System.ArgumentOutOfRangeException: 索引和长度必须引用该字符串内的位置。 参数名: length 在 System.String.Substring(Int32 startIndex, Int32 length) 在 zhuanliShow.Bind() 一种确定通道间串扰校正强度的方法、装置及介质制造方法及图纸_技高网

一种确定通道间串扰校正强度的方法、装置及介质制造方法及图纸

技术编号:41298821 阅读:2 留言:0更新日期:2024-05-13 14:46
本申请公开了一种确定通道间串扰校正强度的方法、装置及介质,包括:基于多通道显微成像系统检测进行边合成边测序的多轮反应,使得在每轮反应中产生第一通道信号和第二通道信号,第一核苷酸和第二核苷酸为包含不同类型碱基的核苷酸,第一通道信号的一部分为第二通道串扰有关的噪声;检测每轮反应的第一通道信号和第二通道信号,第一通道信号和第二通道信号均具有强度;利用预定系数和第二通道信号强度对第一通道信号强度进行通道间串扰校正,以确定串扰校正后的第一通道信号强度,其中,预定系数为关联于多通道显微成像的固定系数。本申请能够对通道间串扰进行校正,提升了信号校正和/或碱基识别方法的准确率以及效率。

【技术实现步骤摘要】

本申请涉及数据处理,更具体的说是涉及一种确定通道间串扰校正强度的方法、装置及介质


技术介绍

1、碱基识别(basecalling)通常被应用在测定核酸序列中。具体的,在利用光学成像系统多次对碱基延伸信号进行图像采集、并基于处理这些图像实现核酸测序的平台上,由于光学效应、空间效应或者化学反应如色差、串色(crosstalk)和/或相位失相(phasing)等对图像采集、定位或信号强度的影响,从而难以基于该些图像或图像信号准确地识别碱基。现有的信号校正方法和/或碱基识别方法的准确性、效率等,有待提高。


技术实现思路

1、有鉴于此,本申请提供如下技术方案:

2、一种确定通道间串扰校正强度的方法,包括:

3、基于多通道显微成像系统检测进行边合成边测序的多轮反应,使得在每轮反应中产生第一通道信号和第二通道信号,所述第一通道信号指示该轮反应中第一核苷酸掺入到多个相同多核苷酸分子中的信号,所述第二通道信号指示该轮反应中第二核苷酸掺入到所述多个相同多核苷酸分子中的信号,所述第一核苷酸和所述第二核苷酸为包含不同类型碱基的核苷酸,所述第一通道信号的一部分为第二通道串扰有关的噪声;

4、检测每轮反应的第一通道信号和第二通道信号,所述第一通道信号和所述第二通道信号均具有强度;

5、利用预定系数和第二通道信号强度对第一通道信号强度进行通道间串扰校正,以确定所述串扰校正后的第一通道信号强度,其中,所述预定系数为关联于所述多通道显微成像系统的固定系数。

<p>6、一种确定通道间串扰校正强度的装置,包括:

7、信号获取单元,用于基于多通道显微成像系统检测进行边合成边测序的多轮反应,使得在每轮反应中产生第一通道信号和第二通道信号,所述第一通道信号指示该轮反应中第一核苷酸掺入到多个相同多核苷酸分子中的信号,所述第二通道信号指示该轮反应中第二核苷酸掺入到所述多个相同多核苷酸分子中的信号,所述第一核苷酸和所述第二核苷酸为包含不同类型碱基的核苷酸,所述第一通道信号的一部分为第二通道串扰有关的噪声;

8、信号检测单元,用于检测每轮反应的第一通道信号和第二通道信号,所述第一通道信号和所述第二通道信号均具有强度;

9、校正单元,用于利用预定系数和第二通道信号强度对第一通道信号强度进行通道间串扰校正,以确定所述串扰校正后的第一通道信号强度,其中,所述预定系数为关联于所述多通道显微成像系统的固定系数。

10、一种计算机可读存储介质,所述介质上存储有程序,所述程序能够被处理器执行以实现如上述中任一项所述的确定通道间串扰校正强度的方法。

11、经由上述的技术方案可知,本申请公开了一种确定通道间串扰校正强度的方法及装置,包括:基于多通道显微成像系统检测进行边合成边测序的多轮反应,使得在每轮反应中产生第一通道信号和第二通道信号,第一通道信号指示该轮反应中第一核苷酸掺入到多个相同多核苷酸分子中的信号,第二通道信号指示该轮反应中第二核苷酸掺入到多个核苷酸分子中的信号,第一核苷酸和第二核苷酸为包含不同类型碱基的核苷酸,第一通道信号的一部分为第二通道串扰有关的噪声;检测每轮反应的第一通道信号和第二通道信号,第一通道信号和第二通道信号均具有强度;利用预定系数和第二通道信号强度对第一通道信号强度进行通道间串扰校正,以确定串扰校正后的第一通道信号强度,其中,预定系数为关联于多通道显微成像的固定系数。本申请能够对通道间串扰进行校正,提升了信号校正和/或碱基识别方法的准确率以及效率。

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【技术保护点】

1.一种确定通道间串扰校正强度的方法,其特征在于,包括:

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述利用预定系数和所述第二通道信号强度对所述第一通道信号强度进行通道间串扰校正,以确定所述串扰校正后的第一通道信号强度,包括:

3.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于,在利用预定系数和第二通道信号强度对第一通道信号强度进行通道间串扰校正之后,还包括:

4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,所述方法还包括:

5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,所述第一通道信号和第二通道信号均为荧光信号通道,确定所述预定系数包括:

6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,所述在所述可取值范围内确定能够达到预设校正要求的取值为所述预定系数,包括:

7.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,所述根据所述相位校正后的第一通道信号强度识别该轮反应中掺入到多个相同核苷酸分子的第一核苷酸,包括:

8.一种确定通道间串扰校正强度的装置,其特征在于,包括:

9.根据权利要求8所述的装置,其特征在于,所述校正单元包括:

10.一种计算机可读存储介质,其特征在于,所述介质上存储有程序,所述程序能够被处理器执行以实现权利要求1-7中任一项所述的确定通道间串扰校正强度的方法。

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【技术特征摘要】

1.一种确定通道间串扰校正强度的方法,其特征在于,包括:

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述利用预定系数和所述第二通道信号强度对所述第一通道信号强度进行通道间串扰校正,以确定所述串扰校正后的第一通道信号强度,包括:

3.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于,在利用预定系数和第二通道信号强度对第一通道信号强度进行通道间串扰校正之后,还包括:

4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,所述方法还包括:

5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,所述第一通道信号和第二通道信号均为荧光信号通道,确定所述预定系数包括:

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【专利技术属性】
技术研发人员:李林森周媛
申请(专利权)人:深圳市真迈生物科技有限公司
类型:发明
国别省市:

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