与连续测序有关的方法和组合物技术

技术编号:43018779 阅读:17 留言:0更新日期:2024-10-18 17:21
本文提供了用于多核苷酸测序的组合物、装置、系统和方法。还提供了包括用于连续测序的表面的装置。本文描述的组合物、装置、系统和方法提供了基于生物分子的信息的改进的存储、密度和检索。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】


技术介绍


技术实现思路

【技术保护点】

1.一种用于多核苷酸测序的方法,包括:

2.根据权利要求1所述的方法,其中步骤c)包括洗涤所述表面。

3.根据权利要求1所述的方法,其中洗涤包括使所述表面与溶剂、热、小分子、核酸或蛋白质中的一种或更多种接触。

4.根据权利要求3所述的方法,其中所述小分子包含被配置成用于与第二部分缀合的第一部分。

5.根据权利要求4所述的方法,其中所述缀合包括亲核体/羰基;叠氮化物/膦;1,4-迈克尔加成、1,3-偶极环加成、反电子需求环加成;烯烃复分解;或交叉偶联反应。

6.根据权利要求3所述的方法,其中所述小分子包括生物素、炔烃、叠氮化物、四...

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】

1.一种用于多核苷酸测序的方法,包括:

2.根据权利要求1所述的方法,其中步骤c)包括洗涤所述表面。

3.根据权利要求1所述的方法,其中洗涤包括使所述表面与溶剂、热、小分子、核酸或蛋白质中的一种或更多种接触。

4.根据权利要求3所述的方法,其中所述小分子包含被配置成用于与第二部分缀合的第一部分。

5.根据权利要求4所述的方法,其中所述缀合包括亲核体/羰基;叠氮化物/膦;1,4-迈克尔加成、1,3-偶极环加成、反电子需求环加成;烯烃复分解;或交叉偶联反应。

6.根据权利要求3所述的方法,其中所述小分子包括生物素、炔烃、叠氮化物、四嗪、烯烃、羰基化合物、迈克尔受体/供体、或抗原。

7.根据权利要求3所述的方法,其中所述溶剂包括有机溶剂。

8.根据权利要求3所述的方法,其中所述有机溶剂包括mecn、甲醇、乙醇、2-丙醇、丙酮、dmf、甲酰胺、thf或dmso。

9.根据权利要求8所述的方法,其中所述有机溶剂是加热的。

10.根据权利要求3所述的方法,其中所述蛋白质包括蛋白酶或核酸酶。

11.根据权利要求10所述的方法,其中所述蛋白酶包括氨肽酶。

12.根据权利要求11所述的方法,其中所述氨肽酶包括蛋白酶k、n-末端氨肽酶、c-末端氨肽酶、胰凝乳蛋白酶、胰蛋白酶、胃蛋白酶或lysc。

13.根据权利要求3所述的方法,其中所述蛋白质包括链霉亲和素。

14.根据权利要求1所述的方法,其中所述聚合酶包括phi29聚合酶或其变体。

15.根据权利要求1所述的方法,其中所述聚合酶在步骤a)中结合至所述表面。

16.根据权利要求1所述的方法,其中所述聚合酶在步骤a)中不结合至所述表面。

17.根据权利要求1所述的方法,其中所述多于一个多核苷酸包含至少100,000个独特多核苷酸。

18.根据权利要求1所述的方法,其中所述多于一个多核苷酸的长度为50-30,000个碱基。

19.根据权利要求1所述的方法,其中检测包括使用独特波长、荧光寿命或者电流或电压的变化来鉴定碱基。

20.根据权利要求1所述的方法,其中检测包括合成测序和纳米孔检测中的一种或更多种。

21.根据权利要求1所述的方法,其中检测包括fret。

22.根据权利要求1所述的方法,其中检测包括使所述三元复合物与至少一种核苷酸接触。

23.根据权利要求22所述的方法,其中所述核苷酸包含标记物。

24.根据权利要求23所述的方法,其中所述标记物包括发光标记物。

25.根据权利要求24所述的方法,其中所述发光标记物是染料。

26.根据权利要求1所述的方法,其中所述聚合酶被附接至量子点。

27.根据权利要求1所述的方法,其中所述多于一个多核苷酸在步骤a)中结合至所述表面。

28.根据权利要求1所述的方法,其中检测包括用电磁能量激发。

29.根据权利要求28所述的方法,其中检测包括用激光激发。

30.根据权利要求29所述的方法,其中所述激光是脉冲的。

31.根据权利要求1所述的方法,其中所述多于一个多核苷酸包含发夹衔接子。

32.根据权利要求1所述的方法,其中所述多于一个多核苷酸是环状的。

33.根据权利要求1所述的方法,其中步骤a)-步骤c)被重复至少三次。

34.根据权利要求1所述的方法,其中步骤a)-步骤c)被重复至少20次。

35.根据权利要求1所述的方法,其中步骤a)-步骤c)在不多于10min内发生。

36.根据权利要求1所述的方法,其中步骤c)在不多于5min内发生。

37.一种用于多核苷酸测序的方法,包括:

38.根据权利要求37所述的方法,其中至少1吉字节的测序数据在不多于1...

【专利技术属性】
技术研发人员:杰里米·拉奇威廉·巴尼亚伊
申请(专利权)人:特韦斯特生物科学公司
类型:发明
国别省市:

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