从头合成的组合核酸文库制造技术

本申请涉及从头合成的组合核酸文库。本文公开了用于生成编码核酸序列预定变体的高度准确的核酸文库的方法。变异程度可以是完全的，从而产生饱和的变体文库，或者变异程度可以是不完全的，从而产生非饱和的变体文库。本文所述的变异核酸文库可被设计用于通过转录或翻译进一步加工。本文所述的变异核酸文库可被设计用来生成变异RNA、DNA和/或蛋白质群体。本文进一步提供了用于鉴定具有增加或降低活性的变异种类的方法，其应用于调节用于治疗或减轻疾病的治疗剂的生物学功能及设计。

【技术实现步骤摘要】

技术介绍

1、合成生物学的基石是设计、构建和测试过程——一个需要dna，以使得便于快速且可行地生成并优化这些定制途径和生物体的迭代过程。在设计阶段，将构成dna的a、c、t和g核苷酸规划成包含感兴趣的基因座或途径的多种基因序列，其中每种序列变体代表将进行测试的特定假设。这些变异基因序列代表序列空间(起源于进化生物学的一个概念)的子集，并且从属于构成基因、基因组、转录物组和蛋白质组的全部序列。

2、通常针对每个设计-构建-测试循环设计许多不同的变体，以实现对序列空间的充分采样并使优化设计的可能性最大化。尽管在概念上很简单，但与常规合成方法的速度、通量和质量相关的工艺瓶颈阻碍了这一循环进展的步伐，从而延长了开发时间。由于极其准确的dna的高成本和当前合成技术的有限通量导致无法充分探索序列空间仍然是限速步骤。

3、从构建阶段开始，有两个过程值得注意：核酸合成和基因合成。以往，通过分子克隆实现不同基因变体的合成。这种方法虽然稳定，但无法放大。早期的化学基因合成工作集中于产生大量具有重叠序列同源性的多核苷酸。随后将这些多核苷酸合并，并经历多本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种合成变异核酸文库的方法，其包括：

2.根据权利要求1所述的方法，其中步骤(d)包括收集至少80％的所述预定序列的结果。

3.根据权利要求1所述的方法，其中步骤(d)包括收集至少90％的所述预定序列的结果。

4.根据权利要求1所述的方法，其中步骤(d)包括收集至少100％的所述预定序列的结果。

5.根据权利要求1所述的方法，其中呈现出预测多样性的至少约70％。

6.根据权利要求1所述的方法，其中呈现出预测多样性的至少约90％。

7.根据权利要求1所述的方法，其中呈现出预测多样性的至少约95％。

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【技术特征摘要】

1.一种合成变异核酸文库的方法，其包括：

2.根据权利要求1所述的方法，其中步骤(d)包括收集至少80％的所述预定序列的结果。

3.根据权利要求1所述的方法，其中步骤(d)包括收集至少90％的所述预定序列的结果。

4.根据权利要求1所述的方法，其中步骤(d)包括收集至少100％的所述预定序列的结果。

5.根据权利要求1所述的方法，其中呈现出预测多样性的至少约70％。

6.根据权利要求1所述的方法，其中呈现出预测多样性的至少约90...

【专利技术属性】
技术研发人员：安东尼·考克斯，陈思远，查尔斯·莱多格，多米尼克·托普帕尼，
申请(专利权)人：特韦斯特生物科学公司，
类型：发明
国别省市：