并获取流体通道内指定位置处的第一荧光参数值;
34、往流体通道内通入带有荧光标记的第二流体以使第二流体替换第一流体,并获取流体通道内指定位置处的第二荧光参数值;
35、往流体通道内通入设定体积且无荧光标记的第三流体以使第三流体替换第二流体,并获取流体通道内指定位置处的第三荧光参数值;
36、基于第一荧光参数值、第二荧光参数值和第三荧光参数值确定第二流体在流体通道内的残留比;
37、改变通入流体通道内的第三流体的设定体积,重复上述步骤,直至获取到所有设定体积下的残留比;
38、基于目标残留比确定目标设定体积;
39、或,使得处理器执行以下步骤:
40、使用目标设定体积的第四流体冲洗残留有第五流体的流体通道,使第五流体在流体通道内的残留比不超过允许残留比阈值;
41、其中,目标设定体积是根据上述的确定液路系统中流体用量的方法确定的。
42、采用本申请实施例,具有如下有益效果:
43、本申请根据多轮测试得到的残留比和允许残留比得到在设定场景下冲洗试剂的最佳目标使用容量,精准确定冲洗试剂的使用容量,使用合理的试剂消耗量完成试剂冲洗或替换,既能使流体通道冲洗干净或试剂替换完成,又不会造成试剂过度浪费,可有效降低测序成本。
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1.一种确定液路系统中流体用量的方法,其特征在于,所述方法包括:
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,
3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述计算每条所述目标流体通道对应的第一荧光图像的荧光灰度平均值,包括:
4.根据权利要求2或3所述的方法,其特征在于,所述残留比的计算公式如公式(1)所示:
5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述流体通道内指定位置包括所述目标流体通道出口处的目标视野区域;
6.一种试剂交换方法,其特征在于,所述方法包括:
7.一种确定液路系统中流体用量的装置,其特征在于,所述装置包括:
8.一种试剂交换装置,其特征在于,所述装置包括:
9.一种计算机可读存储介质,存储有计算机程序,其特征在于,所述计算机程序被处理器执行时,使得所述处理器执行如权利要求1至5中任一项所述方法的步骤,或,使得所述处理器执行如权利要求6所述方法的步骤。
10.一种计算机设备,包括存储器和处理器,其特征在于,所述存储器存储有计算机程序,所述计算机程序被所述处
...【技术特征摘要】
1.一种确定液路系统中流体用量的方法,其特征在于,所述方法包括:
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,
3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述计算每条所述目标流体通道对应的第一荧光图像的荧光灰度平均值,包括:
4.根据权利要求2或3所述的方法,其特征在于,所述残留比的计算公式如公式(1)所示:
5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述流体通道内指定位置包括所述目标流体通道出口处的目标视野区域;
6.一种试剂交换方法,其特征在于,所述方法包括:
7.一种确定液路系...
【专利技术属性】
技术研发人员:吴平,宋祺,韩维春,
申请(专利权)人:深圳市真迈生物科技有限公司,
类型:发明
国别省市:
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