【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于小麦分子遗传育种，具体涉及一种与小麦籽粒蛋白质含量相关的snp分子标记、kasp引物对及其应用。
技术介绍
1、小麦品质相关性状是小麦中的重要营养成分，对人类健康和饮食均衡起着至关重要的作用。蛋白质是小麦籽粒中重要的营养成分，与营养和品质密切相关。研究发现，小麦籽粒蛋白质含量(grain protein content，gpc)、湿面筋含量(wet gluten content，wgc)和沉降值(sedimentation value，sv)等品质相关性状属于数量性状，受多基因控制。不同品种的小麦中蛋白质含量及其各组分的含量也各有不同，一般来说，小麦籽粒蛋白质含量范围为10％-18％【liu j,feng b,xu z,et al.agenome-wide association study ofwheat yield and quality-related traits in southwest china[j].mol breeding,2017,38(1):1-11.】。
2、我国对小麦品质的研究起步较晚，优质强筋、弱筋、高蛋白含量等专用品种仍然较少，小麦品质仍处于中低水平，不能完全满足育种与消费需求。但随着分子生物学、生物技术以及基因组学的快速发展，小麦的基因研究进入了一个快速发展和广泛应用的时代，这得益于小麦高通量分子标记技术和多功能基因组学的革命性进展(mao et al,wheatfunctional genomics research in china:a decade of devel
3、发掘小麦籽粒中蛋白质相关的基因位点并开发相关分子标记，不仅能为深入了解小麦的营养成分特性，为提高小麦品质和人类饮食提供科学依据，同时能够为更深刻地解读小麦籽粒中品质相关性状表达的分子遗传机制提供理论依据，为分子标记用于小麦品种品质改良，帮助选育出专用型的小麦新品种，促进小麦育种和生产等提供理论基础。
技术实现思路
1、为了克服现有技术的不足和缺点，本专利技术的首要目的在于提供一种与小麦籽粒蛋白质含量相关的snp分子标记。
2、本专利技术的另一目的在于提供一种鉴定上述snp分子标记的kasp引物对，该引物对不仅可用于检测小麦籽粒蛋白质含量相关的主效qtl簇c6a.2和tagpc-a1基因的基因型，还可用于检测小麦杂交后代中该位点的基因型，以及应用于小麦育种中对小麦籽粒蛋白质含量相关性状的辅助选择等。
3、本专利技术的再一目的在于提供一种鉴定上述snp分子标记的试剂盒，该试剂盒包含上述kasp引物对。
4、本专利技术的第四个目的在于提供上述snp分子标记、kasp引物对或试剂盒的应用。
5、本专利技术的第五个目的在于提供一种检测或辅助检测小麦籽粒蛋白质含量的主效qtl簇c6a.2、tagpc-a1基因或上述snp分子标记的方法。
6、本专利技术的目的通过下述技术方案实现：
7、一种与小麦籽粒蛋白质含量相关的snp分子标记，其snp位点对应于中国春小麦参考基因组refseq v1.1版本参考序列6a染色体上第77098019bp处g>a突变或6a染色体上第77097875bp处t>g突变；该位点碱基的多态性影响小麦籽粒蛋白质含量；
8、所述的snp分子标记的核苷酸序列优选如下所示(seq id no:1)：
9、aacgcatggtaattgcatacacgggtatgattcatctacatggacctacattgtataacttttttttcgcgaatgaagttttgtgaactactatgttgcagtggtttagttattamttatgtgagtggcccttatgcgccaatcttttatacatagattggaatttatatgctaaatatgtttgaaaattgtgtgttatctccttaatttcacttttcaaaggaaaacttcatcttgacagttatcacatgtataagctttccacggacgcctccctaatcaccgcgctcatgtaa
10、其中，m为g或a，m的不同导致小麦籽粒蛋白质含量的差异；
11、或所述的snp分子标记的核苷酸序列优选如下所示(seq id no:2)：
