【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于分子遗传学，具体涉及一种小麦湿面筋含量主效qtlqwgc.cau-2d的kasp分子标记及其应用。
技术介绍
1、小麦不仅是面包、面条和糕点等主要食品的原材料，在工业上还用于制作饲料、酿造啤酒和生产酒精等。其特有的面筋组分赋予了它在食品加工中的独特地位。面筋是由醇溶蛋白和谷蛋白组成的蛋白质网络，具有出色的黏弹性，这种特性使小麦成为了制作多样面制食品的理想原料。
2、小麦面筋的含量和质量是评估小麦粉品质的关键指标之一，对于面团的加工性能以及蒸煮和焙烤食品的品质至关重要。不同食品对面筋强度的要求不同，如低筋面粉适合制作饼干和糕点，中强筋面粉适合制作馒头和面条，而高筋面粉适合制作优质面包。因此，小麦面筋含量相关的研究对于了解小麦面筋的遗传规律至关重要，不仅对粮食领域具有重要价值，还对整个食品产业和国家经济有着深远的积极影响，具备广阔的研究前景。
3、全基因组关联分析是一种新兴的研究方法，用于探索小麦湿面筋含量的遗传基础。与传统的qtl分析方法不同，它的优势在于构建多样性广泛的关联群体，这使得可以包括不同地区和生态条件下的小麦品种，更全面地捕捉湿面筋含量的遗传多样性。此外，关联群体的小麦材料相对稳定，可以在多年和多地的条件下进行目标性状的测定，这有助于提高研究的可重复性和可靠性。因此，从全基因组关联分析中鉴定到的显著相关位点和基因更具有广泛适用性和稳定性，可用于小麦品种的改良和选育。最后，全基因组关联分析依赖于高密度的snp标记，这些标记在小麦及其近缘种的全基因组序列逐渐完善的基础上得以发展，提供更
技术实现思路
1、本专利技术所要解决的技术问题在于针对上述现有技术的不足，提供一种小麦湿面筋含量主效qtl qwgc.cau-2d的kasp分子标记及其应用。本专利技术是以济麦22，良星99，良星66，师栾02-1和太古核不育系为亲本构建的189个品系构成的关联群体作为遗传群体，通过小麦55k基因芯片与小麦面粉湿面筋含量进行全基因组关联分析，寻找与小麦湿面筋含量稳定相关的位点和基因，开发了小麦湿面筋含量主效qtl的kasp分子标记；利用该分子标记可以进行辅助选择育种，快速筛选出湿面筋含量高的小麦品系，从而加速小麦高产育种分子进程。
2、为解决上述技术问题，本专利技术采用的技术方案是：一种小麦湿面筋含量的主效qtl紧密连锁的snp标记，所述主效qtl为qwgc.cau-2d；所述snp标记为ax-108822109，位于小麦2ds染色体3,533,015bp处，核苷酸序列如seq id no.1所示；
3、在snp标记序列的第36位碱基处存在一个g/t等位基因突变的多态性位点，
4、当第36位碱基为t时，ax-108822109基因型为tt，核苷酸序列如seq id no.2所示，小麦籽粒性状表现为高湿面筋含量；
5、当第36位碱基为g时，ax-108822109基因型为gg，核苷酸序列如seq id no.3所示，小麦籽粒性状表现为低湿面筋含量。
6、根据所述的小麦湿面筋含量主效qtl qwgc.cau-2d紧密连锁标记开发的kasp分子标记，所述kasp分子标记为kaspwgc.cau-2d，对应物理位置为2d：3533015，连锁区间为iwgscv1.0_chr2d:1,643,964-6,115,557bp；所述kasp分子标记的引物序列为：
7、正向引物1的核苷酸序列如seq id no.4所示；
8、正向引物2的核苷酸序列如seq id no.5所示；
9、反向引物的核苷酸序列如seq id no.6所示。
10、本专利技术还提供了一种利用所述kasp分子标记进行小麦湿面筋含量主效qtl的基因分型方法，该方法为：
11、提取小麦基因组dna，用包含序列seq id no.4-6所示的kasp分子标记引物工作液对小麦基因组dna进行pcr扩增；
12、所述kasp分子标记引物工作液由正向引物1、正向引物2、反向引物和无菌水组成；其中，所述正向引物1的浓度为12μmol/ml，所述正向引物2的浓度为12μmol/ml，所述反向引物浓度为30μmol/ml；
13、所述pcr扩增反应体系为：dna 50-100ng，kasp分子标记引物工作液0.1μl，higeno2×probe mix 4.0μl，无菌水补至8μl；
14、所述pcr反应程序为：95℃预变性10min；95℃变性20s，61-55℃退火/延伸40s，其中，61-55℃梯度pcr，每循环降低-0.6℃，共10个循环；95℃变性20s，55℃退火/延伸40s，共28～34个循环；12℃保存。
