一种通过DNA甲基化来进行肝癌早筛的方法技术

技术编号:41011611 阅读:39 留言:0更新日期:2024-04-18 21:47
本发明专利技术属于肝癌早筛技术领域,本发明专利技术提供了一种通过DNA甲基化来进行肝癌早筛的方法,包括:采集受检者的血液样本,通过血液样本提取受检者的DNA,对受检者的DNA进行甲基化检测,获得甲基化水平数据,计算水平参数,将水平参数进行数据处理获得概率参数,确定受检者患上早期肝癌的疑似程度,将受检者甲基化检测后的DNA与肝癌患者甲基化检测后的DNA进行比对,获得两组DNA之间的差异数据,基于差异数据计算风险参数,基于风险参数与风险参数阈值进行比较,判定受检者是否患上早期肝癌,从而实现了更加客观地评估患者患肝癌的风险,减少主观判断的误差,提高了诊断的准确性。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于肝癌早筛,具体地说是一种通过dna甲基化来进行肝癌早筛的方法。


技术介绍

1、肝癌是一种常见的恶性肿瘤,早期发现和治疗对于提高治愈率和生存率至关重要。然而,现有的肝癌筛查方法如超声、ct等存在灵敏度不高、特异性不强等问题。因此,开发一种新型的肝癌早筛方法具有重要的临床意义。

2、公告号为cn115287353b的一项中国专利申请公开了一种肝癌血浆游离dna来源的甲基化标志物及用途,包括:通过肝癌血浆cfdna来研究肝癌和健康人的甲基化差异,并筛选出具有明显差异的甲基化区域,然后通过随机森林的方法,首次筛选出10个最佳的差异性甲基化区域(differentiallymethylatedregion,dmr)建立肝癌甲基化风险预测模型,适用于预测早期肝癌发生的风险评估,适用于肝癌的筛查与诊断,用于筛查肝癌人群。

3、现有技术中只对肝癌进行早筛以及进行风险预测,缺少对肝癌风险进行多次判定达到对肝癌进行多次早筛的效果,一方面提高了对肝癌早筛的精准度,另一方面,进行初步早筛可以对没有患肝癌的患者或所患肝癌风险极低的患者进行筛除,本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种通过DNA甲基化来进行肝癌早筛的方法,其特征在于:包括:

2.根据权利要求1所述的一种通过DNA甲基化来进行肝癌早筛的方法,其特征在于:所述甲基化水平数据包括:单个位点的甲基化水平以及DNA基因组上的位点数量;

3.根据权利要求2所述的一种通过DNA甲基化来进行肝癌早筛的方法,其特征在于:将所述DNA基因组划分为若干个面积相同的区域,计算每个区域的甲基化水平,其中,每个区域的甲基化水平为该区域包含的所有甲基化C位点的甲基化水平之和;

4.根据权利要求1所述的一种通过DNA甲基化来进行肝癌早筛的方法,其特征在于:获得所述水平参数的过程为:将获得的...

【技术特征摘要】

1.一种通过dna甲基化来进行肝癌早筛的方法,其特征在于:包括:

2.根据权利要求1所述的一种通过dna甲基化来进行肝癌早筛的方法,其特征在于:所述甲基化水平数据包括:单个位点的甲基化水平以及dna基因组上的位点数量;

3.根据权利要求2所述的一种通过dna甲基化来进行肝癌早筛的方法,其特征在于:将所述dna基因组划分为若干个面积相同的区域,计算每个区域的甲基化水平,其中,每个区域的甲基化水平为该区域包含的所有甲基化c位点的甲基化水平之和;

4.根据权利要求1所述的一种通过dna甲基化来进行肝癌早筛的方法,其特征在于:获得所述水平参数的过程为:将获得的区域甲基化水平参数ci和dna基因组整体甲基化水平di进行数据处理,通过代入公式:获得水平参数ei,其中,ln(ci+di)为底数e的对数函数,且ci+di>0,γ为预设自然常数,γ>0。

5.根据权利要求1所述的一种通过dna甲基化来进行肝癌早筛的方法,其特征在于:获得所述概率参数的过程为:将获得的水平参数ei与甲基化c位点所占比例bi进行量化处理,取其值代入公式:获得概率参数fi。

6.根据权利要求5所述的一种通过dna甲基化来进...

【专利技术属性】
技术研发人员:徐妍刘玉强张琛祺苏甜甜
申请(专利权)人:中源协和基因科技有限公司
类型:发明
国别省市:

网友询问留言 已有0条评论
  • 还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。

1