12、aacgcatggtaattgcatacacgggtatgattcatctacatggacctacattgtataacttttttttcgcgaatgaagttttgtgaactactatgttgcagtggtttagttattaattatgtgagtggcccttatgcgccaatcttttatacatagattggaatttatatgctaaatatgtttgaaaattgtgtgttatctccttaatttcacttttcaaaggaaaacttcatcttgacagttatcacatgtataagctytccacggacgcctccctaatcaccgcgctcatgtaa
13、其中，y为t或g，y的不同导致小麦籽粒蛋白质含量的差异；
14、所述的snp分子标记与小麦籽粒蛋白质含量相关的主效qtl簇c6a.2和tagpc-a1基因紧密连锁；所述的主效qtl簇c6a.2位于小麦6a染色体短臂上，对应于中国春小麦refseqv1.1基因组版本的38.47-82.95mb的物理区间内；
15、一种用于鉴定上述snp分子标记的kasp引物对，包含引物对一和引物对二中的至少一种，其中，引物对一包含引物1、引物2和引物3(用于检测snp位点对应于中国春小麦参考基因组refseq v1.1版本参考序列6a染色体上第77098019bp处g>a突变的分子标记)，其核苷酸序列如下所示：
16、引物1：5’-gcataagggccactcacataac-3’；
17、引物2：5’-gcataagggccactcacataat-3’；
18、引物3：5’-gcatggtaattgcatacacggg-3’；
19、引物对二包含引物4、引物5和引物6(用于检测snp位点对应于中国春小麦参考基因组refseq v1.1版本参考序列6a染色体上第77097875bp处t>g突变的分子标记)，其核苷酸序列如下所示：
20、引物4：5’-tagggaggcgtccgtggaa-3’；
21、引物5：5’-tagggaggcg本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种与小麦籽粒蛋白质含量相关的SNP分子标记，其特征在于其SNP位点对应于中国春小麦参考基因组RefSeq v1.1版本参考序列6A染色体上第77098019bp处G>A突变或6A染色体上第77097875bp处T>G突变；该位点碱基的多态性影响小麦籽粒蛋白质含量。
2.一种用于鉴定权利要求1所述的SNP分子标记的KASP引物对，其特征在于包含引物对一和引物对二中的至少一种，其中，引物对一包含引物1、引物2和引物3，其核苷酸序列如下所示：
3.根据权利要求2所述的KASP引物对，其特征在于：
4.根据权利要求2或3所述的KASP引物对，其特征在于：
5.一种用于鉴定权利要求1所述的SNP分子标记的试剂盒，其特征在于包含权利要求4所述的KASP引物对。
6.一种检测或辅助检测小麦籽粒蛋白质含量相关的主效QTL簇C6A.2、TaGPC-A1基因或权利要求1所述的SNP分子标记的方法，其特征在于包含如下步骤：
7.根据权利要求6所述的方法，其特征在于：
8.根据权利要求6所述的方法，其特
9.根据权利要求6所述的方法，其特征在于：
10.权利要求1所述的SNP分子标记、权利要求2-4任一项所述的KASP引物、权利要求5所述的试剂盒或权利要求6-9任一项所述的方法在以下(A)-(F)任意一种中的应用：
...【技术特征摘要】
1.一种与小麦籽粒蛋白质含量相关的snp分子标记，其特征在于其snp位点对应于中国春小麦参考基因组refseq v1.1版本参考序列6a染色体上第77098019bp处g>a突变或6a染色体上第77097875bp处t>g突变；该位点碱基的多态性影响小麦籽粒蛋白质含量。
2.一种用于鉴定权利要求1所述的snp分子标记的kasp引物对，其特征在于包含引物对一和引物对二中的至少一种，其中，引物对一包含引物1、引物2和引物3，其核苷酸序列如下所示：
3.根据权利要求2所述的kasp引物对，其特征在于：
4.根据权利要求2或3所述的kasp引物对，其特征在于：
5...
【专利技术属性】
技术研发人员：曾占奎，王春平，李家创，张伟，宋俊乔，李琼，
申请(专利权)人：河南科技大学，
类型：发明
国别省市：
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