15、本专利技术还提供了一种所述kasp分子标记的应用，所述kasp分子标记可以用于选育或筛选湿面筋含量高、低的小麦单株或株系或品系或品种、鉴定或辅助鉴定小麦籽粒湿面筋含量或比较待测小麦籽粒湿面筋含量高低。
16、本专利技术还提供了一种小麦湿面筋含量检测试剂盒，所述试剂盒包括所述小麦湿面筋含量主效qtl qwgc.cau-2d的kasp分子标记。
17、本专利技术与现有技术相比具有以下优点：
18、1、本专利技术用189个小麦品系构成的关联群体，通过全基因组关联分析，挖掘出一个与小麦湿面筋含量相关的主效qtl qwgc.cau.2d，其紧密连锁的snp标记为ax-108822109，该snp标记位于2ds染色体上3,533,015bp处；针对该标记开发了kasp分子标记为kaspwgc.cau-2d，对应物理位置为2d:3533015，连锁区间为iwgscv1.0_chr2d:1,643,964-6,115,557bp。在该标记的第36位碱基处存在一个g/t等位基因突变的多态性位点，对该位点的多态性基因分型分析表明，当小麦材料中ax-108822109基因型为tt时，小麦面粉的湿面筋含量高；基因型为gg时，小麦面粉的湿面筋含量低。
19、2、相对于现有技术而言，本专利技术利用全基因组关联分析方法获得了一种小麦湿面筋含量主效qtl qwgc.cau-2d的kasp分子标记，比之前的qtl分析更具广泛适用性，可以跨越不同环境条件研究小麦品种。该标记可以用于鉴定各种小麦材料，包括地方品种、历史栽培种、现代栽培种和育种骨干亲本等；特别是在小麦育种领域，该标记的应用可以有效筛选和鉴定与湿面筋含量相关的特征，从而为改善小麦加工品质和培育高品质小麦新品种提供了新的资源和工具。这一发现有望在小麦品种改良方面发挥重要作用，进一步提高小麦的质量和适应性，满足不断变化的市场需求和国家粮食安全要求。
20、下面结合附图和实施例对本专利技术作进一步详细说明。
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1.一种小麦湿面筋含量的主效QTL紧密连锁的SNP标记，其特征在于，所述主效QTL为QWgc.cau-2D；所述SNP标记为AX-108822109，位于小麦2DS染色体3,533,015bp处，核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示；
2.根据权利要求1所述的小麦湿面筋含量主效QTL QWgc.cau-2D紧密连锁标记开发的KASP分子标记，其特征在于，所述KASP分子标记为KASPWgc.cau-2D，对应物理位置为2D：3533015，连锁区间为IWGSCv1.0_chr2D:1,643,964-6,115,557bp；所述KASP分子标记的引物序列为：
3.一种利用权利要求2所述的KASP分子标记进行小麦湿面筋含量主效QTL的基因分型方法，其特征在于，该方法为：
4.权利要求2～3任一权利要求所述KASP分子标记在辅助育种方面的应用。
5.根据权利要求4所述的应用，其特征在于，所述应用包括选育或筛选湿面筋含量高、低的小麦单株或株系或品系或品种。
6.权利要求2～3任一权利要求所述KASP分子标记在鉴定或辅助鉴定小
7.权利要求2～3任一权利要求所述KASP分子标记在比较待测小麦籽粒湿面筋含量高低中的应用。
8.一种小麦湿面筋含量检测试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包括权利要求2所述小麦湿面筋含量主效QTL QWgc.cau-2D的KASP分子标记。
...【技术特征摘要】
1.一种小麦湿面筋含量的主效qtl紧密连锁的snp标记，其特征在于，所述主效qtl为qwgc.cau-2d；所述snp标记为ax-108822109，位于小麦2ds染色体3,533,015bp处，核苷酸序列如seq id no.1所示；
2.根据权利要求1所述的小麦湿面筋含量主效qtl qwgc.cau-2d紧密连锁标记开发的kasp分子标记，其特征在于，所述kasp分子标记为kaspwgc.cau-2d，对应物理位置为2d：3533015，连锁区间为iwgscv1.0_chr2d:1,643,964-6,115,557bp；所述kasp分子标记的引物序列为：
3.一种利用权利要求2所述的kasp分子标记进行小...
【专利技术属性】
技术研发人员：宿振起，刘继鲁，韩东，袁玥，贺茜，倪中福，孙其信，
申请(专利权)人：中国农业大学，
类型：发明
国别省市：
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