【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于肝癌早筛,具体地说是一种通过dna甲基化来进行肝癌早筛的方法。
技术介绍
1、肝癌是一种常见的恶性肿瘤,早期发现和治疗对于提高治愈率和生存率至关重要。然而,现有的肝癌筛查方法如超声、ct等存在灵敏度不高、特异性不强等问题。因此,开发一种新型的肝癌早筛方法具有重要的临床意义。
2、公告号为cn115287353b的一项中国专利申请公开了一种肝癌血浆游离dna来源的甲基化标志物及用途,包括:通过肝癌血浆cfdna来研究肝癌和健康人的甲基化差异,并筛选出具有明显差异的甲基化区域,然后通过随机森林的方法,首次筛选出10个最佳的差异性甲基化区域(differentiallymethylatedregion,dmr)建立肝癌甲基化风险预测模型,适用于预测早期肝癌发生的风险评估,适用于肝癌的筛查与诊断,用于筛查肝癌人群。
3、现有技术中只对肝癌进行早筛以及进行风险预测,缺少对肝癌风险进行多次判定达到对肝癌进行多次早筛的效果,一方面提高了对肝癌早筛的精准度,另一方面,进行初步早筛可以对没有患肝癌的患者或所患肝癌风险
...【技术保护点】
1.一种通过DNA甲基化来进行肝癌早筛的方法,其特征在于:包括:
2.根据权利要求1所述的一种通过DNA甲基化来进行肝癌早筛的方法,其特征在于:所述甲基化水平数据包括:单个位点的甲基化水平以及DNA基因组上的位点数量;
3.根据权利要求2所述的一种通过DNA甲基化来进行肝癌早筛的方法,其特征在于:将所述DNA基因组划分为若干个面积相同的区域,计算每个区域的甲基化水平,其中,每个区域的甲基化水平为该区域包含的所有甲基化C位点的甲基化水平之和;
4.根据权利要求1所述的一种通过DNA甲基化来进行肝癌早筛的方法,其特征在于:获得所述水平参
...【技术特征摘要】
1.一种通过dna甲基化来进行肝癌早筛的方法,其特征在于:包括:
2.根据权利要求1所述的一种通过dna甲基化来进行肝癌早筛的方法,其特征在于:所述甲基化水平数据包括:单个位点的甲基化水平以及dna基因组上的位点数量;
3.根据权利要求2所述的一种通过dna甲基化来进行肝癌早筛的方法,其特征在于:将所述dna基因组划分为若干个面积相同的区域,计算每个区域的甲基化水平,其中,每个区域的甲基化水平为该区域包含的所有甲基化c位点的甲基化水平之和;
4.根据权利要求1所述的一种通过dna甲基化来进行肝癌早筛的方法,其特征在于:获得所述水平参数的过程为:将获得的区域甲基化水平参数ci和dna基因组整体甲基化水平di进行数据处理,通过代入公式:获得水平参数ei,其中,ln(ci+di)为底数e的对数函数,且ci+di>0,γ为预设自然常数,γ>0。
5.根据权利要求1所述的一种通过dna甲基化来进行肝癌早筛的方法,其特征在于:获得所述概率参数的过程为:将获得的水平参数ei与甲基化c位点所占比例bi进行量化处理,取其值代入公式:获得概率参数fi。
6.根据权利要求5所述的一种通过dna甲基化来进...
【专利技术属性】
技术研发人员:徐妍,刘玉强,张琛祺,苏甜甜,
申请(专利权)人:中源协和基因科技有限公司,
类型:发明
国别省市:
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